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[發明專利]一種化合物涼味程度判別方法在審

專利信息
申請號: 202010773961.1 申請日: 2020-08-04
公開(公告)號: CN111933222A 公開(公告)日: 2020-11-13
發明(設計)人: 楊乾栩;顏克亮;陳微;馬驥;周國福;周博;楊瑩;劉曉波 申請(專利權)人: 云南中煙工業有限責任公司
主分類號: G16C20/30 分類號: G16C20/30;G16C20/20
代理公司: 昆明正原專利商標代理有限公司 53100 代理人: 金耀生
地址: 650231 *** 國省代碼: 云南;53
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 化合物 程度 判別 方法
【權利要求書】:

1.一種化合物涼味程度判別方法,其特征在于:按以下進行:將結果參數值分別帶入到下面三個判別函數中,結果最大的值對應的即是小分子的涼味程度判別結果:

涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;

弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;

非涼味成分= 0.586*BE – 4.295*ImE – 6.549*IE + 5.856*RR – 973.156;

其中:

BE 為結合能量,等于分子間能量和扭轉自由能之和;

ImE為分子間能量;

IE為分子內能量;

RR為當前結構相對于參比構象的均方差值。

2.一種化合物涼味程度判別方法,其特征在于:包括如下步驟:

步驟(1)、將潛在涼味小分子和受體蛋白TRPM8進行預處理后,導入分子對接軟件中,完成對接盒子和對接參數設置,進行分子對接,導出分子對接結果;

步驟(2)、涼味程度判別

將對接結果參數值分別帶入到下面三個貝葉斯判別函數中:

涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;

弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;

非涼味成分= 0.586*BE – 4.295*ImE – 6.549*IE + 5.856*RR – 973.156;

結果最大的值對應的即是潛在涼味小分子的涼味程度判別結果;

BE 為結合能量,等于分子間能量和扭轉自由能之和;

ImE為分子間能量;

IE為分子內能量;

RR為當前結構相對于參比構象的均方差值。

3.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,涼味小分子預處理過程包括能量最小優化、可旋轉鍵確定、導出為PDBQT文件;受體蛋白TRPM8預處理過程包括去水、加氫、計算電荷、導出為剛性PDBQT文件。

4.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,對接盒子設置如下:

格子在三個水平軸上所含點數設置為X,Y,Z:42,42,60,格點間隔為默認值0. 708 ?,格子中心設為199.614,168.8536,211.71(x,y,z)。

5.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,最小可旋轉鍵設置為6個。

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