[發明專利]唐菖蒲伯克霍爾德氏菌熒光定量PCR內參基因及其引物的篩選和應用

有效

• 申請號: 202010595646.4
• 申請日: 2020-06-28
• 公開（公告）號: CN111705149B
• 公開（公告）日: 2022-02-15
• 發明（設計）人: 李曉丹;汪仁;徐晟;王蓉;江玉梅;周正雄;李宜奎;王松鳳
• 申請（專利權）人: 江蘇省中國科學院植物研究所
• 主分類號: C12Q1/689
• 分類號: C12Q1/689;C12Q1/6851;C12Q1/6809;G16B40/00;G16B25/10;G16B25/20;G16B30/10;G16B20/00;G16B20/20;C12R1/01
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1.clpX和lpxC基因作為內參基因在利用熒光定量PCR檢測唐菖蒲伯克霍爾德氏菌毒黃素合成轉運相關基因的表達中的應用，其特征在于，所述clpX基因作為培養基不同初始pH值、不同培養時間、不同培養溫度和培養基中不同濃度NaCl培養所述唐菖蒲伯克霍爾德氏菌條件下最穩定的內參基因，所述lpxC基因作為培養基中不同濃度NaCl培養所述唐菖蒲伯克霍爾德氏菌條件下最穩定的內參基因；

所述clpX基因的qRT-PCR引物堿基序列為：正向引物clpX-F如SEQ ID NO:5所示，反向引物clpX-R如SEQ ID NO:6所示；

所述lpxC基因的qRT-PCR引物堿基序列為：正向引物lpxC-F如SEQ ID NO:11所示，反向引物lpxC-R如SEQ ID NO:12所示，所述唐菖蒲伯克霍爾德氏菌為菌株HDXY-02和CICC10574，所述菌株HDXY-02的保藏號為CGMCC NO.14054，所述應用為非診斷治療目的。

2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，以菌株 HDXY-02和CICC 10574為樣本，以毒黃素合成基因簇toxA、toxB、toxC、toxD、toxE基因和轉運基因簇toxF、toxG、toxH和toxI為目的基因，以所述clpX基因為內參基因，檢測菌株HDXY-02和CICC 10574在培養基不同初始pH值、培養時間、培養溫度和培養基中不同濃度NaCl條件下的毒黃素合成轉運相關基因的表達。

3.根據權利要求1所述的應用，其特征在于，所述lpxC作為檢測菌株CICC 10574在培養基中不同濃度NaCl條件下毒黃素合成轉運相關基因表達的內參基因。