[發(fā)明專利]一種用于鑒定豬背膘厚度的SNP標記及其應用方法在審
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010153558.9 | 申請日： | 2020-03-06 |
| 公開（公告）號： | CN113355430A | 公開（公告）日： | 2021-09-07 |
| 發(fā)明（設計）人： | 唐中林;袁鵬翔;易國強;楊亞嵐 | 申請（專利權）人： | 中國農(nóng)業(yè)科學院農(nóng)業(yè)基因組研究所 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京康思博達知識產(chǎn)權代理事務所(普通合伙) 11426 | 代理人： | 劉冬梅;范國鋒 |
| 地址： | 518000 廣*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 用于 鑒定 豬背膘 厚度 snp 標記 及其 應用 方法 | ||
1.一種用于鑒定豬背膘厚的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上，在AMOTL1基因內部。
2.根據(jù)權利要求1所述的SNP標記，其特征在于，所述SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處，存在T/C多態(tài)性。
3.根據(jù)權利要求2所述的SNP標記，其特征在于，所述位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處的SNP位點的基因型為TT的豬，相較于基因型為TC和CC的豬，具有較低的背膘厚度。
4.根據(jù)權利要求3所述的SNP標記，其特征在于，用于檢測所述SNP位點基因型的方法中涉及PCR擴增反應和單堿基延伸反應，
所述PCR擴增反應的擴增引物為P1和P2，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ IDNO.3所示；
所述單堿基延伸引物為P3、P4和P5，其核苷酸序列分別如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。
5.一種鑒定或輔助鑒定豬背膘厚的方法，其特征在于，所述方法包括確定待測豬個體位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處SNP標記的基因型的步驟。
6.一種篩選低背膘厚的豬群體的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：
步驟i，提取待測豬的基因組DNA；
步驟ii，以基因組DNA為模板，進行PCR擴增；
步驟iii，確定待測豬SNP標記的基因型；
步驟iv，根據(jù)基因型篩選豬群體。
7.根據(jù)權利要求6所述的方法，其特征在于，步驟ii中，所述PCR擴增產(chǎn)物包括位于國際豬基因組10.2版本參考序列9號染色體上第30,730,577個核苷酸處的SNP標記。
8.根據(jù)權利要求6所述的方法，其特征在于，步驟iv中，若待測豬個體上述SNP位點處的基因型為TT，則具有較低的背膘厚，可以選擇；若待測豬上述SNP位點處的基因型為TC或CC，則具有較高的背膘厚，應該淘汰。
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