[發明專利]用于青花菜種質資源和品種鑒定的SNP標記組合及應用有效
| 申請號: | 202011134983.X | 申請日: | 2020-10-21 |
| 公開(公告)號: | CN112280881B | 公開(公告)日: | 2023-09-01 |
| 發明(設計)人: | 沈鈺森;王建升;顧宏輝;虞慧芳;趙振卿;盛小光 | 申請(專利權)人: | 浙江省農業科學院 |
| 主分類號: | C12Q1/6895 | 分類號: | C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京眾合誠成知識產權代理有限公司 11246 | 代理人: | 龔燮英 |
| 地址: | 310021 *** | 國省代碼: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 用于 青花菜 種質 資源 品種 鑒定 snp 標記 組合 應用 | ||
1.用于擴增SNP標記的KASP引物組合,其特征在于,包含Bol.ita04和Bol.ita15的引物組合;
。
2.含有權利要求1的KASP引物的檢測試劑、試劑盒或芯片。
3.權利要求1所述KASP引物的以下應用,其特征在于:
用于青花菜雜交種‘綠雄90’品種純度鑒定。
4.如權利要求3所述KASP引物的應用,其特征在于,包括以下步驟:
1)提取待測青花菜基因組DNA;
2)向步驟1)提取的DNA模板中加入特異的KASPPrimermix和通用的KASP?Mastermix,進行PCR擴增;
3)采用熒光檢測儀分析PCR擴增產物。
5.如權利要求4所述的應用,其特征在于,KASPPrimermix中含有三條特異性引物:正向引物1、正向引物2和反向引物,分別對應FAM、Hex和Common;所述KASPMastermix包含如下各組分:通用的FRETcassette熒光引物,ROX內參染料,KlearTaqDNA聚合酶,dNTP和MgCl2;步驟2)中引物F的5’端添加FAM熒光標簽序列5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3’,引物H的5’端添加HEX熒光標簽序列5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3’。
6.如權利要求4所述的應用,其特征在于,PCR的反應體系為:PCR預混液5μL;引物混合液0.14μL;其中各引物的終濃度均為5nM;20ng/μL模板DNA5μL。
7.如權利要求4所述的應用,其特征在于,所述PCR的反應條件為:90-95℃預變性10-20min;第一步擴增反應,90-95℃變性10-30s,61-55℃退火延伸30-90s,每個循環的退火溫度降低0.2-1℃,共10個循環;第二步擴增反應,90-95℃變性10-30s,53-57℃退火延伸30-90s,共20-35個循環。
8.如權利要求7所述的應用,其特征在于,所述PCR的反應條件為:94℃預變性15min;第一步擴增反應,94℃變性20s,61-55℃退火延伸60s,每個循環的退火溫度降低0.6℃,共10個循環;第二步擴增反應,94℃變性20s,55℃退火延伸60s,共26個循環。
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