[發明專利]一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記及其應用

有效

• 申請號: 202010511140.0
• 申請日: 2020-06-08
• 公開（公告）號: CN111560460B
• 公開（公告）日: 2022-08-23
• 發明（設計）人: 董志敏;劉念析;厲志;劉佳;衣志剛;陳亮;劉浩;王博
• 申請（專利權）人: 吉林省農業科學院
• 主分類號: C12Q1/6895
• 分類號: C12Q1/6895;C12N15/11
• 代理公司: 北京高沃律師事務所 11569
• 代理人: 董大媛

本發明提供了一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記及其應用，涉及SNP標記技術領域。本發明公開了一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記、檢測引物組、試劑盒以及應用，所述的SNP標記，包括第一SNP標記Gm16_33764982和第二SNP標記Gm16_33879496。本發明通過KASP SNP標記技術檢測大豆基因型，根據基因型即可不受環境、生育時期和抗病接種相關復雜操作等限制，高效節本地鑒定出抗灰斑病7號生理小種的大豆品種，從而提高大豆抗病育種效率。

技術領域

本發明屬于SNP標記技術領域，具體涉及一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記及其應用。

背景技術

大豆灰斑病是世界性病害，也是我國黑龍江、內蒙和吉林省大豆主產區的主要流行病害。一般病害發生年份，感病品種可減產12～15％，嚴重發生年份甚至可減產30～50％；而且種子的蛋白含量平均降低1.2％，脂肪含量平均降低2.9％，種子的出苗率也降低。針對該病害，我國一直采用的是人工接種鑒定抗性的傳統抗灰斑病育種方法。但是人工接種的技術含量高，工作量大，周期長，病原菌發病受環境影響，導致傳統的大豆抗灰斑病育種效率低。

隨著分子生物學技術的飛速發展，分子育種技術大大加快了抗病育種的進程，顯著縮短了抗病新品種的選育周期。分子育種的前提是獲得與目標性狀密切相關的分子標記或功能基因。然而，目前還未找到與大豆灰斑病抗性直接相關的功能基因；即使遺傳定位到幾個大豆灰斑病抗性相關的分子標記，標記與目標基因距離較遠，鑒定抗性不夠準確，還難以實現分子水平上較為準確地鑒定大豆抗灰斑病性狀。

發明內容

有鑒于此，本發明的目的在于提供一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記及其應用，對大豆性狀鑒定不受環境條件和樣本組織生育時期的影響，且檢測周期短、靈敏度高。

為了實現上述發明目的，本發明提供以下技術方案：

本發明提供了一組與大豆抗灰斑病7號生理小種性狀相關的SNP標記，所述SNP標記包括第一SNP標記Gm16_33764982和第二SNP標記Gm16_33879496；所述的第一SNP標記Gm16_33764982在大豆基因組的第16號染色體33764982位置的堿基為A或T；所述第二SNP標記Gm16_33879496在大豆基因組的第16號染色體33879496位置的堿基為A或C。

優選的，當所述第一SNP標記Gm16_33764982處堿基和第二SNP標記Gm16_33879496處堿基均為A時，大豆為抗灰斑病7號生理小種；當第一SNP標記Gm16_33764982處堿基為T，且第二SNP標記Gm16_33879496處堿基為C時，大豆為感灰斑病7號生理小種。

優選的，所述大豆基因組的全基因組序列版本為大豆基因組v2.0。

本發明還提供了一組用于檢測所述SNP標記的KASP引物組，檢測所述第一SNP標記Gm16_33764982的引物組包括：FAM1引物、VIC1引物和COM1引物，所述FAM1引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，VIC1引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，COM1引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示；

檢測所述第二SNP標記Gm16_33879496的引物組包括：FAM2引物、VIC2引物和COM2引物，所述FAM2引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，VIC2引物的核苷酸序列如SEQ IDNO.5所示，COM2引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。

本發明還提供了一組用于檢測大豆抗灰斑病7號生理小種性狀的試劑盒，所述試劑盒中包括所述KASP引物組。

本發明還提供了所述SNP標記或所述KASP引物組或所述試劑盒在大豆抗灰斑病性狀分子標記輔助育種中的應用。