[發(fā)明專利]一種基于sirt3基因與結(jié)核病易感性相關(guān)的SNP標(biāo)志物、檢測試劑、試劑盒及應(yīng)用

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• 申請?zhí)枺?/td>: 202011232585.1
• 申請日: 2020-11-06
• 公開（公告）號: CN112143802A
• 公開（公告）日: 2020-12-29
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 吳濤;應(yīng)斌武;戴仲秋
• 申請（專利權(quán)）人: 四川大學(xué)華西醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 成都科海專利事務(wù)有限責(zé)任公司 51202
• 代理人: 李俊

本發(fā)明提供了一種基于sirt3基因與結(jié)核病易感性相關(guān)的SNP標(biāo)志物、檢測方法、檢測試劑、試劑盒及應(yīng)用，涉及生物分子學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。所述SNP標(biāo)志物為sirt3基因的SNP位點，所述sirt3基因的SNP位點包括rs511744、rs3782118、rs7104764、rs536715和rs28365927中的一個或多個。涉及技術(shù)領(lǐng)域。本發(fā)明通過檢測上述位點的基因型，預(yù)測患者的結(jié)核病發(fā)病風(fēng)險，如果預(yù)測結(jié)果顯示風(fēng)險較高，則可以提前進(jìn)行預(yù)防或治療；如果預(yù)測結(jié)果顯示風(fēng)險較低，則可繼續(xù)密切隨訪。為早期預(yù)防、個體化治療和我國結(jié)核病感染的基因防治工作提供一定的指導(dǎo)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域，尤其是涉及一種基于sirt3基因與結(jié)核病易感性相關(guān)的SNP標(biāo)志物、檢測試劑、試劑盒及應(yīng)用。

背景技術(shù)

結(jié)核病(TB)是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)感染引起并經(jīng)呼吸道傳播的一種威脅全球人群健康的重大傳染病。根據(jù)世界衛(wèi)生組織(WHO)報道，中國是全球第二大結(jié)核發(fā)病國家，也是22個結(jié)核高負(fù)擔(dān)國家之一。近年來，由于人類免疫缺陷病毒(Human Immunodeficiency Virus,HIV)流行、藥物濫用導(dǎo)致耐藥MTB的出現(xiàn)，世界范圍的結(jié)核病又死灰復(fù)燃。2019年約有120萬HIV陰性者和25.1萬HIV陽性者死于結(jié)核病。結(jié)核病占我國2017年法定傳染病發(fā)病數(shù)第二位，死亡率第二位，結(jié)核病的預(yù)防和診療形勢仍然十分嚴(yán)峻。然而，低下的檢出率仍然是結(jié)核病精準(zhǔn)防治的主要障礙之一。最近研究表明，明確診斷的活動性結(jié)核病病例僅占結(jié)核分枝桿菌感染人口的5-15％，大多數(shù)感染者能夠控制甚至清除體內(nèi)的結(jié)核分枝桿菌，可見結(jié)核分枝桿菌感染過程中，宿主的遺傳易感性是宿主感染MTB后是否發(fā)展為活動性結(jié)核病的關(guān)鍵因素。因此，亟需發(fā)現(xiàn)一種結(jié)核病相關(guān)的易感基因用于高危易感人群的早期篩查、結(jié)核病的有效預(yù)防和早期治療以遏制結(jié)核病的流行。

個體遺傳背景的不同是導(dǎo)致疾病易感性差異的關(guān)鍵因素，而其中單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)標(biāo)志物是目前基因組學(xué)中最主要的分子標(biāo)志物之一。SNPs僅發(fā)生單個核苷酸的變化，其發(fā)揮功能的方式有很多種，如位于編碼區(qū)的SNPs可以通過堿基序列的改變導(dǎo)致蛋白質(zhì)序列發(fā)生改變從而影響蛋白質(zhì)的功能，或者通過改變核糖體通過mRNA特定區(qū)域的速度，進(jìn)而影響翻譯動力學(xué)，最終導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能的改變；位于基因內(nèi)含子的SNPs可以通過影響剪接位點活性發(fā)揮功能；而基因調(diào)控區(qū)的SNPs通常通過影響啟動子或其他轉(zhuǎn)錄因子(TF)來調(diào)節(jié)基因的功能。因此，從SNPs角度發(fā)掘結(jié)核病易感性的分子標(biāo)志物研究具有重要的潛在臨床應(yīng)用價值。

發(fā)明內(nèi)容

本發(fā)明的第一目的在于提供一種基于sirt3基因與結(jié)核病易感性相關(guān)的SNP標(biāo)志物，應(yīng)用于結(jié)核病早期篩查中，通過sirt3基因多態(tài)性的檢測，以預(yù)測結(jié)核病高危易感人群的發(fā)病風(fēng)險，為早期預(yù)防、個體化治療和我國結(jié)核病感染的基因防治工作提供一定的依據(jù)。

本發(fā)明的第二目的是提供一種SNP標(biāo)志物的檢測方法。

本發(fā)明的第三目的是提供一種用于結(jié)核病易感性預(yù)測的檢測試劑。

本發(fā)明的第四目的是提供一種試劑盒。

本發(fā)明的第五目的是提供所述的試劑盒在預(yù)測結(jié)核病易感性產(chǎn)品中的應(yīng)用。

本發(fā)明提供的諸多技術(shù)方案中的優(yōu)選技術(shù)方案所能產(chǎn)生的諸多技術(shù)效果詳見下文闡述。

為實現(xiàn)上述目的，本發(fā)明提供了以下技術(shù)方案：

本發(fā)明提供的一種基于sirt3基因與結(jié)核病易感性相關(guān)的SNP標(biāo)志物，所述SNP標(biāo)志物為sirt3基因的SNP位點，所述sirt3基因的SNP位點包括rs511744、rs3782118、rs7104764、rs536715和rs28365927中的一個或多個。