[發(fā)明專利]一種分子信標(biāo)、其構(gòu)建方法及應(yīng)用有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010694129.2 | 申請日: | 2020-07-17 |
| 公開(公告)號: | CN111856010B | 公開(公告)日: | 2023-09-22 |
| 發(fā)明(設(shè)計)人: | 張志慶;劉娜娜;楊春天;王芳;張國棟;周亭;王秀鳳 | 申請(專利權(quán))人: | 中國石油大學(xué)(華東);安丘市增塑劑廠 |
| 主分類號: | G01N33/573 | 分類號: | G01N33/573;G01N33/533;G01N33/574;G01N21/64 |
| 代理公司: | 北京金信知識產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11225 | 代理人: | 李雪芹;徐琳 |
| 地址: | 266580 山*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 一種 分子 信標(biāo) 構(gòu)建 方法 應(yīng)用 | ||
1.一種檢測凝血酶的方法,所述方法包括以下步驟:
1)檢測液的制備:將含分子信標(biāo)、Tris-HCl?pH=8.0、Na+、Mg2+的溶液置于離心管中,加入ddH2O稀釋,然后將溶液混勻、離心,等量分裝至PCR離心管中進行梯度退火,
其中,所述分子信標(biāo)包括:
兩條寡核苷酸鏈,
其中,
所述兩條寡核苷酸鏈中的一條為主鏈單鏈,其核苷酸序列包括:5’?端連接序列、適配體序列以及3’?端連接序列,所述主鏈單鏈在?5’?端和?3’?端分別標(biāo)記淬滅基團和熒光基團或者在5’?端和?3’?端分別標(biāo)記熒光基團和淬滅基團,并且所述主鏈單鏈具有SEQ?IDNO.2的序列;
述兩條寡核苷酸鏈中的另一條為互補短鏈cDNA,其無任何修飾基團,所述互補短鏈cDNA包含與所述主鏈單鏈中的5’?端連接序列的部分或全部互補的5’?端互補序列、和與所述主鏈單鏈中的3’?端連接序列的部分或全部互補的3’?端互補序列,以使所述淬滅基團和所述熒光基團不分開其中,所述互補短鏈cDNA在主鏈單鏈的5’?端和3’?端與主鏈單鏈互補的堿基的個數(shù)分別不低于8個,并且所述短鏈cDNA具有SEQ?ID?NO.3或SEQ?ID?NO.4的序列;
2)線性方程的構(gòu)建:通過固定分子信標(biāo)的濃度,也即,體系中主鏈單鏈的最終濃度,改變凝血酶的濃度制備一系列溶液,用熒光分光光度計測定加入凝血酶前后的溶液在518nm熒光峰值強度,以凝血酶濃度x以及(F-F0)/F0構(gòu)建線性方程,其中凝血酶濃度x的單位為mol/L,F(xiàn)表示加入凝血酶的溶液在518nm的熒光峰值強度,F(xiàn)0表示未加凝血酶的溶液在518nm的熒光峰值強度;
3)凝血酶的測定:測定待測的凝血酶在518nm熒光峰值強度,并代入上述線性方程,計算得到凝血酶的濃度。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,在步驟1)中,主鏈與短鏈cDNA的比例為1:1-1:10。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,在步驟2)和步驟3)中,熒光分光光度計的激發(fā)波長設(shè)置為490nm,發(fā)射掃描范圍為500~600nm,激發(fā)和發(fā)射狹縫分別為2.5nm和5nm,掃描速度是300nm/min。
4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,在步驟1)至步驟3)中,Mg2+的濃度為1-10mM。
5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,在步驟1)至步驟3)中,Mg2+的濃度為5mM。
6.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,在步驟2)中,固定分子信標(biāo)的濃度為100nM,改變?nèi)薚hrombin濃度,37℃孵育30min,測定體系在518nm熒光峰值強度。
7.?根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其中,
所述淬滅基團為Dabcyl,所述熒光基團為FAM,或者
所述淬滅基團為BHQ2,所述熒光基團為Cy5。
8.一種分子信標(biāo),所述分子信標(biāo)包括:
兩條寡核苷酸鏈,
其中,
所述兩條寡核苷酸鏈中的一條為主鏈單鏈,其核苷酸序列包括:5’?端連接序列、適配體序列以及3’?端連接序列,所述主鏈單鏈在?5’?端和?3’?端分別標(biāo)記淬滅基團和熒光基團或者在5’?端和?3’?端分別標(biāo)記熒光基團和淬滅基團,并且所述主鏈單鏈具有SEQ?IDNO.2的序列;
所述兩條寡核苷酸鏈中的另一條為互補短鏈cDNA,其無任何修飾基團,所述互補短鏈cDNA包含與所述主鏈單鏈中的5’?端連接序列的部分或全部互補的5’?端互補序列、和與所述主鏈單鏈中的3’?端連接序列的部分或全部互補的3’?端互補序列,以使所述淬滅基團和所述熒光基團不分開,并且所述短鏈cDNA具有SEQ?ID?NO.3或SEQ?ID?NO.4的序列。
9.?根據(jù)權(quán)利要求8所述的分子信標(biāo),其中,
所述淬滅基團為Dabcyl,所述熒光基團為FAM,或者
所述淬滅基團為BHQ2,所述熒光基團為Cy5。
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