[發明專利]膠質瘤患者生存預測的預后分類系統

有效

• 申請號: 202010732361.0
• 申請日: 2020-07-27
• 公開（公告）號: CN112048555B
• 公開（公告）日: 2022-06-07
• 發明（設計）人: 羅韜;藍洋;葛佳;鄧慶;劉鋒;李磊;姚小紅;卞修武
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍陸軍軍醫大學第一附屬醫院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886;C12N15/11;G16B25/10;G16B40/00;G16H50/30
• 代理公司: 重慶鼎慧峰合知識產權代理事務所(普通合伙) 50236
• 代理人: 龔世妍

1.膠質瘤患者生存預測的預后分類系統，其特征在于，所述預后分類系統包括檢測CALR、KPNA2、HDAC3、NDC1、SP100、BCCIP和DDX25這七種基因表達值的系統和基因表達值數據處理系統；

所述檢測CALR、KPNA2、HDAC3、NDC1、SP100、BCCIP和DDX25這七種基因表達值的系統包括通過RNA-seq檢測這七種基因表達值所需的試劑和/或儀器；所述試劑包括以樣本mRNA為模板合成cDNA所需的正向和/或反向引物，所述引物序列如SEQ ID No.1- SEQ ID No.14所示；

所述基因表達值數據處理系統用于將來自生存預測的膠質瘤患者樣本中所述七種基因表達值轉換為膠質瘤患者的核轉運風險評分，再根據膠質瘤患者的核轉運風險評分對待測膠質瘤患者生存預測進行預后分類；基因表達值為FPKM值；所述膠質瘤患者的核轉運風險評分的計算方法為：CALR、KPNA2、HDAC3、NDC1、SP100、BCCIP和DDX25這七種基因每個基因的FPKM表達值與對應相關系數的乘積再求和；每個基因對應相關系數：CALR相關系數是0.000105，KPNA2相關系數是0.01038，HDAC3相關系數是0.027311，NDC1相關系數是0.032613，SP100相關系數是0.112187，BCCIP相關系數是-0.07376，DDX25相關系數是-0.00588；核轉運風險評分小于0.078的為NTRS Low；核轉運風險評分大于等于0.078為NTRSHigh。

2.根據權利要求1所述膠質瘤患者生存預測的預后分類系統，其特征在于，所述膠質瘤患者生存預測的預后分類系統還包括輸入膠質瘤患者的IDH突變狀態和1p/19q缺失狀態；所述IDH突變狀態分為IDH野生型和IDH突變型；所述1p/19q缺失狀態分為1p/19q共缺失和非共缺失。

3.根據權利要求2所述膠質瘤患者生存預測的預后分類系統，其特征在于，所述預后分類系統中應用的預后分類方法為：

a.膠質瘤患者屬于IDH突變型，且1p/19q共缺失的為預后好；

b.膠質瘤患者屬于IDH突變型，且1p/19q非共缺失、核轉運風險評分為NTRS Low的預后較好；

c.膠質瘤患者屬于IDH突變型，且1p/19q非共缺失、核轉運風險評分為NTRS High的預后一般；

d.膠質瘤患者屬于IDH野生型，核轉運風險評分為NTRS Low的預后一般；

e.膠質瘤患者屬于IDH野生型，核轉運風險評分為NTRS High的預后較差。