[發明專利]基于數字PCR技術的ATRX和KDM5A突變檢測的試劑盒、裝置及應用

有效

• 申請號: 202011150329.8
• 申請日: 2020-10-23
• 公開（公告）號: CN112111577B
• 公開（公告）日: 2022-09-06
• 發明（設計）人: 王瑩瑩;成崗;楊晶;李東東
• 申請（專利權）人: 北京諾禾致源科技股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12Q1/6851
• 代理公司: 北京康信知識產權代理有限責任公司 11240
• 代理人: 梁文惠

1.一種基于數字PCR技術的ATRX和KDM5A突變檢測的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包括：針對ATRX E10 del、ATRX E11 del、ATRX E9 Ins、ATRX E14 R1426L、ATRX E17M1571V、ATRX E28 E2074G、KDM5A E27 del、KDM5A E23 P1237S、KDM5A E23 R1217W、KDM5AE19 del、KDM5A E10 del和KDM5A E25 del位點的引物和探針；所述引物包括上游引物和下游引物，所述探針包括突變型探針和野生型探針；所述突變型探針和所述野生型探針的5’端均標記有熒光報告基團，3’端均標記有淬滅基團；所述突變型探針的5’端標記的熒光報告基團為FAM，3’端標記的淬滅基團為MGB；所述野生型探針的5’端標記的熒光報告基團為VIC，3’端標記的淬滅基團為MGB；所述ATRX E10 del位點的上游引物如SEQ ID NO：1所示，下游引物如SEQ ID NO：2所示，突變型探針如SEQ ID NO：3所示，野生型探針如SEQ ID NO：4所示；

所述ATRX E11 del位點的上游引物如SEQ ID NO：5所示，下游引物如SEQ ID NO：6所示，突變型探針如SEQ ID NO：7所示，野生型探針如SEQ ID NO：8所示；

所述ATRX E9 Ins位點的上游引物如SEQ ID NO：9所示，下游引物如SEQ ID NO：10所示，突變型探針如SEQ ID NO：11所示，野生型探針如SEQ ID NO：12所示；

所述ATRX E14 R1426L位點的上游引物如SEQ ID NO：13所示，下游引物如SEQ ID NO：14所示，突變型探針如SEQ ID NO：15所示，野生型探針如SEQ ID NO：16所示；

所述ATRX E17 M1571V位點的上游引物如SEQ ID NO：17所示，下游引物如SEQ ID NO：18所示，突變型探針如SEQ ID NO：19所示，野生型探針如SEQ ID NO：20所示；

所述ATRX E28 E2074G位點的上游引物如SEQ ID NO：21所示，下游引物如SEQ ID NO：22所示，突變型探針如SEQ ID NO：23所示，野生型探針如SEQ ID NO：24所示；

所述KDM5A E27 del位點的上游引物如SEQ ID NO：25所示，下游引物如SEQ ID NO：26所示，突變型探針如SEQ ID NO：27所示，野生型探針如SEQ ID NO：28所示；

所述KDM5A E23 P1237S位點的上游引物如SEQ ID NO：29所示，下游引物如SEQ ID NO：30所示，突變型探針如SEQ ID NO：31所示，野生型探針如SEQ ID NO：32所示；

所述KDM5A E23 R1217W位點的上游引物如SEQ ID NO：33所示，下游引物如SEQ ID NO：34所示，突變型探針如SEQ ID NO：35所示，野生型探針如SEQ ID NO：36所示；

所述KDM5A E19 del位點的上游引物如SEQ ID NO：37所示，下游引物如SEQ ID NO：38所示，突變型探針如SEQ ID NO：39所示，野生型探針如SEQ ID NO：40所示；

所述KDM5A E10 del位點的上游引物如SEQ ID NO：41所示，下游引物如SEQ ID NO：42所示，突變型探針如SEQ ID NO：43所示，野生型探針如SEQ ID NO：44所示；

所述KDM5A E25 del位點的上游引物如SEQ ID NO：45所示，下游引物如SEQ ID NO：46所示，突變型探針如SEQ ID NO：47所示，野生型探針如SEQ ID NO：48所示。

2.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒中還包括dNTPs、Taq酶和PCR緩沖液。

3.根據權利要求1所述的試劑盒，其特征在于，針對每個位點的引物和探針預混液裝為1管。