[發(fā)明專利]用于確定對(duì)蛋白質(zhì)的功能的影響的方法和系統(tǒng)

有效

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010586852.9
• 申請(qǐng)日: 2014-08-19
• 公開（公告）號(hào): CN111710434B
• 公開（公告）日: 2021-10-26
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 金周漢;白水蓮;李秀娟
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 塞弗歐米公司
• 主分類號(hào): G16H70/40
• 分類號(hào): G16H70/40;G16B20/20
• 代理公司: 北京英賽嘉華知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限責(zé)任公司 11204
• 代理人: 王達(dá)佐;洪欣

本發(fā)明涉及利用個(gè)人基因組堿基序列分析、基于個(gè)人蛋白質(zhì)損傷信息、進(jìn)行個(gè)性化的藥物選擇的方法及系統(tǒng)，本發(fā)明的方法及系統(tǒng)作為可通過對(duì)參與規(guī)定藥物或藥物組的藥效學(xué)或藥動(dòng)學(xué)的多種蛋白質(zhì)進(jìn)行編碼的基因外顯子區(qū)域的序列分析來預(yù)測(cè)個(gè)人對(duì)特定藥物的副作用或危險(xiǎn)性的技術(shù)，是可靠度高且適用范圍廣泛的通用技術(shù)。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及利用個(gè)人基因組堿基序列分析的基于個(gè)人蛋白質(zhì)損傷信息的個(gè)性化的藥物選擇方法及系統(tǒng)。

背景技術(shù)

隨著生命工程技術(shù)發(fā)展，當(dāng)前，達(dá)到了分析人類的全基因組堿基序列(wholegenome sequence)來預(yù)測(cè)每個(gè)人的疾病，并提供個(gè)性化的進(jìn)行疾病預(yù)防及治療的步驟。

最近，比較個(gè)人基因組堿基序列，最終發(fā)現(xiàn)在染色體的相同位置存在互不相同的堿基，因此，將這種堿基序列的差異用于預(yù)測(cè)對(duì)藥品的個(gè)人之間反應(yīng)差異。例如，根據(jù)一個(gè)人所具有的特定基因組堿基序列信息，藥物代謝快或慢，因而每個(gè)人對(duì)藥物的療效及副作用有可能不同。

因此，可利用個(gè)人基因組堿基序列差異來個(gè)性化的選擇適合患者的藥物及其用量的社會(huì)需求增加，且將單核苷酸多態(tài)性(SNP，Single Nucleotide Polymorphism)等的基因組信息利用為標(biāo)記，并利用相應(yīng)標(biāo)記和藥物反應(yīng)/藥物副作用等的相互關(guān)系的研究結(jié)果的藥物遺傳學(xué)或藥物基因組學(xué)正在逐漸備受矚目。

在藥物遺傳學(xué)(pharmacogenetics)中，以遺傳學(xué)方式分析一般人口群體或個(gè)人的、藥物或化學(xué)物質(zhì)的、代謝和反應(yīng)差異來預(yù)測(cè)。在一部分個(gè)人中，還出現(xiàn)除了對(duì)藥物預(yù)想的藥物反應(yīng)之外的其他反應(yīng)，這種藥物副作用由治療的疾病的重癥度、藥物相互作用、患者的年齡、營養(yǎng)狀態(tài)、肝及腎臟功能、氣候或食物之類的環(huán)境因素引起。但是，這種藥物副作用也可能由藥物代謝相關(guān)的遺傳差異引起，例如，代謝酶基因的多態(tài)性(polymorphism)，因而正在進(jìn)行與其相關(guān)的研究。

例如，在韓國公開特許第2007-0111475號(hào)中公開了用于在慢性便秘患者中確認(rèn)替加色羅的功效的生物標(biāo)記相關(guān)技術(shù)，評(píng)價(jià)了在選擇利用藥物遺傳學(xué)可預(yù)測(cè)對(duì)替加色羅(Zelmac(注冊(cè)商標(biāo))/Zelnorm(注冊(cè)商標(biāo)))的慢性便秘患者反應(yīng)的候選基因時(shí)的多態(tài)性的影響。

另一方面，在個(gè)人基因組堿基序列變異和疾病的相關(guān)性調(diào)查中，利用統(tǒng)計(jì)不容易查找疾病預(yù)測(cè)標(biāo)記。這是因?yàn)榫哂薪y(tǒng)計(jì)顯著性的大部分單核苷酸多態(tài)性不僅對(duì)疾病發(fā)展產(chǎn)生微弱的影響(odds ratio 1.1～1. 5)，而且位于內(nèi)含子及基因之間區(qū)域等，從而難以推論其功能相關(guān)性 (Hindorff et al.，Proc.Natl.Acad.Sci.2009；106(23)：9362-93 67)。

因此，超過根據(jù)利用單核苷酸多態(tài)性之類的標(biāo)記的人口群體觀察研究結(jié)果的方法，強(qiáng)烈提出需要導(dǎo)入如下方法論，即，直接應(yīng)用個(gè)人基因組堿基序列變異信息來執(zhí)行對(duì)伴隨其的蛋白質(zhì)損傷和其生物學(xué)影響的理論性推論，從而提供更有用且可靠的個(gè)人個(gè)性化的藥物選擇信息。

發(fā)明內(nèi)容

技術(shù)問題

本發(fā)明考慮如上所述的問題而提出，本發(fā)明提供如下方法及系統(tǒng)，分析個(gè)人基因組堿基序列變異信息，并從參與規(guī)定藥物或藥物組的藥效學(xué)或藥動(dòng)學(xué)的基因堿基序列變異信息計(jì)算個(gè)人蛋白質(zhì)損傷分?jǐn)?shù)后，將其與藥物和蛋白質(zhì)之間的相互關(guān)系建立關(guān)聯(lián)，來計(jì)算個(gè)人藥物分?jǐn)?shù)，從而提供用于進(jìn)行個(gè)性化的藥物選擇的信息。

解決問題的手段