[發明專利]物理嚴格且相空間重疊最大化的相對自由能計算方法有效
| 申請號: | 202011223844.4 | 申請日: | 2020-11-05 |
| 公開(公告)號: | CN112216350B | 公開(公告)日: | 2022-09-13 |
| 發明(設計)人: | 鄒俊杰;馬健;溫書豪;賴力鵬 | 申請(專利權)人: | 深圳晶泰科技有限公司 |
| 主分類號: | G16C10/00 | 分類號: | G16C10/00;G16B15/30 |
| 代理公司: | 深圳市科吉華烽知識產權事務所(普通合伙) 44248 | 代理人: | 胡吉科 |
| 地址: | 518000 廣東省深圳市*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 物理 嚴格 相空間 重疊 最大化 相對 自由能 計算方法 | ||
1.物理嚴格且相空間重疊最大化的相對自由能計算方法,其特征在于,包括以下步驟:
步驟A:將兩個要計算相對自由能的分子即分子X和分子Y,進行npt系綜動力學模擬過程,獲得平衡態的結構;
步驟B:確定X、Y兩個分子中相互對應并要保留的原子,和X要消失、Y要生長的原子;根據規則確定要達到物理嚴格所需去除的X和Y各自的角和二面角,和為最大化相空間重疊所需增加到X和Y上的各自的額外二面角;
步驟C:在X變化到Y的相對自由能計算中,增大lambda值,去除X上要消失的原子與保留的原子之間多余的角和二面角作用;減小lambda值,去除Y上要生長的原子與保留的原子之間多余的角和二面角作用;
同時,增大lambda值,增大額外的二面角作用來固定X上要消失的原子與保留的原子之間的結構;減小lambda值,增大額外的二面角作用來固定Y上要生長的原子與保留的原子之間的結構;
步驟D:在相對自由能計算中,統計去除多余角和二面角,以及增加額外二面角所需的自由能,并將此部分自由能計入到X到Y變化的總自由能中。
2.根據權利要求1所述的物理嚴格且相空間重疊最大化的相對自由能計算方法,其特征在于,步驟C中,用于固定的二面角的平衡值取自步驟A中X和Y各自的平衡后結構。
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