[發明專利]與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記及其檢測引物、方法與應用

有效

• 申請號: 202010850322.0
• 申請日: 2020-08-21
• 公開（公告）號: CN111826462B
• 公開（公告）日: 2023-06-16
• 發明（設計）人: 烏云塔娜;徐宛玉;王淋;朱高浦;趙罕;陳晨;劉慧敏;黃夢真;茍寧寧;王楚;白海坤
• 申請（專利權）人: 中國林業科學研究院經濟林研究所
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京冠榆知識產權代理事務所(特殊普通合伙) 11666
• 代理人: 朱亞琦

本發明公開與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記及其檢測引物、方法與應用，在西伯利亞杏的6號染色體中存在與西伯利亞杏花期早晚相關7個SNP標記，設計與檢測西伯利亞杏花期早晚的6對引物，通過6對引物進行PCR擴增，檢測西伯利亞杏的6號染色體中與西伯利亞杏花期早晚相關的標記位點，并測序標記位點的基因型，從而判定西伯利亞杏花期早晚。通過對我國西伯利亞杏的全基因組關聯分析發現位點與西伯利亞杏開花期早晚顯著相關，并進一步針對該位點開發標記，提供檢測西伯利亞杏開花期早晚的方法及專用引物，本發明提供的引物可以特異檢測西伯利亞杏中位點的基因型,也可以作為不同花期育種中的標記輔助選擇的新工具，具有非常重要的積極意義。

技術領域

本發明涉及分子生物學技術領域。具體地說是與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記及其檢測引物、方法與應用。

背景技術

西伯利亞杏是一種多年生核果樹種，其廣泛分布于中國北部和西北部，蒙古的西部和西南部，西伯利亞的西部和俄羅斯的沿海等地。西伯利亞杏適應性強，是一種集生態價值和經濟價值于一身的優良生態兼經濟樹種。西伯利亞果仁中脂肪、蛋白質及苦杏仁苷含量豐富，杏仁可以入藥，也可以榨油或加工成食品與飲料，是中國傳統的出口物資之一。但西伯利亞杏產量不穩定，多受天氣狀況的影響：早春的大風和低溫影響蜜蜂的活動和授粉情況，霜凍也會減少花芽，花和幼果的數量。因此，晚花性狀是西伯利亞杏的重要育種目標，鑒定晚花性狀緊密相關的分子標記和基因，通過分子育種手段針對性選育晚花性狀，開發一種早期檢測西伯利亞杏花期的分子標記，可為西伯利亞杏在分子鑒定和輔助育種等方面提供有力的技術支持，具有重要的理論和應用價值。

發明內容

為此，本發明所要解決的技術問題在于提供一種可以特異檢測西伯利亞杏中位點的基因型的與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記及其檢測引物、方法與應用。

為解決上述技術問題，本發明提供如下技術方案：

與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記，在西伯利亞杏的6號染色體中存在與西伯利亞杏花期早晚相關7個SNP標記，分別為

Ps-FT-SNP1：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18103769位點；

Ps-FT-SNP2：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18103787位點；

Ps-FT-SNP3：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18104140位點；

Ps-FT-SNP4：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18105050位點；

Ps-FT-SNP5：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18106369位點；

Ps-FT-SNP6：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18106638位點；

Ps-FT-SNP7：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18107219位點。

上述與西伯利亞杏開花期早晚相關的標記，Ps-FT-SNP1：位于西伯利亞杏的6號染色體上的第18103769位點的突變基因為G/A；

Ps-FT-SNP2：位于西伯利亞杏的6號染色體的上第18103787位點的突變基因為G/A；

Ps-FT-SNP3：位于西伯利亞杏的6號染色體的上第18104140位點的突變基因為T/A；

Ps-FT-SNP4：位于西伯利亞杏的6號染色體的上第18105050位點的突變基因為T/G；

Ps-FT-SNP5：位于西伯利亞杏的6號染色體的上第18106369位點的突變基因為G/A；

Ps-FT-SNP6：位于西伯利亞杏的6號染色體的上第18106638位點的突變基因為T/C；