[發明專利]一種靶向藥阿帕替尼有效性的方法及試劑盒在審
| 申請號： | 202011233645.1 | 申請日： | 2020-11-06 |
| 公開（公告）號： | CN112280863A | 公開（公告）日： | 2021-01-29 |
| 發明（設計）人： | 鄭暉;謝劍邦;朱燕萍 | 申請（專利權）人： | 南京普恩瑞生物科技有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6886 | 分類號： | C12Q1/6886;C12N15/11;G16B20/30;G16B30/00;G16B5/00 |
| 代理公司： | 北京市蘭臺律師事務所 11354 | 代理人： | 張峰 |
| 地址： | 210000 江蘇省南京市江*** | 國省代碼： | 江蘇;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 靶向 藥阿帕替尼 有效性 方法 試劑盒 | ||
1.一種靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，步驟如下：
步驟1：準備靶向藥阿帕替尼的藥效樣品；
步驟2：對步驟1的藥效樣品進行DNA分子標記，記錄分子標記位點的信息；
步驟3：將DNA分子標記位點信息作為自變量，將靶向藥阿帕替尼的藥效信息作為因變量，建立多元線性回歸數學模型；
步驟4：根據多元線性回歸數學模型，計算靶向藥阿帕替尼藥效的有效變量的相關系數；
步驟5：步驟4獲得有效變量的相關系數即為靶向藥阿帕替尼藥效相關的DNA分子標記的權重系數，根據權重系數確定靶向藥阿帕替尼有效性。
2.根據權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，步驟2中標記物及位點信息如下：
3.根據權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步驟2中，DNA分子標記為SNP標記。
4.根據權利要求3所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步驟2中，候選SNP標記的個數為1×105-9×105個。
5.根據權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述步驟3中，多元線性回歸數學模型為Lasso和彈性網絡正則化的廣義線性模型。
6.根據權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于：所述FOLFOX方案藥效樣品的數量至少為50個，使用靶向藥阿帕替尼無效的樣品的數量至少為樣本總數量的20％，有效的樣品的數量至少為樣本總數量的20％。
7.根據權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法，其特征在于，所述步驟5中DNA分子標記的權重系數獲得方式如下：
(a)將已知FOLFOX藥物藥效樣品定義為Nj，j為樣品數量；
(b)將藥效樣品中候選的DNA分子標記定義為Pi的基因型，i為候選的DNA分子標記的數量；
(c)為Nj在DNA分子標記Pi處的表型賦值Ak，k＝1、2或3，表型為野生純合型賦值A1，表型為雜合型賦值A2，表型為變異純合型賦值A3；A1、A2和A3互不相同；建立P×N階矩陣，定義為輸入文件X；
(d)根據靶向藥阿帕替尼的藥效信息建立1×N階矩陣,以定義為輸入文件Y：
(e)以X作為自變量，以Y作為因變量，用基于Lasso和彈性網絡正則化的廣義線性模型的算法，計算出有效變量和有效變量的相關系數；有效變量的相關系數即為靶向藥阿帕替尼相關的DNA分子標記的權重系數。
8.一種基于權利要求1所述的靶向藥阿帕替尼有效性的方法的試劑盒，其特征在于：所述試劑盒包括用于靶向藥阿帕替尼藥效檢測的相關的DNA分子標記的成套引物。
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