[發(fā)明專利]一種用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組及其應(yīng)用

有效

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• 申請日: 2020-10-12
• 公開（公告）號: CN112266972B
• 公開（公告）日: 2022-07-05
• 發(fā)明（設(shè)計）人: 徐振江;馬強;劉洪;饒得花;江院;陳孟強;唐軒;黃展權(quán);方超;邱友媚
• 申請（專利權(quán)）人: 華南農(nóng)業(yè)大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B25/20;G16B20/30
• 代理公司: 廣州專理知識產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 44493
• 代理人: 張鳳

本發(fā)明屬于分子生物學的技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組及其應(yīng)用。所述SSR分子標記引物組包括24對龍眼SSR引物，所述24對龍眼SSR引物中的正向引物和反向引物的核苷酸序列分別如序列表中SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.48所示。所得SSR引物在龍眼中擴增的帶型清晰容易判讀，同時適合普通變性聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測平臺和毛細管熒光檢測平臺檢測，所述SSR引物的多態(tài)性高且擴增重復性好；本發(fā)明的SSR引物應(yīng)用于龍眼遺傳多樣性分析、品種區(qū)分鑒定、DNA指紋圖譜構(gòu)建等領(lǐng)域，有利于保護育種者、生產(chǎn)者和消費者的合法權(quán)益，促進龍眼遺傳育種水平的提高和龍眼產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明屬于分子生物學的技術(shù)領(lǐng)域，具體涉及一種用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組及其應(yīng)用。

背景技術(shù)

龍眼是我國南亞熱帶地區(qū)重要的經(jīng)濟果樹之一，原產(chǎn)于我國南部和越南北部，栽培歷史長達約2000年之久。世界上大約有400個龍眼栽培品種，其中我國有300個左右。我國在龍眼品種資源、產(chǎn)區(qū)分布、栽培面積和產(chǎn)量等方面都居世界首位。

龍眼被人們稱為嶺南四大名果之一，其果實不僅香甜可口，而且營養(yǎng)價值很高，桂圓富含豐富的葡萄糖、蔗糖、蛋白質(zhì)、多種維生素和礦物質(zhì)，其中煙酸和維生素K的含量之高是其他水果罕有的。龍眼除了可以鮮食之外，還可以加工制成食品，比如龍眼干、龍眼罐頭、龍眼酒、龍眼汁等。另外，龍眼果肉的藥用價值也是出了名的，不僅可以治療貧血、心悸、失眠健忘等癥狀，而且還有抗衰老、抗癌等功效，自古被人們視為滋補及保健藥品。

然而，長期以來，我國龍眼品種市場的監(jiān)管處于空缺狀態(tài)，修飾性、模仿性和低水平重復品種多，“一品多名”、“多品一名”以及假冒侵權(quán)等現(xiàn)象時有發(fā)生，因此加強龍眼植物新品種保護，維護公平競爭的市場環(huán)境，是解決上述難題激勵龍眼育種創(chuàng)新的關(guān)鍵一招。而準確、快速進行農(nóng)作物品種的鑒定，對于農(nóng)作物品種保護、真假品種辨別、品種的產(chǎn)權(quán)糾紛等方面均有重要作用。傳統(tǒng)的品種鑒定方法是田間種植鑒定，是將鑒定品種種植在相同的生長條件下，在生長發(fā)育的各個階段對多個質(zhì)量性狀、數(shù)量性狀及抗病性等做出觀察記載，并進行品種比較，鑒定品種的異同。傳統(tǒng)品種鑒定方法存在鑒定周期長、易受環(huán)境影響、測試性狀多、工作量大等問題，無法適應(yīng)大量品種的鑒定需求。

DNA分子標記是根據(jù)生物個體間基因組DNA序列豐富的變異為基礎(chǔ)的遺傳標記，可以直接反映生物個體在DNA水平上的遺傳多態(tài)性，也是繼形態(tài)學標記、細胞學標記和生化標記之后的最為可靠的遺傳標記技術(shù)。分子標記檢測技術(shù)具有測試周期短、不受環(huán)境影響和季節(jié)限制、沒有組織特異性、供選擇的標記數(shù)量多、可以進行高通量測試分析等優(yōu)勢，已逐步用于品種鑒定、種子純度及品種真實性檢測中。利用RAPD、AFLP、ISSR標記，可以將不同生態(tài)類型的龍眼品種區(qū)別開。但是，RAPD重復性較差；AFLP操作較復雜，穩(wěn)定性較差；ISSR標記大多是顯性標記，不能有效區(qū)分顯性純合基因型和雜合基因型。SSR(Simple SequenceRepeats)是以1-6個核苷酸為單位、呈串聯(lián)重復的DNA序列，廣泛分布于真核生物基因組中。

發(fā)明內(nèi)容

針對上述問題，本發(fā)明的目的在于提供一種用于鑒定龍眼品種的 SSR分子標記引物組及其應(yīng)用，所述用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組具有擴增穩(wěn)定、電泳條帶清晰、多態(tài)性豐富的優(yōu)點，可有效用于龍眼遺傳多樣性分析、品種鑒定、DNA指紋圖譜構(gòu)建等研究。

本發(fā)明的技術(shù)內(nèi)容如下：

本發(fā)明提供了一種用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組，所述SSR分子標記引物組包括24對龍眼SSR引物，所述24對龍眼 SSR引物中的正向引物和反向引物的核苷酸序列分別如序列表中 SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.48所示。

所述用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組應(yīng)用于龍眼品種區(qū)分鑒定以及DNA指紋圖譜構(gòu)建；

所述用于鑒定龍眼品種的SSR分子標記引物組應(yīng)用于龍眼遺傳多樣性分析。