[發明專利]一種位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記及應用

有效

• 申請號: 202010788474.2
• 申請日: 2020-08-07
• 公開（公告）號: CN111808974B
• 公開（公告）日: 2022-04-22
• 發明（設計）人: 吳珍芳;楊杰;莊站偉;吳杰;楊明;蔡更元;鄭恩琴;曾海玉;李紫聰;顧婷;徐錚
• 申請（專利權）人: 華南農業大學;溫氏食品集團股份有限公司
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12Q1/6883;C12N15/11
• 代理公司: 佛山市君創知識產權代理事務所(普通合伙) 44675
• 代理人: 許菲菲

1.一種位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記在制備鑒定豬陰囊疝相性狀的產品和豬遺傳育種中的應用，其特征在于：

所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的SNP位點對應于國際豬基因組11.1版本參考序列9號染色體上第128013229位GA突變；所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的核苷酸序列如SEQ ID NO：1所示，其中序列中的M是G或A，導致豬陰囊疝發生比例的差異；所述的豬為長白豬及其合成系；

所述的應用不含疾病的治療與診斷目的。

2.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的引物對在制備鑒定豬陰囊疝的產品中的應用，其特征在于所述的引物對包含引物P001-F和引物P002-R，其核苷酸序列如下所示：

P001-F：5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’，

P002-R：5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’；

所述的豬為長白豬及其合成系。

3.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的引物對在豬分子標記輔助育種中的應用，其特征在于所述的引物對包含引物P001-F和引物P002-R，其核苷酸序列如下所示：

P001-F：5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’，

P002-R：5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’；

所述的豬為長白豬及其合成系；

所述的應用不含疾病的治療與診斷目的。

4.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的引物對在制備降低豬陰囊疝發生率的產品中的應用，其特征在于所述的引物對包含引物P001-F和引物P002-R，其核苷酸序列如下所示：

P001-F：5’-CTGGCTCCAGAGTGAGGAGA-3’，

P002-R：5’-GACACAACCCAAGAGGTCCA-3’；

所述的豬為長白豬及其合成系；

所述的應用不含疾病的治療與診斷目的。

5.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的試劑盒在制備鑒定豬陰囊疝的產品中的應用，其特征在于所述的試劑盒包含權利要求2中所述的引物。

6.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的試劑盒在豬分子標記輔助育種中的應用，其特征在于所述的試劑盒包含權利要求2中所述的引物；

所述的應用不含疾病的治療與診斷目的。

7.一種用于鑒定權利要求1中所述的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的試劑盒在制備降低豬陰囊疝發生率的產品中的應用，其特征在于所述的試劑盒包含權利要求2中所述的引物；

所述的應用不含疾病的治療與診斷目的。

8.一種鑒定位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記基因型的方法，其特征在于包含如下步驟：

（1）提取待測豬的基因組DNA ；

（2）采用權利要求2中所述的引物對對步驟（1）獲得的基因組DNA進行PCR擴增，得到PCR擴增產物；

（3）對步驟（2）獲得的PCR擴增產物進行測序，以便獲得測序結果；

（4）基于所述測序結果，確定待測豬的位于豬9號染色體上與陰囊疝發生相關的SNP分子標記的基因型；

所述的豬為長白豬及其合成系；

所述的方法不含疾病的治療與診斷目的。