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[發明專利]一種數據分析方法、裝置、設備及存儲介質有效

專利信息
申請號: 202010103766.8 申請日: 2020-02-20
公開(公告)號: CN111326213B 公開(公告)日: 2023-10-03
發明(設計)人: 賈瑞凱;葉樺;方其;張艷;吳昕;廖國娟 申請(專利權)人: 蘇州金唯智生物科技有限公司
主分類號: G16B20/30 分類號: G16B20/30
代理公司: 北京品源專利代理有限公司 11332 代理人: 孟金喆
地址: 215123 江蘇省蘇州*** 國省代碼: 江蘇;32
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摘要:
搜索關鍵詞: 一種 數據 分析 方法 裝置 設備 存儲 介質
【說明書】:

發明公開了一種數據分析方法、裝置、設備及存儲介質。該方法包括:讀取至少一個樣本的測序數據;根據所述測序數據確定代表性序列;統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析,通過本發明的技術方案,能夠更加完全、準確地檢測組分,拓展了檢測的靈敏度和完整性。

技術領域

本發明實施例涉及生物學領域,尤其涉及一種數據分析方法、裝置、設備及存儲介質。

背景技術

隨著宏基因組學的發展,研究人員能夠精確分析人體微生物菌群的多樣性,并延展至免疫、代謝、精神行為、以及各種健康和疾病狀態與人體微生物種群平衡的關系。宏基因組學分析已經成為微生物種群研究的主要手段,通過高通量測序得到的龐大的序列信息,利用生物信息學分析,研究微生物的組分、多樣性、與環境的關系等,促使微生物的研究進入了一個新的時代。

16SrDNA測序技術是研究宏基因組的主要技術之一。在技術興起的初期,16SrDNA測序對應的生物信息學分析方法的主要目的是在保證數據精度的同時盡可能的提高數據處理的速度。然而在處理相同數據不同組合分析時候存在少許背景偏差。

發明內容

本發明實施例提供一種數據分析方法、裝置、設備及存儲介質,以實現能夠更加完全、準確地檢測組分,拓展了檢測的靈敏度和完整性。

第一方面,本發明實施例提供了一種數據分析方法,包括:

讀取至少一個樣本的測序數據;

根據所述測序數據確定代表性序列;

統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;

對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析。

第二方面,本發明實施例還提供了一種數據分析裝置,該裝置包括:

讀取模塊,用于讀取至少一個樣本的測序數據;

確定模塊,用于根據所述測序數據確定代表性序列;

統計模塊,用于統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;

分析模塊,用于對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析。

第三方面,本發明實施例還提供了一種計算機設備,包括存儲器、處理器及存儲在存儲器上并可在處理器上運行的計算機程序,所述處理器執行所述程序時實現如本發明實施例中任一所述的數據分析方法。

第四方面,本發明實施例還提供了一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,該程序被處理器執行時實現如本發明實施例中任一所述的數據分析方法。

本發明實施例通過讀取至少一個樣本的測序數據;根據所述測序數據確定代表性序列;統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析,能夠更加完全、準確地檢測組分,拓展了檢測的靈敏度和完整性。

附圖說明

為了更清楚地說明本發明實施例的技術方案,下面將對實施例中所需要使用的附圖作簡單地介紹,應當理解,以下附圖僅示出了本發明的某些實施例,因此不應被看作是對范圍的限定,對于本領域普通技術人員來講,在不付出創造性勞動的前提下,還可以根據這些附圖獲得其他相關的附圖。

圖1是本發明實施例一中的一種數據分析方法的流程圖;

圖2是本發明實施例二中的一種數據分析裝置的結構示意圖;

圖3是本發明實施例三中的一種計算機設備的結構示意圖。

具體實施方式

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