[發明專利]菌群宏基因組基因功能分析方法、裝置和存儲裝置

在審

• 申請號: 202010106754.0
• 申請日: 2020-02-20
• 公開（公告）號: CN111304307A
• 公開（公告）日: 2020-06-19
• 發明（設計）人: 譚驗;胡函
• 申請（專利權）人: 深圳未知君生物科技有限公司
• 主分類號: C12Q1/6869
• 分類號: C12Q1/6869;C12Q1/689;G16B30/20
• 代理公司: 深圳國新南方知識產權代理有限公司 44374
• 代理人: 周雷

1.一種菌群宏基因組基因功能分析方法，其特征在于，所述方法包括：

獲取菌群測序序列；

根據所述測序序列，進行序列拼接，以獲取拼接序列；

根據所述拼接序列，進行基因功能預測。

2.如權利要求1所述的方法，其特征在于，所述獲取菌群測序序列包括：

對菌群DNA進行高通量測序以獲得所述測序序列。

3.如權利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述根據所述測序序列，進行序列拼接，以獲取拼接序列，之前包括：

對所述測序結果進行數據量評估和匯總。

4.如權利要求3所述的方法，其特征在于，所述根據所述測序序列，進行序列拼接，以獲取拼接序列包括：

對所述測序序列進行低質量過濾；

對過濾后的測序序列進行拼接以獲取初始拼接序列；

對所述初始拼接序列進行修飾以獲得所述拼接序列。

5.如權利要求4所述的方法，其特征在于，所述根據所述拼接序列，進行基因功能預測，之前包括：

對所述拼接序列進行數據量評估和匯總。

6.如權利要求5所述的方法，其特征在于，所述根據所述拼接序列，進行基因功能預測包括：

根據所述拼接序列篩選獲得最優拼接序列；

根據最優拼接序列進行基因功能分析，以預測基因功能。

7.一種菌群宏基因組基因功能分析裝置，其特征在于，包括：

序列獲取模塊，用于獲取菌群測序序列；

拼接模塊，用于根據所述測序序列，進行序列拼接，以獲取拼接序列；

功能分析模塊，用于根據所述拼接序列，進行基因功能預測。

8.一種菌群宏基因組基因功能分析裝置，其特征在于，包括：通信電路、存儲器和處理器，所述通信電路、所述存儲器分別耦接所述處理器；

所述通信電路用于與其他設備通信；

所述處理器用于運行所述存儲器存儲的程序文件，以結合所述通信電路來執行權利要求1至6任一所述的方法。

9.一種存儲裝置，其特征在于，存儲有處理器可運行的程序文件，所述程序文件用于執行權利要求1至6任一項所述的方法。