[發(fā)明專利]用于篩查地中海貧血的特征蛋白標(biāo)記組合物、質(zhì)譜模型及其應(yīng)用有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202010767467.4 | 申請(qǐng)日: | 2020-08-03 |
| 公開(公告)號(hào): | CN111948404B | 公開(公告)日: | 2023-04-07 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 孫德慧;王玉璽;李運(yùn)濤;周曉光 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 融智生物科技(青島)有限公司 |
| 主分類號(hào): | G01N33/68 | 分類號(hào): | G01N33/68;G01N27/62 |
| 代理公司: | 北京正理專利代理有限公司 11257 | 代理人: | 趙曉丹 |
| 地址: | 266000 山東省青島市高新*** | 國(guó)省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 用于 地中海貧血 特征 蛋白 標(biāo)記 組合 模型 及其 應(yīng)用 | ||
1.用于篩查地中海貧血的特征蛋白標(biāo)記組合物,所述地中海貧血包括α地中海貧血、β地中海貧血和/或同時(shí)攜帶α和β地中海貧血;其特征在于,所述特征蛋白標(biāo)記組合物包括α-珠蛋白、β-珠蛋白、δ-珠蛋白、γ-珠蛋白和/或碳酸酐酶I,其中,所述α-珠蛋白、β-珠蛋白、δ-珠蛋白、γ-珠蛋白和碳酸酐酶I的序列分別如SEQ?ID?NO.1-5所示;
所述α-珠蛋白、β-珠蛋白、δ-珠蛋白、γ-珠蛋白和碳酸酐酶I質(zhì)譜檢測(cè)的質(zhì)荷比分別為:15127m/z、15868m/z、15924m/z、15995m/z和28762m/z,允許的質(zhì)荷比誤差為±0.1%。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的特征蛋白標(biāo)記組合物,其特征在于,所述地中海貧血還包括非缺失型α地中海貧血Hb?CS,所述特征蛋白標(biāo)記組合物還包括用于篩查非缺失型α地中海貧血Hb?CS的α珠蛋白變體,其序列如SEQ?ID?NO.6所示。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的特征蛋白標(biāo)記組合物,其特征在于,所述α珠蛋白變體的質(zhì)譜檢測(cè)的質(zhì)荷比為18480m/z,允許的質(zhì)荷比誤差為±0.1%。
4.用于篩查地中海貧血的質(zhì)譜模型,其特征在于,所述質(zhì)譜模型包括權(quán)利要求1-3任一所述的特征蛋白標(biāo)記組合物;
其中,所述質(zhì)譜模型的制備方法包括:
1)收集待測(cè)患者和正常人的血液樣本分別作為待測(cè)樣本和對(duì)照樣本,并對(duì)待測(cè)樣本和對(duì)照樣本進(jìn)行前處理;
2)對(duì)前處理后的待測(cè)樣本和對(duì)照樣本進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)并采集待測(cè)樣本和對(duì)照樣本的質(zhì)譜圖;
3)對(duì)采集的質(zhì)譜圖進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,篩選出具有下列質(zhì)荷比的特征蛋白的質(zhì)譜峰:表征α珠蛋白質(zhì)譜峰的15127m/z、表征β珠蛋白質(zhì)譜峰的15868m/z、表征δ珠蛋白質(zhì)譜峰的15924m/z、表征γ珠蛋白質(zhì)譜峰的15995m/z和/或表征碳酸酐酶I質(zhì)譜峰的28762m/z,允許的質(zhì)荷比誤差為±0.1%,獲得對(duì)應(yīng)特征蛋白的質(zhì)譜峰面積,根據(jù)特征蛋白的質(zhì)譜峰、質(zhì)譜峰面積及δ/β比率和CA?I/δ比率建立用于篩查地中海貧血的質(zhì)譜模型;其中,δ/β比率為δ珠蛋白的質(zhì)譜峰面積與β珠蛋白的質(zhì)譜峰面積的比值,CA?I/δ比率為碳酸酐酶I的質(zhì)譜峰面積與δ珠蛋白的質(zhì)譜峰面積的比值;
在質(zhì)譜模型中設(shè)定δ/β比率的臨界值為0.1573,當(dāng)待測(cè)樣本的δ/β比率0.1573時(shí),則判讀該待測(cè)樣本為β地中海貧血或同時(shí)攜帶α和β地中海貧血;當(dāng)待測(cè)樣本的δ/β比率≤0.1573時(shí),則利用二元邏輯回歸模型分析δ/β和CA?I/δ比率,得到預(yù)測(cè)概率并設(shè)定預(yù)測(cè)概率的臨界值為0.45,當(dāng)預(yù)測(cè)概率≤0.45時(shí),判讀該待測(cè)樣本為正常;當(dāng)預(yù)測(cè)概率0.45時(shí),判讀該待測(cè)樣本為α地中海貧血。
5.根據(jù)權(quán)利要求4所述的質(zhì)譜模型,其特征在于,所述制備方法還包括篩選質(zhì)荷比為18480m/z的表征非缺失型α地中海貧血Hb?CS的α珠蛋白變體的質(zhì)譜峰,在質(zhì)譜模型中當(dāng)待測(cè)樣本的質(zhì)譜圖相對(duì)于對(duì)照樣本的質(zhì)譜圖中出現(xiàn)非缺失型α地中海貧血Hb?CS的α珠蛋白變體的質(zhì)譜峰時(shí),判讀該待測(cè)樣本為非缺失型α地中海貧血Hb?CS,
和/或,
所述制備方法還包括比較待測(cè)樣本相對(duì)于對(duì)照樣本的質(zhì)譜圖的γ珠蛋白的質(zhì)譜峰,在質(zhì)譜模型中當(dāng)待測(cè)樣本的質(zhì)譜圖相對(duì)于對(duì)照樣本的質(zhì)譜圖的γ珠蛋白的質(zhì)譜峰異常升高時(shí),懷疑該待測(cè)樣本為β地中海貧血或遺傳性持續(xù)性胎兒血紅蛋白增高癥;
和/或,
所述制備方法還包括篩選待測(cè)樣本相對(duì)于對(duì)照樣本的異常質(zhì)荷比的質(zhì)譜峰,在質(zhì)譜模型中當(dāng)待測(cè)樣本的質(zhì)譜圖相對(duì)于對(duì)照樣本的質(zhì)譜圖中出現(xiàn)異常質(zhì)荷比的質(zhì)譜峰時(shí),懷疑該待測(cè)樣本中存在異常血紅蛋白。
6.權(quán)利要求1-3任一所述的特征蛋白標(biāo)記組合物或權(quán)利要求4-5任一所述的質(zhì)譜模型在制備篩查地中海貧血癥的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
7.一種篩查地中海貧血癥的產(chǎn)品,其特征在于,所述產(chǎn)品除包括權(quán)利要求1-3任一所述的特征蛋白標(biāo)記組合物或權(quán)利要求4-5任一所述的質(zhì)譜模型外,還包括:樣品前處理試劑、質(zhì)譜檢測(cè)系統(tǒng)和/或軟件分析系統(tǒng)。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的產(chǎn)品,其特征在于,所述產(chǎn)品還包括自動(dòng)鑒定軟件系統(tǒng)。
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