[發(fā)明專利]一種認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)基因的捕獲方法和試劑盒

在審

• 申請?zhí)枺?/td>: 202011080348.8
• 申請日: 2020-10-10
• 公開（公告）號: CN112226502A
• 公開（公告）日: 2021-01-15
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 潘曉東;陳曉春;辛佳蔚;余爾涵;林俊含;楊思宇;朱志保
• 申請（專利權(quán)）人: 福建醫(yī)科大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6806;C40B50/06;C12N15/11;G01N33/68;G01N33/543
• 代理公司: 泉州市立航專利代理事務(wù)所(普通合伙) 35236
• 代理人: 盧清華

1.一種認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)基因的捕獲探針組，其特征在于，所述捕獲探組捕獲的基因和所述基因的染色體坐標(biāo)信息如下表所示：

所述捕獲探針組的設(shè)計(jì)按照如下規(guī)則:

(a)探針長度為120bp；

(b)探針設(shè)計(jì)合并相鄰區(qū)域；

(c)探針設(shè)計(jì)區(qū)間為目標(biāo)區(qū)間向兩翼擴(kuò)展20bp；

(d)探針參考為基因組正義鏈；

(e)探針兩翼的共有序列如SEQIDNO.1和SEQIDNO.2所示；

(f)探針設(shè)計(jì)中通過比對全基因組信息確保探針特異性；

(g)探針GC含量以30％-70％為標(biāo)準(zhǔn)，GC含量變化幅度偏離標(biāo)準(zhǔn)含量每增加10％,探針在該區(qū)域探針數(shù)量增加50％。

(h)在基因組非捕獲區(qū)域有近似序列的探針，每有一個(gè)近似序列，則該區(qū)域探針數(shù)量增加100％；所述近似序列為與探針序列的同源性至少為95％的序列。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的捕獲探針組，其特征在于，所述捕獲探針組中的探針經(jīng)過標(biāo)記物標(biāo)記，優(yōu)選為經(jīng)過生物素標(biāo)記。

3.一種用于文庫構(gòu)建的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒包含權(quán)利要求1或2所述的捕獲探針組；

優(yōu)選地，所述試劑盒還包括用于富集捕獲的靶序列的PCR擴(kuò)增引物:所述PCR擴(kuò)增引物具有如SEQIDNO.3和SEQIDNO.4所示序列。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括用于多樣本雜交捕獲的接頭用于文庫雜交前封閉HybBlock，所述試劑盒為安捷倫Agilent SureSelect QXTLibrary Prep Kit基因組DNA建庫試劑盒。

5.根據(jù)權(quán)利要求3所述的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒還包括與探針上的標(biāo)記物親和的磁珠；

優(yōu)選地，所述試劑盒中的捕獲探針組中的探針經(jīng)生物素標(biāo)記，所述磁珠為親和素偶聯(lián)的磁珠，所述磁珠優(yōu)選為鏈霉親和素偶聯(lián)的磁珠；

優(yōu)選地，所述試劑盒還包含用于提供雜交捕獲反應(yīng)的離子環(huán)境的緩沖液；

優(yōu)選地，所述試劑盒還包含用于洗脫物理吸附或非特異性雜交的清洗液。

6.一種權(quán)利要求1或2所述的捕獲探針組、權(quán)利要求3-6中任一項(xiàng)所述的試劑盒在知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)基因篩查中的用途；

優(yōu)選地，所述測序?yàn)榛鵌llumina測序平臺的雙末端測序，然后將測序結(jié)果與數(shù)據(jù)庫進(jìn)行對比。

7.一種診斷認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙的工具，所述診斷工具包括芯片、試劑盒、試紙、或高通量測序平臺；

其中，所述芯片包括基因芯片、蛋白質(zhì)芯片；所述基因芯片包括固相載體以及固定在固相載體的權(quán)利要求1所述的捕獲探針組，所述捕獲探針組包括用于檢測表1所述基因轉(zhuǎn)錄水平的針對表1所述基因的寡核苷酸探針；所述蛋白質(zhì)芯片包括固相載體以及固定在固相載體的表1所述基因的特異性抗體；所述基因芯片可用于檢測包括表1所述基因在內(nèi)的多個(gè)基因(例如，與帕金森癥等認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)的多個(gè)基因)的表達(dá)水平；所述蛋白質(zhì)芯片可用于檢測包括表1所述基因在內(nèi)的多個(gè)蛋白質(zhì)(例如與帕金森癥等認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙相關(guān)的多個(gè)蛋白質(zhì))的表達(dá)水平；通過將多個(gè)與帕金森癥的標(biāo)志物同時(shí)檢測，可大大提高帕金森癥等認(rèn)知障礙和運(yùn)動(dòng)障礙診斷的準(zhǔn)確率。