[發明專利]COVID-19感染的宿主標志物的應用有效
| 申請號: | 202010173346.7 | 申請日: | 2020-03-13 |
| 公開(公告)號: | CN111041089B | 公開(公告)日: | 2020-06-19 |
| 發明(設計)人: | 許騰;楊文嬌;謝淑媚;何福生;楊敏玲;莫茜;李永軍;王小銳;蘇杭 | 申請(專利權)人: | 廣州微遠基因科技有限公司 |
| 主分類號: | C12Q1/6883 | 分類號: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 廣州新諾專利商標事務所有限公司 44100 | 代理人: | 李海恬 |
| 地址: | 510130 廣東省廣州市高新技術產業開發*** | 國省代碼: | 廣東;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | covid 19 感染 宿主 標志 應用 | ||
1.一種檢測宿主標志物表達量的試劑在制備COVID-19感染檢測試劑或檢測設備中的應用,其特征在于,所述宿主標志物包括RNR1,MFSD11,SYNE3和SLC10A3基因;
所述宿主標志物中,以基因表達上調為標志的基因為:RNR1;以基因表達下調為標志的基因為:MFSD11、SYNE3、SLC10A3。
2.根據權利要求1所述的應用,其特征在于,對所述宿主標志物的應用為:檢測生物樣本中所述宿主標志物基因的表達量,與預定的各基因表達預設判定值進行對比,得出檢測結果。
3.根據權利要求2所述的應用,其特征在于,所述宿主標志物基因的表達量通過以下方法獲得:以高通量測序獲得人基因組測序數據,以外顯子作為轉錄本最小區間,以比對到已知基因的序列數作為基因表達量。
4.根據權利要求2所述的應用,其特征在于,所述基因表達預設判定值通過以下方法得到:分別獲取COVID-19陽性肺炎組及COVID-19陰性肺炎組樣本數據,根據兩組樣本數據進行差異化分析,以各基因表達量差異倍數絕對值為1.5倍以上為預設判定值。
5.根據權利要求4所述的應用,其特征在于,所述差異化分析時,限定P-Value 0.05,且FDR0.1。
6.根據權利要求1所述的應用,其特征在于,所述檢測試劑用于痰液、咽拭子、肺泡灌洗液樣本的檢測。
7.根據權利要求6所述的應用,其特征在于,所述咽拭子包括鼻咽拭子。
8.一種COVID-19感染輔助檢測試劑盒,其特征在于,包括檢測以下基因表達量的試劑:RNR1,MFSD11,SYNE3和SLC10A3。
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