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[發明專利]一種數據分析方法、裝置、設備及存儲介質有效

專利信息
申請號: 202010103766.8 申請日: 2020-02-20
公開(公告)號: CN111326213B 公開(公告)日: 2023-10-03
發明(設計)人: 賈瑞凱;葉樺;方其;張艷;吳昕;廖國娟 申請(專利權)人: 蘇州金唯智生物科技有限公司
主分類號: G16B20/30 分類號: G16B20/30
代理公司: 北京品源專利代理有限公司 11332 代理人: 孟金喆
地址: 215123 江蘇省蘇州*** 國省代碼: 江蘇;32
權利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關鍵詞: 一種 數據 分析 方法 裝置 設備 存儲 介質
【權利要求書】:

1.一種數據分析方法,其特征在于,包括:

讀取至少一個樣本的測序數據;

根據所述測序數據確定代表性序列;

統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;

對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析。

2.根據權利要求1所述的方法,其特征在于,所述測序數據包括至少一條堿基序列;相應的,根據所述測序數據確定代表性序列包括:

將至少一個樣本的測序數據中相同的堿基序列合并為一組,對應的堿基序列作為該組的代表性序列。

3.根據權利要求2所述的方法,其特征在于,所述堿基序列包括至少一個堿基;相應的,將至少一個樣本的測序數據中相同的堿基序列合并為一組,對應的堿基序列作為該組的代表性序列包括:

判斷所述至少一條堿基序列中的堿基是否相同;

將全部堿基均相同的至少一條堿基序列合并為一組;

將存在不同堿基的至少一條堿基序列各分為一組。

4.根據權利要求3所述的方法,其特征在于,對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析包括:

對分組后獲得的代表性序列進行注釋。

5.根據權利要求4所述的方法,其特征在于,所述對分組后獲得的代表性序列進行注釋包括:

預先建立關于代表性序列和菌種和/或菌屬的對應關系的數據庫;

根據所述至少一條代表性序列查詢所述數據庫,得到所述至少一條代表性序列對應的菌種和/或菌屬;

將屬于相同菌種和/或菌屬的至少一條代表性序列進行合并。

6.根據權利要求5所述的方法,其特征在于,根據所述測序數據確定代表性序列之后,還包括:

對所述至少一條代表性序列進行編號;

根據所述編號、代表性序列以及代表性序列的深度信息建立表格,其中,所述代表性序列的深度信息包括針對至少一個樣本的深度信息。

7.根據權利要求6所述的方法,其特征在于,將屬于相同菌種和/或菌屬的至少一條代表性序列進行合并之后,還包括:

根據所述編號、代表性序列、代表性序列的深度信息以及代表性序列對應的菌種和/或菌屬建立表格。

8.一種數據分析裝置,其特征在于,包括:

讀取模塊,用于讀取至少一個樣本的測序數據;

確定模塊,用于根據所述測序數據確定代表性序列;

統計模塊,用于統計所述代表性序列在各樣本的深度信息;

分析模塊,用于對所述代表性序列及代表性序列在各樣本中的深度信息進行分析。

9.一種計算機設備,包括存儲器、處理器及存儲在存儲器上并可在處理器上運行的計算機程序,其特征在于,所述處理器執行所述程序時實現如權利要求1-7中任一所述的方法。

10.一種計算機可讀存儲介質,其上存儲有計算機程序,其特征在于,該程序被處理器執行時實現如權利要求1-7中任一所述的方法。

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