[發明專利]一種鑒定番茄雜交種純度的SNP位點、引物組及應用

有效

• 申請號: 202011133310.2
• 申請日: 2020-10-21
• 公開（公告）號: CN112195264B
• 公開（公告）日: 2021-06-01
• 發明（設計）人: 溫常龍;張建;楊靜靜;張曉飛;羅江;楊明珠
• 申請（專利權）人: 北京市農林科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京五洲洋和知識產權代理事務所(普通合伙) 11387
• 代理人: 劉春成;榮紅穎

1.一種鑒定番茄雜交種純度的SNP引物組合，所述SNP引物組合用于分別擴增如下由第一SNP位點到第八SNP位點組成的SNP位點組：

第一SNP位點，所述第一SNP位點位于番茄參考基因組第9染色體第146411位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為C或T；

第二SNP位點，所述第二SNP位點位于番茄參考基因組第1染色體第348230位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為A或G；

第三SNP位點，所述第三SNP位點位于番茄參考基因組第6染色體第45112865位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為A或G；

第四SNP位點，所述第四SNP位點位于番茄參考基因組第11染色體第50349769位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為C或T；

第五SNP位點，所述第五SNP位點位于番茄參考基因組第7染色體第2872268位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為A或T；

第六SNP位點，所述第六SNP位點位于番茄參考基因組第2染色體第21501063位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為A或C；

第七SNP位點，所述第七SNP位點位于番茄參考基因組第4染色體第2072712位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為C或T；

第八SNP位點，所述第八SNP位點位于番茄參考基因組第10染色體第8449453位核苷酸，該位點的核苷酸堿基為C或T；

其中，所述番茄參考基因組為番茄Heinz1706參考基因組；

所述SNP引物組合包括：

第一SNP引物組，用于擴增所述第一SNP位點；第二SNP引物組，用于擴增所述第二SNP位點；第三SNP引物組，用于擴增所述第三SNP位點；第四SNP引物組，用于擴增所述第四SNP位點；第五SNP引物組，用于擴增所述第五SNP位點；第六SNP引物組，用于擴增所述第六SNP位點；第七SNP引物組，用于擴增所述第七SNP位點；第八SNP引物組，用于擴增所述第八SNP位點。

2.根據權利要求1所述SNP引物組合，其特征在于：

所述第一SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：25所示；

所述第二SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：26所示；

所述第三SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：27所示；

所述第四SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：28所示；

所述第五SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：29所示；

所述第六SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：30所示；

所述第七SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：31所示；

所述第八SNP位點及其上下游堿基的序列如序列表中的SEQ ID NO：32所示。