[發明專利]一種鑒定大豆抗大豆花葉病毒SC3株系的SSR標記CH0211及其檢測方法和應用

有效

• 申請號: 202010986972.8
• 申請日: 2020-09-18
• 公開（公告）號: CN111996282B
• 公開（公告）日: 2022-07-15
• 發明（設計）人: 李凱;蔡晗;沈穎;陳圓圓;謝麗君;陳柏羽
• 申請（專利權）人: 南京農業大學
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11
• 代理公司: 南京天華專利代理有限責任公司 32218
• 代理人: 競存;徐冬濤

本發明公開了一種鑒定大豆對大豆花葉病毒(Soybean Mosaic Virus,SMV)流行株系SC3抗性鑒定的SSR標記CH0211及其檢測方法和應用，通過利用新開發的與抗大豆花葉病毒SC3株系基因緊密連鎖的SSR標記CH0211對大豆品種進行抗病性選擇，以期獲得抗SMV SC3株系的大豆新種質。本發明避免了大豆常規抗花葉病毒育種的周期長、工作量大、選擇效率低、抗病表型選擇易受環境影響等缺點，可大幅提高抗病育種選擇效率，為對基因型的直接選擇提供了可能，將極大地推動大豆抗病育種進程。

技術領域

本發明屬于生物檢測領域，具體涉及一種鑒定大豆抗大豆花葉病毒流行株系SC3品種的SSR標記CH0211及其檢測方法和應用。

背景技術

大豆花葉病毒(Soybean Mosaic Virus,SMV)病是大豆生產中最常見、危害最為嚴重的病毒害之一，嚴重危害大豆的產量與品質(圖2)。傳統抗SMV育種需要人工接種鑒定每個后代家系的抗病性，耗時費力、且易受到環境(尤其是溫度)等條件的限制，從而影響抗性材料表型的選擇。隨著現代分子生物學的發展，現代生物技術的進步為作物育種提供了強有力的幫助，分子標記輔助選擇育種(Molecular Marker-Assisted Selection,MAS)作為其中一項重要技術，它與傳統抗SMV育種相比，MAS技術可對抗病基因直接選擇，能夠更加高效、精準地選擇抗SMV個體，大幅提高育種效率。

微衛星序列(Simple Sequence Repeat,SSR)標記具有重復性好，多態性高，共顯性等優點，廣泛分布在大豆基因組中。目前SSR標記已被廣泛運用于MAS中，利用與抗病相關的SSR標記檢測種質抗SMV的準確率較高，且快速、簡便，可直接用于大豆抗SMV育種。

國內目前已經篩選了一些與抗SMV相關的分子標記，一些專家也利用這些標記進行抗SMV的輔助篩選，但篩選的標記選擇與表型選擇符合率不高，且所用材料樣本偏小。滕衛麗等利用與SMV1抗性相關的SSR標記Satt114、Satt362、HSP176、Satt510、Satt334、Sct033和與SMV3抗性相關的SSR標記Satt114、Satt362，分別對70份大豆種質資源接種東北株系(SMV1和SMV3)進行抗性鑒定，驗證結果表明SSR標記鑒定準確率分別為70.7％和75.6％。韓英鵬等利用SSR標記Satt114對146個F_2：5重組自交家系進行接種N1株系后的抗性鑒定，得出分子輔助選擇的符合率為87.5％。李文福等用6個與大豆花葉病毒抗性相關的SSR標記Sat_229、Sat_317、Satt335、Satt160、Satt516和Sat_309對186份種質資源接種SMV1株系后進行檢測，6個標記中Sat_317、Satt335、Satt516對抗病資源篩選的準確率70％以上。欒曉燕等利用分離群體分組分析法(Bulked Segregant Analysis,BSA)建立的F₂群體DNA抗感池中鑒定出與抗性表型緊密相關的SSR標記Satt296，該標記位于D1b連鎖群，推測該標記有望用于大豆抗SMV3株系的分子標記輔助選擇。

發明內容

本發明目的在于提供一種鑒定大豆抗大豆花葉病毒流行株系SC3的SSR標記CH0211及其檢測方法和應用，通過利用新開發的與Rsc3緊密連鎖的SSR標記CH0211的專用引物對大豆抗大豆花葉病毒SC3株系進行早期子代選擇鑒定，大大減少了抗病育種工作量以及育種周期，因此能夠快速、精準、高效地篩選出抗SMV SC3的大豆育種材料。

本發明技術方案如下：

本發明的第一個目的是提供一種鑒定大豆抗大豆花葉病毒SC3株系的SSR標記CH0211，所述SSR標記引物序列如下：

上游引物：5’-CAGGTCGATAAGTCTATGT-3’(SEQ ID NO.1)；

下游引物：5’-ATATGAACTCGGTCTGTTG-3’(SEQ ID NO.2)。