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[發明專利]以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸試劑盒及其檢測方法在審

專利信息
申請號: 202010660621.8 申請日: 2020-07-10
公開(公告)號: CN111778356A 公開(公告)日: 2020-10-16
發明(設計)人: 滕新棟;張瑾;趙風源;劉海江;陳曉光;張娟;梁潔;郭寧;孫燕茹 申請(專利權)人: 青島國際旅行衛生保健中心(青島海關口岸門診部)
主分類號: C12Q1/70 分類號: C12Q1/70;C12Q1/6865;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 北京開林佰興專利代理事務所(普通合伙) 11692 代理人: 劉帥帥
地址: 266071 山*** 國省代碼: 山東;37
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 基因 基礎 nasba 技術 檢測 病毒 核酸 試劑盒 及其 方法
【權利要求書】:

1.以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸序列特異性擴增引物,其特征在于,序列如下:

F:AATTCTAATACGACTCACTATAGGGGTGATGCTGCTCTTGCTT;

R:TTCCTTGGGTTTGTTCTG。

2.以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸試劑盒,其特征在于,它包括如下成分:

1)新冠病毒N基因序列檢測特異性擴增引物

F:AATTCTAATACGACTCACTATAGGGGTGATGCTGCTCTTGCTT;

R:TTCCTTGGGTTTGTTCTG;

2)NASBA反應體系:

反應液Ⅰ(20 μL):

10 ×NASBA buffer[40 mmol /L Tris-HCl(pH 8.5 @ 25℃),100 mmol/L KCl,12mmol/L MgCl2,5 mmol/L DTT]2.0 μL,

DMSO 2.5 μL,

模板RNA 5 μL,

引物F( 10 μmol /L) 0.5 μL,

引物R( 10 μmol /L) 0.5 μL,

dNTPs ( 2.5 mmol /L) 0.5 μL,

NTPs ( 2.5 mmol /L) 1.0 μL,

用水補至20 μL;

反應液Ⅱ(5 μL):

10 ×NASBA buffer[40 mmol /L Tris-HCl(pH 8.5,25℃),100 mmol/L KCl,12mmol/L MgCl2,5 mmol/L DTT]0.5 μL,

BSA( 20 mg /ml) 0.125 μL,

T7 RNA 聚合酶( 50000 U /mL) 0.8 μL,

AMV 反轉錄酶( 10000 U /mL) 0.8 μL,

RNase 抑制劑( 40000 U /mL) 0.5 μL,

RNaseH ( 500 U /mL)0.4 μL,用水補至 5 μL。

3.以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸方法,其特征在于,它包括如下步驟:

1)以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒的RNA獲取

使用TaKaRa MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0試劑盒(TaKaRa公司)提取滅活新冠病毒的RNA核酸;

2)NASBA反應體系:

反應液Ⅰ(20 μL):

10 ×NASBA buffer[40 mmol /L Tris-HCl(pH 8.5,25℃),100 mmol/L KCl,12mmol/L MgCl2,5 mmol/L DTT]2.0 μL,

DMSO 2.5 μL,

模板RNA 5 μL,

引物F( 10 μmol /L) 0.5 μL,

引物R( 10 μmol /L) 0.5 μL,

dNTPs ( 2.5 mmol /L) 0.5 μL,

NTPs ( 2.5 mmol /L) 1.0 μL,

用水補至20 μL;

反應液Ⅱ(5 μL):

10 ×NASBA buffer[40 mmol /L Tris-HCl(pH 8.5 , 25℃),100 mmol/L KCl,12mmol/L MgCl2,5 mmol/L DTT]0.5 μL,

BSA( 20 mg /ml) 0.125 μL,

T7 RNA 聚合酶( 50000 U /mL) 0.8 μL,

AMV 反轉錄酶( 10000 U /mL) 0.8 μL,

RNase 抑制劑( 40000 U /mL) 0.5 μL,

RNaseH ( 500 U /mL)0.4 μL,用水補至 5 μL;

3)以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸反應程序:

反應液Ⅰ在65℃水浴中孵育5 min,再迅速放入41℃水浴中孵育5 min,然后把反應液Ⅱ迅速加入反應液Ⅰ,小心混勻,置于41℃水浴中孵育90 min;

反應結束后,-20 ℃終止反應。取Low Range RNA Ladder中配備的2× RNA LoadingDye與NASBA產物等量混合,70 ℃ 加熱10 min,放于-20 ℃冷卻3 min。Low Range RNALadder 70 ℃加熱10 min,-20 ℃冷卻3 min,每個孔需要4 μL;

4)以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸的特異性

以中東呼吸綜合癥病毒(MERS)核酸、人冠狀病毒229E核酸、流感病毒核酸和陰性對照為對照,確定以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸的特異性;

5)以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸的靈敏性

將新冠病毒核酸原液使用分光光度計測定濃度,然后進行倍比稀釋到十位拷貝數/μL,確定以N基因為基礎的NASBA技術檢測新冠病毒核酸的靈敏性。

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