[發明專利]確定胞嘧啶修飾的方法在審
| 申請號： | 202010117568.7 | 申請日： | 2020-02-25 |
| 公開（公告）號： | CN113373207A | 公開（公告）日： | 2021-09-10 |
| 發明（設計）人： | 唐沖;阮鳳英;石卓興;謝燁明;何映東;楊林峰 | 申請（專利權）人： | 深圳華大基因科技服務有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6869 | 分類號： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京清亦華知識產權代理事務所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 張立 |
| 地址： | 518083 廣東省深圳市鹽*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 確定 胞嘧啶 修飾 方法 | ||
1.一種確定核酸樣品中胞嘧啶修飾的方法，其特征在于，包括：
對所述核酸樣品進行末端修復和加A處理，以便獲得末端修復產物；
對所述末端修復產物進行糖基化反應，以便獲得糖基化產物；
將所述糖基化產物與測序接頭連接，以便獲得連接產物；
對所述連接產物進行測序，以便確定所述核酸樣品中的胞嘧啶修飾；
其中，所述胞嘧啶修飾為5-羥甲基胞嘧啶修飾。
2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，經過所述糖基化反應使得5-羥甲基胞嘧啶修飾轉化為β-葡糖基5-羥甲基胞嘧啶修飾。
3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于，利用T4噬菌體β-葡糖基轉移酶進行所述糖基化反應。
4.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，利用納米孔測序平臺對所述連接產物進行測序。
5.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述核酸樣品為基因組DNA。
6.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，進一步包括：
基于堿基的電流信號特征，確定所述核酸樣品上的胞嘧啶修飾類型；
任選地，基于至少連續3個堿基的電流信號特征，確定所述核酸樣品上的胞嘧啶修飾類型。
7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，進一步包括：
基于β-葡糖基5-羥甲基胞嘧啶修飾所產生的電流信號特征，確定所述核酸樣品上含有5-羥甲基胞嘧啶修飾。
8.一種確定胞嘧啶修飾的方法，其特征在于，包括：
對核酸樣品進行建庫，測序，以便確定所述核酸樣品中的胞嘧啶修飾；
其中，所述建庫包括對所述核酸樣品進行糖基化反應；
所述胞嘧啶修飾為5-羥甲基胞嘧啶修飾。
9.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，利用T4噬菌體β-葡糖基轉移酶進行所述糖基化反應對所述核酸樣品進行糖基化反應。
10.根據權利要求8所述的方法，其特征在于，利用納米孔測序平臺進行所述測序。
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