[發明專利]一種用于鑒定豬背膘厚度的SNP標記及其應用方法

在審

• 申請號: 202010153558.9
• 申請日: 2020-03-06
• 公開（公告）號: CN113355430A
• 公開（公告）日: 2021-09-07
• 發明（設計）人: 唐中林;袁鵬翔;易國強;楊亞嵐
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426
• 代理人: 劉冬梅;范國鋒

1.一種用于鑒定豬背膘厚的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上，在AMOTL1基因內部。

2.根據權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處，存在T/C多態性。

3.根據權利要求2所述的SNP標記，其特征在于，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處的SNP位點的基因型為TT的豬，相較于基因型為TC和CC的豬，具有較低的背膘厚度。

4.根據權利要求3所述的SNP標記，其特征在于，用于檢測所述SNP位點基因型的方法中涉及PCR擴增反應和單堿基延伸反應，

所述PCR擴增反應的擴增引物為P1和P2，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3所示；

所述單堿基延伸引物為P3、P4和P5，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。

5.一種鑒定或輔助鑒定豬背膘厚的方法，其特征在于，所述方法包括確定待測豬個體位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處SNP標記的基因型的步驟。

6.一種篩選低背膘厚的豬群體的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：

步驟i，提取待測豬的基因組DNA；

步驟ii，以基因組DNA為模板，進行PCR擴增；

步驟iii，確定待測豬SNP標記的基因型；

步驟iv，根據基因型篩選豬群體。

7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，步驟ii中，所述PCR擴增產物包括位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處的SNP標記。

8.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，步驟iv中，若待測豬個體上述SNP位點處的基因型為TT，則具有較低的背膘厚，可以選擇；若待測豬上述SNP位點處的基因型為TC或CC，則具有較高的背膘厚，應該淘汰。