[發明專利]獲取生物組織圖像的方法、裝置、電子設備及存儲介質

在審

• 申請號: 202010093693.9
• 申請日: 2020-02-14
• 公開（公告）號: CN111292310A
• 公開（公告）日: 2020-06-16
• 發明（設計）人: 曹峰;孫思嘉;盧志鋼;孫飛;徐濤
• 申請（專利權）人: 廣州再生醫學與健康廣東省實驗室;中國科學院生物物理研究所
• 主分類號: G06T7/00
• 分類號: G06T7/00;G06T7/11;G06T7/13;G06T7/136;G06T7/62
• 代理公司: 北京智信四方知識產權代理有限公司 11519
• 代理人: 劉穎;呂雁葭

1.一種獲取生物組織圖像的方法，其特征在于，包括：

控制掃描透射電鏡通過掃描模式以低放大倍數獲取第一掃描圖像，在所述第一掃描圖像中定位一個或多個目標生物樣品切片，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息；

根據所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息，控制所述掃描透射電鏡通過掃描模式以中放大倍數獲取針對所述一個或多個目標生物樣品切片的第二掃描圖像，在所述第二掃描圖像中定位一個或多個目標生物組織，輸出所述目標生物組織的位置信息；

根據所述目標生物組織的位置信息，控制所述掃描透射電鏡通過掃描透射模式以高放大倍數獲取針對所述目標生物組織的第三掃描圖像，所述第三掃描圖像包括所述目標生物組織的內部組織特征。

2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述控制掃描透射電鏡通過掃描模式以低放大倍數獲取第一掃描圖像，在所述第一掃描圖像中定位一個或多個目標生物樣品切片，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息，包括：

將所述掃描透射電鏡載網中心位置確定為第一成像中心位置；

根據所述第一成像中心位置，以低放大倍數獲取所述第一掃描圖像，其中，所述第一掃描圖像包括第一預設范圍的預選生物樣品切片；

通過第一圖像處理算法確定所述預選生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述預選生物樣品切片的最小外接圖形；

根據所述第一成像中心位置以及所述預選生物樣品切片的中心像素位置，定位一組或多組所述目標生物樣品切片；

基于所述目標生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述目標生物樣品切片的最小外接圖形，輸出所述目標生物樣品切片的位置信息和尺寸信息。

3.根據權利要求2所述的方法，其特征在于，所述通過第一圖像處理算法確定所述預選生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述預選生物樣品切片的最小外接圖形，包括：

基于灰度直方圖的多閾值分割算法對所述第一掃描圖像進行閾值分割處理，獲取第一處理掃描圖像；

通過Canny邊緣檢測算法對所述第一處理掃描圖像進行邊緣檢測處理，獲取第二處理掃描圖像；

基于所述第二處理掃描圖像，提取所述預選生物樣品切片；

基于所述預選生物樣品切片的邊緣像素位置，確定所述預選生物樣品切片的中心像素位置以及包含所述預選生物樣品切片的最小外接矩形。

4.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述基于灰度直方圖的多閾值分割算法對所述第一掃描圖像進行閾值分割處理，獲取第一處理掃描圖像，包括：

根據所述第一掃描圖像的灰度直方圖分布數據，確定所述第一掃描圖像的初始閾值以及對應的初始區域；

基于預設合并標準，根據所述初始閾值合并所述初始閾值對應的初始區域，獲取候選閾值以及對應的候選區域；

比較所述候選閾值的數量與預設閾值的數量；

響應于所述候選閾值的數量小于或等于所述預設閾值的數量，停止合并操作，獲取閾值分割后的第一掃描圖像；

將所述閾值分割后的第一掃描圖像進行圖像二值化處理，獲取第一處理掃描圖像。

5.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述通過Canny邊緣檢測算法對所述第一處理掃描圖像進行邊緣檢測處理，獲取第二處理掃描圖像，包括：

通過高斯濾波器對所述第一處理掃描圖像進行去噪處理；

計算去燥處理后的所述第一處理掃描圖像中的每個像素點的梯度強度和方向；

根據所述像素點的梯度方向，對所述像素點的梯度強度進行非極大值抑制，獲取所述第二處理掃描圖像。

6.根據權利要求3所述的方法，其特征在于，所述基于所述第二處理掃描圖像，提取所述預選生物樣品切片，包括：

基于所述第二處理掃描圖像，確定多個輪廓信息，所述輪廓信息包括輪廓面積；

比較所述輪廓面積與預設輪廓面積，所述預設輪廓面積大于銅網內圓輪廓面積，小于所述預選生物樣品切片的輪廓面積；

響應于所述輪廓面積大于或等于預設輪廓面積，將所述輪廓信息確定為所述預選生物樣品切片的輪廓信息；

基于所述預選生物樣品切片的輪廓信息提取所述預選生物樣品切片。