[發(fā)明專利]基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010569274.8
• 申請(qǐng)日: 2020-06-20
• 公開（公告）號(hào): CN111584009A
• 公開（公告）日: 2020-08-25
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 黃燕;方垂;王理想;周健;廖偉;劉燕晨
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 深圳市微納菲生物技術(shù)有限公司;重慶醫(yī)科大學(xué)
• 主分類號(hào): G16B40/10
• 分類號(hào): G16B40/10;G16B20/00;G16B25/00;G01N33/68;G01N27/62
• 代理公司: 深圳市凱博企服專利代理事務(wù)所(特殊普通合伙) 44482
• 代理人: 李夢(mèng)男

1.一種基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法，其特征在于：所述方法包含下述步驟：

步驟1，對(duì)大鼠大腦前額葉皮層分離與蛋白提取；

步驟2，對(duì)步驟1所得的蛋白樣品進(jìn)行FASP法酶解、多肽iTRAQ標(biāo)記、SCX分級(jí)及LC-MS/MS質(zhì)譜分析；

步驟3，對(duì)步驟2得到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行搜庫(kù)與生物信息學(xué)分析；

步驟4，對(duì)步驟3得到的差異蛋白進(jìn)行PRM技術(shù)驗(yàn)證。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法，其特征在于，所述步驟1中，對(duì)大鼠大腦前額葉皮層分離與蛋白提取的具體步驟為：分別取4個(gè)不同分組的大鼠前額葉腦組織，進(jìn)行稱重、勻漿和離心處理，進(jìn)行BCA法測(cè)定蛋白濃度與SDS-PAGE電泳檢測(cè)。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法，其特征在于：所述步驟2是在步驟1蛋白濃度測(cè)定后各組樣品分別取100ug蛋白，進(jìn)行FASP酶切，按照iTRAQ試劑盒說明書進(jìn)行肽段標(biāo)記，SCX高pH分級(jí)，并進(jìn)一步進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法，其特征在于：所述步驟3是將質(zhì)譜采集的原始數(shù)據(jù)用Proteome Discoverer進(jìn)行搜庫(kù)并以p≤0.05進(jìn)行數(shù)據(jù)過濾；將過濾后的蛋白以差異倍數(shù)≥1.2或≤0.83，p≤0.05進(jìn)行差異分析，得到的差異蛋白進(jìn)行生信分析。

5.根據(jù)權(quán)利要求1所述的基于蛋白質(zhì)組學(xué)研究抑郁或焦慮癥大鼠蛋白質(zhì)組變化方法，其特征在于：所述步驟4是將步驟3得到的差異蛋白挑選對(duì)應(yīng)的特征多肽，每個(gè)蛋白保留1-3條特征多肽，針對(duì)差異蛋白的特征多肽進(jìn)行質(zhì)譜靶向定量分析。