[發(fā)明專利]一種數(shù)據(jù)處理方法、裝置、服務(wù)器及計(jì)算機(jī)可讀存儲(chǔ)介質(zhì)

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202011127700.9
• 申請(qǐng)日: 2020-10-20
• 公開（公告）號(hào): CN112017731B
• 公開（公告）日: 2021-01-12
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 劉小雙;孫瑜堯;徐銜;徐嘯
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 平安科技（深圳）有限公司
• 主分類號(hào): G16B30/00
• 分類號(hào): G16B30/00
• 代理公司: 廣州三環(huán)專利商標(biāo)代理有限公司 44202
• 代理人: 熊永強(qiáng)

1.一種數(shù)據(jù)處理方法，其特征在于，包括：

獲取針對(duì)目標(biāo)對(duì)象的單核苷酸多態(tài)性SNP位點(diǎn)集合，并從所述SNP位點(diǎn)集合中確定出小于目標(biāo)閾值的N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)，所述SNP位點(diǎn)集合包括多個(gè)樣本對(duì)應(yīng)的SNP位點(diǎn)，所述多個(gè)樣本包括實(shí)驗(yàn)樣本和對(duì)比樣本，所述N為大于1的整數(shù)；

獲取所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)中各目標(biāo)SNP位點(diǎn)的位點(diǎn)信息，所述位點(diǎn)信息包括所述各目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型；

基于所述各目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型對(duì)所述多個(gè)樣本和所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行雙向聚類，生成至少一個(gè)亞組，任一個(gè)亞組包括所述多個(gè)樣本中的至少一個(gè)樣本，以及所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)；

基于預(yù)設(shè)計(jì)算規(guī)則計(jì)算各亞組的敏感度，并根據(jù)所述各亞組的敏感度從所述至少一個(gè)亞組中確定目標(biāo)亞組；其中，任一亞組的敏感度是指：所述任一亞組所包括實(shí)驗(yàn)樣本的數(shù)量與所述多個(gè)樣本所包括實(shí)驗(yàn)樣本的總量之間的比值；

獲取所述目標(biāo)亞組中的所述部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)的目標(biāo)位點(diǎn)信息，并基于所述目標(biāo)位點(diǎn)信息確定與所述目標(biāo)亞組中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)匹配的目標(biāo)基因；

對(duì)所述目標(biāo)基因添加基因標(biāo)記，所述基因標(biāo)記用于指示所述目標(biāo)基因與所述目標(biāo)對(duì)象關(guān)聯(lián)。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述從所述SNP位點(diǎn)集合中確定出小于目標(biāo)閾值的N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)之前，所述方法還包括：

確定多個(gè)假定值的參考閾值；

針對(duì)所述多個(gè)假定值的任一參考閾值，從所述SNP位點(diǎn)集合中獲取小于所述參考閾值的N個(gè)SNP位點(diǎn)；

獲取所述N個(gè)SNP位點(diǎn)中各SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的權(quán)重；

根據(jù)所述N個(gè)SNP位點(diǎn)中的各SNP位點(diǎn)和對(duì)應(yīng)的權(quán)重進(jìn)行加權(quán)求和，得到樣本患目標(biāo)對(duì)象的概率；

根據(jù)所述患目標(biāo)對(duì)象的概率與所述多個(gè)樣本的標(biāo)簽數(shù)值確定可決定系數(shù)R方值，所述多個(gè)樣本中每個(gè)樣本對(duì)應(yīng)一個(gè)標(biāo)簽數(shù)值；

從所述多個(gè)假定值的參考閾值中確定最大的可決定系數(shù)R方值對(duì)應(yīng)的參考閾值，并將所述最大的可決定系數(shù)R方值對(duì)應(yīng)的參考閾值作為目標(biāo)閾值。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述從所述SNP位點(diǎn)集合中獲取小于所述目標(biāo)閾值的N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)之前，所述方法還包括：

確定所述SNP位點(diǎn)集合中的任意兩個(gè)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的第一頻率和第二頻率；

若所述第一頻率大于所述第二頻率，則去除所述任意兩個(gè)SNP位點(diǎn)中的一個(gè)。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述基于所述各目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型對(duì)所述多個(gè)樣本和所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行雙向聚類，生成至少一個(gè)亞組，包括：

根據(jù)所述各目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型將所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行聚類，得到至少一個(gè)聚類集合，各聚類集合包括所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)；

根據(jù)所述各聚類集合包括的所述部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)所述多個(gè)樣本進(jìn)行聚類，確定所述各聚類集合對(duì)應(yīng)的樣本；

根據(jù)所述各聚類集合和所述各聚類集合對(duì)應(yīng)的樣本，生成至少一個(gè)亞組。

5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的方法，其特征在于，所述根據(jù)所述各目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型將所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行聚類，包括：

針對(duì)所述N個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)中任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)，確定所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型；

根據(jù)所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的基因型確定所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)之間的距離；

判斷所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)之間的距離是否滿足預(yù)設(shè)距離條件；

若所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)之間的距離滿足預(yù)設(shè)距離條件，則將所述任意兩個(gè)目標(biāo)SNP位點(diǎn)進(jìn)行聚類。

6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法，其特征在于，所述目標(biāo)位點(diǎn)信息包括位置信息，所述基于所述目標(biāo)位點(diǎn)信息確定與所述目標(biāo)亞組中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)匹配的目標(biāo)基因，包括：

根據(jù)所述位置信息確定與所述目標(biāo)亞組中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)匹配的目標(biāo)基因，所述位置信息用于指示所述目標(biāo)亞組中的部分目標(biāo)SNP位點(diǎn)在對(duì)應(yīng)基因上的位置。