[發明專利]一種數據處理方法、裝置、服務器及計算機可讀存儲介質有效
| 申請號: | 202011127700.9 | 申請日: | 2020-10-20 |
| 公開(公告)號: | CN112017731B | 公開(公告)日: | 2021-01-12 |
| 發明(設計)人: | 劉小雙;孫瑜堯;徐銜;徐嘯 | 申請(專利權)人: | 平安科技(深圳)有限公司 |
| 主分類號: | G16B30/00 | 分類號: | G16B30/00 |
| 代理公司: | 廣州三環專利商標代理有限公司 44202 | 代理人: | 熊永強 |
| 地址: | 518000 廣東省深圳市福田區福*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 數據處理 方法 裝置 服務器 計算機 可讀 存儲 介質 | ||
本申請實施例提供了一種數據處理方法、裝置、服務器及計算機可讀存儲介質,應用于醫療科技領域,該方法包括:從獲取到的目標對象的SNP位點集合中確定小于目標閾值的N個目標SNP位點;基于各目標SNP位點的位點信息包括的各目標SNP位點對應的基因型對多個樣本和N個目標SNP位點進行雙向聚類,生成至少一個亞組;基于預設計算規則計算各亞組的敏感度,根據各亞組的敏感度從至少一個亞組中確定目標亞組;基于目標亞組中的部分目標SNP位點的目標位點信息確定與部分目標SNP位點匹配的目標基因;對目標基因添加基因標記,提高對基因解讀效率。本申請涉及區塊鏈領域,如將添加基因標記的目標基因寫入區塊鏈以用于對基因解讀等場景。
技術領域
本申請涉及數據分析領域,可具體應用于醫療科技領域,尤其涉及一種數據處理方法、裝置、服務器及計算機可讀存儲介質。
背景技術
目前,隨著醫療研究技術的發展,對基因的解讀方式也越來越多,在解讀過程中,可以是對單個基因進行解讀,或者是對多個基因進行解讀。例如,在對多基因解讀方面,可以采用多基因風險評估(polygenic risk score,PRS)方法,該方法是基于全基因組關聯研究(Genome-Wide Association Studies,GWAS)數據進行研究,PRS方法可以通過GWAS數據獲取基因相關數據并篩選出多個基因,并將該多個基因的累積效應進行量化,但是利用PRS方法對基因的研究數量無法保證,該PRS方法常常研究數十、數百、數千甚至更多的基因,使得對基因的解讀效率比較低下。
發明內容
本申請實施例提供了一種數據處理方法、裝置、服務器及計算機可讀存儲介質,可以確定出較為關鍵的基因,減少解讀基因的數量,從而提高對基因的解讀效率。
本申請實施例第一方面提供了一種數據處理方法,包括:
獲取針對目標對象的單核苷酸多態性SNP位點集合,并從所述SNP位點集合中確定出小于目標閾值的N個目標SNP位點,所述SNP位點集合包括多個樣本對應的SNP位點,所述多個樣本包括實驗樣本和對比樣本,所述N為大于1的整數;
獲取所述N個目標SNP位點中各目標SNP位點的位點信息,所述位點信息包括所述各目標SNP位點對應的基因型;
基于所述各目標SNP位點對應的基因型對所述多個樣本和所述N個目標SNP位點進行雙向聚類,生成至少一個亞組,任一個亞組包括所述多個樣本中的至少一個樣本,以及所述N個目標SNP位點中的部分目標SNP位點;
基于預設計算規則計算各亞組的敏感度,并根據所述各亞組的敏感度從所述至少一個亞組中確定目標亞組;
獲取所述目標亞組中的所述部分目標SNP位點的目標位點信息,并基于所述目標位點信息確定與所述目標亞組中的部分目標SNP位點匹配的目標基因;
對所述目標基因添加基因標記,所述基因標記用于指示所述目標基因與所述目標對象關聯。
本申請實施例第二方面提供了一種數據處理裝置,包括:
獲取模塊,用于獲取針對目標對象的單核苷酸多態性SNP位點集合,并從所述SNP位點集合中確定出小于目標閾值的N個目標SNP位點,所述SNP位點集合包括多個樣本對應的SNP位點,所述多個樣本包括實驗樣本和對比樣本,所述N為大于1的整數;
所述獲取模塊,還用于獲取所述N個目標SNP位點中各目標SNP位點的位點信息,所述位點信息包括所述各目標SNP位點對應的基因型;
聚類模塊,用于基于所述各目標SNP位點對應的基因型對所述多個樣本和所述N個目標SNP位點進行雙向聚類,生成至少一個亞組,任一個亞組包括所述多個樣本中的至少一個樣本,以及所述N個目標SNP位點中的部分目標SNP位點;
處理模塊,用于基于預設計算規則計算各亞組的敏感度,并根據所述各亞組的敏感度從所述至少一個亞組中確定目標亞組;
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