[發明專利]一種夏南牛HMGA2基因Indel標記的檢測方法及應用有效
| 申請號： | 202010550697.5 | 申請日： | 2020-06-16 |
| 公開（公告）號： | CN111560421B | 公開（公告）日： | 2023-05-30 |
| 發明（設計）人： | 陳宏;曹修凱;程杰;王曉剛;黃永震;藍賢勇;雷初朝 | 申請（專利權）人： | 西北農林科技大學 |
| 主分類號： | C12Q1/6858 | 分類號： | C12Q1/6858;C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 西安通大專利代理有限責任公司 61200 | 代理人： | 范巍 |
| 地址： | 712100 陜*** | 國省代碼： | 陜西;61 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 夏南牛 hmga2 基因 indel 標記 檢測 方法 應用 | ||
1.一種夏南牛HMGA2基因插入缺失突變的檢測方法在夏南牛分子育種中的應用，其特征在于：所述夏南牛HMGA2基因插入缺失突變的檢測方法，包括以下步驟：
以待測夏南牛基因組DNA為模板，PCR擴增夏南牛HMGA2基因部分片段，對擴增產物進行瓊脂糖凝膠電泳，根據瓊脂糖凝膠電泳結果鑒定夏南牛HMGA2基因插入缺失突變位點的基因型；所述插入缺失突變位點位于牛HMGA2基因chr5:48094736-48094742。
2.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述PCR的擴增引物為：
上游引物：5’-CAGGTGGTGTTCAGATCTGCTCTG-3’；
下游引物：5’-CAGGTTGTCTGAGGTCCATCG-3’。
3.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述PCR的擴增體系包括50ng/μL模板DNA1.0μL以及10pmol/L的上、下游引物各1μL。
4.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述PCR的擴增反應程序為：95℃預變性5min；94℃變性30s，58℃退火30s，72℃延伸20s，35個循環；72℃延伸10min。
5.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述瓊脂糖凝膠電泳采用質量濃度為4％的瓊脂糖凝膠。
6.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：所述插入缺失突變位點的基因型為：插入/插入型表現為112bp的一個條帶；插入/缺失型表現為112bp和105bp的兩個條帶；缺失/缺失型表現為105bp的一個條帶。
7.根據權利要求1所述的應用，其特征在于：在早期分子標記輔助選擇中，以所述插入缺失突變位點的基因型為缺失/缺失型的個體形成體型高大的夏南牛種群。
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