[發(fā)明專利]一種篩選檢測少弱精癥相關蛋白標志物的方法及其應用在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010580098.8 | 申請日: | 2020-06-23 |
| 公開(公告)號: | CN111707748A | 公開(公告)日: | 2020-09-25 |
| 發(fā)明(設計)人: | 黃寧;張曼玉;劉曉;孫勝楠;韓超 | 申請(專利權)人: | 山東立菲生物產(chǎn)業(yè)有限公司 |
| 主分類號: | G01N30/02 | 分類號: | G01N30/02;G01N30/06;G01N30/34;G01N30/36;G01N30/72;G01N30/74;G01N30/88;G01N33/68 |
| 代理公司: | 濟南圣達知識產(chǎn)權代理有限公司 37221 | 代理人: | 宋海海 |
| 地址: | 266000 山東省青島*** | 國省代碼: | 山東;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 一種 篩選 檢測 少弱精癥 相關 蛋白 標志 方法 及其 應用 | ||
1.一種篩選檢測少弱精癥相關蛋白標志物的方法,其特征在于,所述方法包括:
(1)提取精子細胞全蛋白;
(2)將精子細胞全蛋白利用基于超濾輔助樣品制備方法進行酶解,對酶解后的肽段進行脫鹽,制備得到樣品混合肽段;
(3)對步驟(2)的樣品混合肽段采用高效液相色譜進行分離得各分離樣品;
(4)將步驟(3)獲得的分離的樣品采用納流液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜分析;
(5)對質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行UNIPROT數(shù)據(jù)庫檢索,以檢測特異肽段數(shù)進行初篩,然后以BSA蛋白信號強度為標準,計算每個樣本中蛋白的相對檢測豐度;將正常個體與少弱精個體的蛋白按照其相對檢測豐度進行篩選,從而得到差異蛋白,從而得到少弱精癥相關蛋白標志物。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(1)中,提取精子細胞全蛋白的具體方法包括:
將精子樣本采用DPBS洗滌,加入RIPA裂解液超聲,置于低溫孵育裂解,離心,取上層蛋白質(zhì)清液,測定清液中蛋白濃度;
優(yōu)選的,加入RIPA裂解液超聲1~2min;
低溫孵育裂解具體為:置于冰上孵育20~30min裂解;
離心具體方法為:在12,000~15,000g離心10~30min;優(yōu)選為14,000g離心20min。
3.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(2)中,利用基于超濾輔助樣品制備方法對蛋白進行酶解具體為:
在超濾管中加入上述上層蛋白質(zhì)清液,震蕩,離心,加入尿素,繼續(xù)震蕩離心;加入NH4HCO3震蕩離心;更換超濾管套管,加入BSA,并加入NH4HCO3溶液,再加入胰蛋白酶,過夜消化。
4.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(2)中,對酶解后的肽段進行脫鹽采用ziptip法進行。
5.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(3)中,高效液相色譜分離具體方法為:
樣品混合肽段用A相溶解后過柱分離,流動相梯度設置為:0-3min,100%A相,3-25min,流速始終保持為0.7mL/min;紫外檢測器UV設置為214nm,根據(jù)樣品分離的色譜圖,在10min時離心管收集液相分離餾分,每管收集1min,并按照收集的時間順序?qū)M分編號;將組分真空干燥;用乙腈水混合液溶解并交叉合并,將最終得到的組分真空干燥,低溫貯存?zhèn)溆茫?/p>
優(yōu)選的,過柱采用色譜柱為C18 XBridge BEH-130柱;
優(yōu)選的,流動相中,
A相:2%CH3CN,98%H2O,NH3H2O調(diào)pH 10.0;
B相:98%CH3CN,2%H2O。
6.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述步驟(4)中,采用納流液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜分析具體方法為:
每個樣品分別用A相溶解,樣品分離之前分別用A相平衡自制的預柱和分析柱;平衡后樣品在A相的帶動下首先載樣于預柱,然后在不同梯度下進行液相分離;
150min色譜梯度變化如下:5-32%流動相B 100min,32-80%流動相B,20min,80%流動相B,30min.流速始終保持在300nL/min。
質(zhì)譜檢測條件:350-1800m/z的全掃描,分辨率為60,000(m/z 200)。二級圖譜掃描時,活化時間為10ms,隔離寬度為2m/z。碎裂方式為誘導碰撞解離,歸一化碰撞能量設定為35%,動態(tài)排出時間為90s;
納流液相色譜分離:A相:10%CH3CN,90%H2O,1%甲酸;B相:1%甲酸溶解在90%CH3CN,10%H2O。
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