[發明專利]一種化合物涼味程度判別方法在審
| 申請號: | 202010773961.1 | 申請日: | 2020-08-04 |
| 公開(公告)號: | CN111933222A | 公開(公告)日: | 2020-11-13 |
| 發明(設計)人: | 楊乾栩;顏克亮;陳微;馬驥;周國福;周博;楊瑩;劉曉波 | 申請(專利權)人: | 云南中煙工業有限責任公司 |
| 主分類號: | G16C20/30 | 分類號: | G16C20/30;G16C20/20 |
| 代理公司: | 昆明正原專利商標代理有限公司 53100 | 代理人: | 金耀生 |
| 地址: | 650231 *** | 國省代碼: | 云南;53 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 化合物 程度 判別 方法 | ||
1.一種化合物涼味程度判別方法,其特征在于:按以下進行:將結果參數值分別帶入到下面三個判別函數中,結果最大的值對應的即是小分子的涼味程度判別結果:
涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;
弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;
非涼味成分= 0.586*BE – 4.295*ImE – 6.549*IE + 5.856*RR – 973.156;
其中:
BE 為結合能量,等于分子間能量和扭轉自由能之和;
ImE為分子間能量;
IE為分子內能量;
RR為當前結構相對于參比構象的均方差值。
2.一種化合物涼味程度判別方法,其特征在于:包括如下步驟:
步驟(1)、將潛在涼味小分子和受體蛋白TRPM8進行預處理后,導入分子對接軟件中,完成對接盒子和對接參數設置,進行分子對接,導出分子對接結果;
步驟(2)、涼味程度判別
將對接結果參數值分別帶入到下面三個貝葉斯判別函數中:
涼味成分= 1.368*BE – 1.426*ImE – 6.301*IE + 6.072*RR – 1023.232;
弱涼味成分= 3.686*BE – 2.217*ImE – 9.904*IE + 5.993*RR – 1002.130;
非涼味成分= 0.586*BE – 4.295*ImE – 6.549*IE + 5.856*RR – 973.156;
結果最大的值對應的即是潛在涼味小分子的涼味程度判別結果;
BE 為結合能量,等于分子間能量和扭轉自由能之和;
ImE為分子間能量;
IE為分子內能量;
RR為當前結構相對于參比構象的均方差值。
3.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,涼味小分子預處理過程包括能量最小優化、可旋轉鍵確定、導出為PDBQT文件;受體蛋白TRPM8預處理過程包括去水、加氫、計算電荷、導出為剛性PDBQT文件。
4.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,對接盒子設置如下:
格子在三個水平軸上所含點數設置為X,Y,Z:42,42,60,格點間隔為默認值0. 708 ?,格子中心設為199.614,168.8536,211.71(x,y,z)。
5.根據權利要求2所述的化合物涼味程度判別方法,其特征在于:步驟(1)中,最小可旋轉鍵設置為6個。
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