[發明專利]一種化合物涼味程度判別方法在審
| 申請號: | 202010773961.1 | 申請日: | 2020-08-04 |
| 公開(公告)號: | CN111933222A | 公開(公告)日: | 2020-11-13 |
| 發明(設計)人: | 楊乾栩;顏克亮;陳微;馬驥;周國福;周博;楊瑩;劉曉波 | 申請(專利權)人: | 云南中煙工業有限責任公司 |
| 主分類號: | G16C20/30 | 分類號: | G16C20/30;G16C20/20 |
| 代理公司: | 昆明正原專利商標代理有限公司 53100 | 代理人: | 金耀生 |
| 地址: | 650231 *** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 化合物 程度 判別 方法 | ||
本發明公開了一種化合物涼味程度判別方法,將結果參數值分別帶入判別函數中,結果最大的值對應的即是潛在涼味小分子的涼味程度判別結果。本發明從生津原理出發,根據涼味小分子和受體蛋白TRPM8的對接結果進行分析,結合建立的涼味判別模型,判斷涼味小分子的涼味程度,具有判別準確度高、結果直觀立體、結合程序可批量化處理,應用方便。
技術領域
本發明屬于分子模擬領域,具體是涉及一種化合物涼味程度判別方法。
背景技術
涼味化合物是具有一定涼感的化合物,如薄荷醇、WS-3(N-乙基-對薄荷基-3-甲酰胺)、WS-23(2-異丙基-N,2,3-三甲基丁酰胺等化合物均為涼味化合物,目前尚無對于小分子涼味屬性的判斷方法。
人類之所以能感受到涼味覺物質,從生理上來講是因為涼味小分子與人體內相應的受體蛋白TRPM8活性區域發生了特異性結合,從而誘導下游信號,產生相應涼味感受。分子對接指的是已知兩個分子三維結構(一般是小分子配體與大分子蛋白受體),研究二者之間是否可以結合,預測分子結合的模式,搜索配體和受體活性區域穩定結合的自由能最低構象。
如何利用不同涼味分子在TRPM8蛋白的對接模式不同,采用分子對接方法,構建不同涼感小分子與TRPM8蛋白的對子對接模型,并提取分子對接結果關鍵參數,依據分子對接結果關鍵參數,建立不同涼味分子的涼味程度判別模型,實現對小分子涼味程度的定性判別,是值得研究的。
發明內容
本發明的目的在于針對現有涼味化合物判別方法的不足,利用不同涼味分子在TRPM8蛋白上的結合方式不同,導致其對接結果關鍵參數的不同,從而建立一種簡單有效的涼味化合物判別方法。
本發明的目的通過下述技術方案予以實現。
除非另有說明,本發明所采用的百分數均為重量百分數。
一種化合物涼味程度判別方法,按以下進行:將結果參數值分別帶入到下面三個判別函數中,結果最大的值對應的即是涼味小分子的涼味程度判別結果:
涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;
弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;
非涼味成分= 0.586*BE – 4.295*ImE – 6.549*IE + 5.856*RR – 973.156;
其中:
BE 為結合能量,等于分子間能量和扭轉自由能之和;
ImE為分子間能量;
IE為分子內能量;
RR為當前結構相對于參比構象的均方差值。
本發明涉及的一種化合物涼味程度判別方法,包括如下步驟:
步驟(1)、將潛在涼味小分子和受體蛋白T1R2-T1R3進行預處理后,導入分子對接軟件中,完成對接盒子和對接參數設置,進行分子對接,導出分子對接結果;
步驟(2)、涼味程度判別
將對接結果參數值分別帶入到下面三個貝葉斯判別函數中:
涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;
弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;
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