[發(fā)明專利]一種基于高通量測(cè)序檢測(cè)膽管癌FGFR1/2/3融合基因的文庫(kù)構(gòu)建方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202011069119.6 | 申請(qǐng)日: | 2020-09-30 |
| 公開(kāi)(公告)號(hào): | CN112144125B | 公開(kāi)(公告)日: | 2021-06-15 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 陳志宏;修陽(yáng)斌;陳琰;康燦昆 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 廈門(mén)飛朔生物技術(shù)有限公司 |
| 主分類號(hào): | C40B50/06 | 分類號(hào): | C40B50/06;C40B40/06;C12Q1/6806;C12Q1/6858;C12Q1/6886;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京科億知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理事務(wù)所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 李興林 |
| 地址: | 361000 福建省廈門(mén)市同*** | 國(guó)省代碼: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 基于 通量 檢測(cè) 膽管癌 fgfr1 融合 基因 文庫(kù) 構(gòu)建 方法 | ||
1.一種基于高通量測(cè)序檢測(cè)膽管癌FGFR1/2/3融合基因的文庫(kù)構(gòu)建方法,其特征在于,該文庫(kù)構(gòu)建方法使用的引物及探針序列如SEQ ID NO.1-67所示;
所述文庫(kù)構(gòu)建方法,包括以下步驟:
(1)使用引物及探針序列SEQ ID NO.1-67對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增獲得文庫(kù);
(2)文庫(kù)的純化。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量測(cè)序檢測(cè)膽管癌FGFR1/2/3融合基因的文庫(kù)構(gòu)建方法,其特征在于,所述步驟(1)中樣本為手術(shù)切除的新鮮病理組織、甲醛固定石蠟包埋病例組織、石蠟切片中的一種。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量測(cè)序檢測(cè)膽管癌FGFR1/2/3融合基因的文庫(kù)構(gòu)建方法,其特征在于,所述步驟(1)中PCR擴(kuò)增程序如下表所示
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于高通量測(cè)序檢測(cè)膽管癌FGFR1/2/3融合基因的文庫(kù)構(gòu)建方法,其特征在于,所述步驟(1)中PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系如下表所示
序號(hào) 物料 物料濃度 用量(μL) 1 RingCapbuffer 10× 2.5 2 2]]> 25mM 4 3 dNTPs 5μM 2 4 FGFR富集反應(yīng)引物MIX 50μM 4 5 2O]]> 純化水 6.4 6 RingCap-Taq酶 5U/ul 0.5 7 Ion-BCXX-F 50μM 0.2 8 Ion-BCXX-R 50μM 0.2 9 C-Primer 50μM 0.2 10 cDNA - 5 總體積 25
。
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C40B 組合化學(xué);化合物庫(kù),如化學(xué)庫(kù)、虛擬庫(kù)
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C40B50-02 .化合物庫(kù)的虛擬或數(shù)學(xué)概念
C40B50-04 .使用動(dòng)態(tài)組合化學(xué)技術(shù)
C40B50-06 .生物化學(xué)方法,如使用酶或全活微生物
C40B50-08 .液相合成法,即在建庫(kù)期間所有化合物庫(kù)構(gòu)建基塊都在液相或呈溶液狀態(tài);從液相載體中解離的特定方法
C40B50-14 .固相合成法,即在建庫(kù)期間1個(gè)或多個(gè)化合物庫(kù)構(gòu)建基塊與固相載體結(jié)合;從固相載體中解離的特定方法
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