[發明專利]獲取生物組織圖像的方法、裝置、電子設備及存儲介質

在審

• 申請號: 202010093693.9
• 申請日: 2020-02-14
• 公開（公告）號: CN111292310A
• 公開（公告）日: 2020-06-16
• 發明（設計）人: 曹峰;孫思嘉;盧志鋼;孫飛;徐濤
• 申請（專利權）人: 廣州再生醫學與健康廣東省實驗室;中國科學院生物物理研究所
• 主分類號: G06T7/00
• 分類號: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/13;G06T7/136;G06T7/62
• 代理公司: 北京智信四方知識產權代理有限公司 11519
• 代理人: 劉穎;呂雁葭

本公開實施例公開了一種獲取生物組織圖像的方法、裝置、電子設備及存儲介質，所述方法包括控制掃描透射電鏡通過掃描模式以低放大倍數獲取第一掃描圖像，在所述第一掃描圖像中定位一個或多個目標生物樣品切片，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息；根據所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息，通過掃描模式以中放大倍數獲取針對所述一個或多個目標生物樣品切片的第二掃描圖像，在所述第二掃描圖像中定位一個或多個目標生物組織，輸出所述目標生物組織的位置信息；根據所述目標生物組織的位置信息，通過掃描透射模式以高放大倍數獲取針對所述目標生物組織的第三掃描圖像。該技術方案實現了快速且準確的生物組織自動化定位和成像。

技術領域

本公開涉及醫療技術領域，具體涉及一種獲取生物組織圖像的方法、裝置、電子設備及存儲介質。

背景技術

現有技術中，基于電子顯微鏡觀察生物組織樣本的一般操作流程為：將生物組織樣本通過特定方法制作為超薄樣品切片，并將多組樣品切片放置于特制電鏡載網上，通過透射電鏡以低倍數觀察并定位感興趣區域，然后以高倍數觀察或拍圖對相關組織進行定性定量的分析。上述操作流程一般為人工操作，耗費時間長且對操作人員操作電鏡具有較高的要求，例如，需要操作人員具備電鏡原理等相關知識以及熟練操作電鏡等相關經驗。

發明內容

為了解決相關技術中的問題，本公開實施例提供一種獲取生物組織圖像的方法、裝置、電子設備及存儲介質。

第一方面，本公開實施例中提供了一種獲取生物組織圖像的方法。

具體地，所述獲取生物組織圖像的方法，包括：

控制掃描透射電鏡通過掃描模式以低放大倍數獲取第一掃描圖像，在所述第一掃描圖像中定位一個或多個目標生物樣品切片，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息；

根據所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息，控制所述掃描透射電鏡通過掃描模式以中放大倍數獲取針對所述一個或多個目標生物樣品切片的第二掃描圖像，在所述第二掃描圖像中定位一個或多個目標生物組織，輸出所述目標生物組織的位置信息；

根據所述目標生物組織的位置信息，控制所述掃描透射電鏡通過掃描透射模式以高放大倍數獲取針對所述目標生物組織的第三掃描圖像，所述第三掃描圖像包括所述目標生物組織的內部組織特征。

可選地，所述控制掃描透射電鏡通過掃描模式以低放大倍數獲取第一掃描圖像，在所述第一掃描圖像中定位一個或多個目標生物樣品切片，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息，包括：

將所述掃描透射電鏡載網中心位置確定為第一成像中心位置；

根據所述第一成像中心位置，以低放大倍數獲取所述第一掃描圖像，其中，所述第一掃描圖像包括第一預設范圍的預選生物樣品切片；

通過第一圖像處理算法確定所述預選生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述預選生物樣品切片的最小外接圖形；

根據所述第一成像中心位置以及所述預選生物樣品切片的中心像素位置，定位一組或多組所述目標生物樣品切片；

基于所述目標生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述目標生物樣品切片的最小外接圖形，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息。

可選地，所述通過第一圖像處理算法確定所述預選生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述預選生物樣品切片的最小外接圖形，包括：

基于灰度直方圖的多閾值分割算法對所述第一掃描圖像進行閾值分割處理，獲取第一處理掃描圖像；

通過Canny邊緣檢測算法對所述第一處理掃描圖像進行邊緣檢測處理，獲取第二處理掃描圖像；

基于所述第二處理掃描圖像，提取所述預選生物樣品切片；