[發明專利]雄激素受體剪接變異體-7核酸定量檢測方法、內標及試劑盒在審
| 申請號: | 202010779376.2 | 申請日: | 2020-08-05 |
| 公開(公告)號: | CN112029855A | 公開(公告)日: | 2020-12-04 |
| 發明(設計)人: | 王曉楠;喬春曉;張亞楠 | 申請(專利權)人: | 上海思路迪醫學檢驗所有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6886 | 分類號: | C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11 |
| 代理公司: | 北京市蘭臺律師事務所 11354 | 代理人: | 張峰 |
| 地址: | 200120 上海市浦*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 激素 受體 剪接 異體 核酸 定量 檢測 方法 試劑盒 | ||
1.一種熒光PCR定量檢測AR-V7的方法,其特征在于,包括:
S1、提供一包括AR-V7和已知濃度或模板量的AR-V7 QS內標的熒光PCR反應體系;
所述熒光PCR反應體系還包括用于檢測AR-V7的上、下游引物及探針,以及用于檢測AR-V7 QS的上、下游引物及探針,其中用于檢測AR-V7的上、下游引物序列分別與用于檢測AR-V7 QS的上、下游引物序列相同;
所述AR-V7 QS包括與所述AR-V7相同的上、下游引物識別序列,以及位于上、下游引物識別序列之間的探針識別序列Ⅰ;所述AR-V7包括位于上、下游引物識別序列之間的探針識別序列Ⅱ;
所述探針識別序列Ⅰ與所述探針識別序列Ⅱ的堿基組成相同而堿基排列順序不同;
S2、進行擴增反應,并檢測AR-V7和AR-V7 QS二者的Ct值,則所述樣本中AR-V7的濃度或模板量采用如下的公式計算,
AR-V7濃度=(2^ΔCт)×AR-V7 QS濃度,
AR-V7模板量=(2^ΔCт)×AR-V7 QS模板量,
其中ΔCт為AR-V7 QS的Ct值與AR-V7的Ct值的差值。
2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述用于檢測AR-V7 QS的探針序列與所述探針識別序列Ⅰ相同或互補,所述用于檢測AR-V7的探針序列與所述探針識別序列Ⅱ相同或互補。
3.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述用于檢測AR-V7 QS的上、下游引物序列分別與AR-V7 QS的上、下游引物識別序列相同或互補,所述用于檢測AR-V7的上、下游引物序列分別與AR-V7的上、下游引物識別序列相同或互補。
4.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述探針識別序列Ⅰ與所述探針識別序列Ⅱ中至少4個堿基的排列順序不同。
5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,所述AR-V7 QS在除所述探針識別序列Ⅰ之外的區域與所述AR-V7在除所述探針識別序列Ⅱ之外的區域序列相同。
6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,
所述AR-V7 QS的序列為:
TTGTCCATCTTGTCGTCTTCGGAAATGT
CTCTGGGAGAAAAATTCCGGGTTGGCAATTG,其中下劃線部分為所述探針識別序列Ⅰ。
7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,所述用于檢測AR-V7 QS的上、下游引物及探針分別為:
AR-V7 QS上游引物:TTGTCCATCTTGTCGTCTTCG
AR-V7 QS下游引物:CAATTGCCAACCCGGAATTT
AR-V7 QS探針:TGATAGCAAGAGGGTA。
8.根據權利要求7所述的方法,其特征在于,所述用于檢測AR-V7的上、下游引物及探針分別為:
AR-V7上游引物:TTGTCCATCTTGTCGTCTTCG
AR-V7下游引物:CAATTGCCAACCCGGAATTT
AR-V7探針:TATGAAGCAGGGATGA。
9.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,在50uL的擴增反應體系中所述AR-V7 QS的模板量為50copies。
10.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述AR-V7的濃度或模板量的范圍是:在AR-V7 QS存在的情況下,所述AR-V7的濃度或模板量分別與AR-V7的Ct值線性相關的范圍。
11.根據權利要求10所述的方法,其特征在于,在50uL的擴增反應體系中,所述AR-V7的模板量在5copies到50000copies之間。
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