[發明專利]核酸樣本檢測方法及裝置、存儲介質及電子設備在審
| 申請號: | 202010692569.4 | 申請日: | 2020-07-17 |
| 公開(公告)號: | CN111816256A | 公開(公告)日: | 2020-10-23 |
| 發明(設計)人: | 唐向榮 | 申請(專利權)人: | 上海康派尼恩醫療科技有限公司 |
| 主分類號: | G16B30/00 | 分類號: | G16B30/00;G16B20/10;C12Q1/6844 |
| 代理公司: | 北京律智知識產權代理有限公司 11438 | 代理人: | 孫寶海;闞梓瑄 |
| 地址: | 201321 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 核酸 樣本 檢測 方法 裝置 存儲 介質 電子設備 | ||
1.一種核酸樣本循環擴增效率檢測方法,其特征在于,包括:
獲取核酸樣本在循環擴增反應中的熒光基線值FB;
獲取所述核酸樣本在每輪循環擴增反應的熒光值Fn,其中n=1,…,N,N為正整數;
根據所述熒光基線值FB和所述熒光值Fn獲得所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln;
根據所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln確定循環擴增反應的最優效率檢測輪次k,k為正整數;
根據(Fk-FB)/(Fk-1-FB)獲得所述核酸樣本的擴增效率。
2.根據權利要求1所述的檢測方法,其特征在于,所述根據所述熒光基線值FB和所述熒光值Fn獲得所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln包括:
根據(Fn-FB)×(Fn-2-FB)/(Fn-1-FB)2獲得所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln。
3.根據權利要求1或2所述的檢測方法,其特征在于,所述根據所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln確定循環擴增反應的最優效率檢測輪次k包括:
從后向前依次查看各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln,當循環擴增反應的熒光增長效率的變化率從逐漸下降轉為逐漸上升后,選取上升過程中熒光值增長的變化率最趨近于1的第k輪循環擴增反應,作為所述最優效率檢測輪次k。
4.根據權利要求1或2所述的檢測方法,其特征在于,所述核酸樣本在第n輪循環擴增反應的熒光增長效率表示為:
Rn/Rn-1=(Fn-FB)/(Fn-1-FB)。
5.根據權利要求1或2的檢測方法,其特征在于,還包括:
采用qPCR儀對所述核酸樣本進行循環擴增反應;
采用qPCR儀檢測所述核酸樣本在循環擴增反應基線期的熒光基線值FB和在每輪循環擴增反應的熒光值Fn。
6.根據權利要求1或2的檢測方法,其特征在于,所述根據所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln確定循環擴增反應的最優效率檢測輪次k包括:
根據所述核酸樣本在各輪循環擴增反應的熒光增長效率的變化率Ln確定循環擴增反應的指數增長期;
確定所述循環擴增反應的指數增長期中熒光值增長的變化率最趨近于1的第k輪循環擴增反應,作為所述最優效率檢測輪次k。
7.一種核酸樣本檢測方法,其特征在于,包括:
分別獲取標準品的循環閾值CTC和待測樣本的循環閾值CTS;
根據權利要求1至6中任意一項所述的核酸樣本循環擴增效率的檢測方法獲得所述標準品的擴增效率EC和所述待測樣本的擴增效率ES;
獲取所述標準品的拷貝數XC;
根據所述標準品的拷貝數XC、循環閾值CTC、擴增效率EC和所述待測樣本的循環閾值CTS、擴增效率ES獲取所述待測樣本的拷貝數XS。
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