[發(fā)明專利]一種肝癌預測模型的構建及應用

有效

• 申請?zhí)枺?/td>: 202010188055.5
• 申請日: 2020-03-17
• 公開（公告）號: CN111321229B
• 公開（公告）日: 2020-12-11
• 發(fā)明（設計）人: 趙鑫;張穎;劉文鵬;曹經琳;曾強;王洋;劉寶旺;崔自強;滕亮;張軍紅;高慶軍;竇劍
• 申請（專利權）人: 河北醫(yī)科大學第三醫(yī)院
• 主分類號: C12Q1/6886
• 分類號: C12Q1/6886
• 代理公司: 北京預立生科知識產權代理有限公司 11736
• 代理人: 孟祥斌

本發(fā)明涉及一種肝癌預測模型的構建及應用。申請人構建了肝癌的預測模型并進行了驗證，結果顯示，本申請構建的模型不僅具有很好的普適性，適用于各種生物信息學算法，并且準確性和靈敏度都很高。本申請?zhí)峁┑哪Ｐ蜑榕R床肝癌的診斷奠定基礎。

技術領域

本發(fā)明涉及分子生物學研究及生物信息學研究領域，具體的涉及一種肝癌預測模型的構建及其應用。

背景技術

肝癌(hepatocellular carcinoma，HCC)是我國乃至世界范圍內最常見的實體惡性腫瘤之一，目前針對肝癌的治療手段主要包括手術切除、肝移植、射頻消融、經肝動脈化療栓塞術等，肝癌患者的生存期延長，生存質量得到一定改善。然而，由于肝癌起病及進展隱匿，發(fā)現時往往己失去手術機會，且復發(fā)及轉移率仍居高不下，總體預后仍較差。因此，迫切需要尋找新的診斷和治療方法，尤其是早期診斷，來提高患者的生存質量。

MicroRNAs(miRNA)是一類短小(長度約為22個核苷酸)的非編碼RNA分子，通過破壞mRNA的穩(wěn)定結構或通過抑制翻譯調節(jié)基因的表達而發(fā)揮作用。有報道顯示miRNA與肝癌的發(fā)生和發(fā)展密切相關，在癌組織中存在顯著的差異表達，有的miRNA在肝癌組織中上調表達，有促進腫瘤生長、增殖和轉移的作用；有的miRNA在肝癌組織中下調表達，有抑制腫瘤生長、增殖和轉移的作用。有的miRNA和肝癌的預后存在相關性，提示miRNA可作為腫瘤的診斷或預后的預測標志物。

本研究中，申請人通過文獻的調研及實驗驗證，選擇幾個和肝癌相關性較好的miRNA，繼而應用隨機森林構建了肝癌的預測模型，對構建的模型通過支持向量機和決策樹算法對構建的預測模型進行驗證，發(fā)現該模型在三種算法中準確性和靈敏度都很高，顯示本申請構建的肝癌預測模型具有很好的普適性，本申請?zhí)峁┑哪Ｐ蜑榕R床肝癌的診斷奠定基礎。

發(fā)明內容

本發(fā)明的目的在于提供一種肝癌預測模型，該模型的檢測指標為下列miRNA中的一種或幾種：miR-10b-5p、miR-10b-3p、miR-224-5p、miR-183-5p、miR-182-5p。

本申請的目的還在于提供上述肝癌預測模型在制備肝癌診斷產品中的應用。

所述肝癌診斷產品檢測樣本中miRNA和/或其前體的轉錄情況，或者miRNA調控的靶基因的表達，檢測所述miRNA選自下列中的一種或幾種miR-10b-5p、miR-10b-3p、miR-224-5p、miR-183-5p、miR-182-5p。

進一步，上述miRNA在肝癌樣本中高表達。

所述的樣本為外周血、組織。

進一步，肝癌診斷產品采用高通量測序方法和/或定量PCR方法和/或基于探針雜交方法檢測樣本中miRNA和/或其前體的表達情況。

優(yōu)選采用northern雜交方法、miRNA表達譜芯片、核酶保護分析技術、RAKE法、原位雜交、基于微球的流式細胞術檢測樣本中miRNA和/或其前體的表達情況。

優(yōu)選的，所述的用于定量PCR方法包括特異性擴增miRNA和/或其前體的引物；所述的基于探針雜交方法包括與miRNA和/或其前體的核酸序列雜交的探針。

本發(fā)明的目的還在于提供上述肝癌預測模型在制備肝癌患者預后診斷試劑中的應用。

進一步，預后診斷試劑檢測樣本中miR-10b-5p、miR-10b-3p、miR-224-5p、miR-183-5p和miR-182-5p的表達量。

定義：