[發明專利]一種基于sirt3基因與結核病易感性相關的SNP標志物、檢測試劑、試劑盒及應用

在審

• 申請號: 202011232585.1
• 申請日: 2020-11-06
• 公開（公告）號: CN112143802A
• 公開（公告）日: 2020-12-29
• 發明（設計）人: 吳濤;應斌武;戴仲秋
• 申請（專利權）人: 四川大學華西醫院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 成都科海專利事務有限責任公司 51202
• 代理人: 李俊

1.一種基于sirt3基因與結核病易感性相關的SNP標志物，其特征在于，所述SNP標志物為sirt3基因的SNP位點，所述sirt3基因的SNP位點包括rs511744、rs3782118、rs7104764、rs536715和rs28365927中的一個或多個。

2.一種如權利要求1所述的SNP標志物的檢測方法，其特征在于，所述方法包括檢測SNP標志物在如下SNP位點處的基因型：rs511744、rs3782118、rs7104764、rs536715和rs28365927。

3.一種用于結核病易感性預測的檢測試劑，其特征在于，所述檢測試劑用于檢測sirt3基因在以下一個或多個SNP位點的基因型：rs511744、rs3782118、rs7104764、rs536715和rs28365927。

4.根據權利要求3所述的用于結核病的檢測試劑，其特征在于，所述檢測試劑中包括sirt3基因的一個或多個SNP位點的特異性擴增引物和特異性延伸引物。

5.根據權利要求4所述的用于結核病的檢測試劑，其特征在于，所述特異性擴增引物中包括如下SNP位點特異性擴增引物序列中的一種或幾種：

包括SEQ ID NO.1所示的上游引物序列和SEQ ID NO.2所示的下游引物序列的SNP位點rs511744的特異性擴增引物序列；

包括SEQ ID NO.3所示的上游引物序列和SEQ ID NO.4所示的下游引物序列的SNP位點rs3782118的特異性擴增引物序列；

包括SEQ ID NO.5所示的上游引物序列和SEQ ID NO.6所示的下游引物序列的SNP位點rs7104764的特異性擴增引物序列；

包括SEQ ID NO.7所示的上游引物序列和SEQ ID NO.8所示的下游引物序列的SNP位點rs536715的特異性擴增引物序列；以及

包括SEQ ID NO.9所示的上游引物序列和SEQ ID NO.10所示的下游引物序列的SNP位點rs28365927的特異性擴增引物序列。

6.根據權利要求4所述的用于結核病的檢測試劑，其特征在于，所述特異性延伸引物中包括如下SNP位點特異性延伸引物序列中的一種或幾種：

如SEQ ID NO.11所示的SNP位點rs511744的延伸引物序列；

如SEQ ID NO.12所示的SNP位點rs3782118的延伸引物序列；

如SEQ ID NO.13所示的SNP位點rs7104764的延伸引物序列；

如SEQ ID NO.14所示的SNP位點rs536715的延伸引物序列；以及

如SEQ ID NO.15所示的SNP位點rs28365927的延伸引物序列。

7.一種試劑盒，其特征在于，所述試劑盒內含有前述權利要求3至6任一項所述的用于結核病易感性預測的檢測試劑。

8.根據權利要求7所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒內還包括基因組DNA提取試劑、PCR反應緩沖液、DNA聚合酶、dNTPs和單堿基延伸反應試劑。

9.一種如權利要求7或權利要求8所述的試劑盒在預測結核病易感性的產品中的應用。

10.根據權利要求9所述的應用，其特征在于，所述結核病為活動性結核病。