[發明專利]一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法

在審

• 申請號: 202010093285.3
• 申請日: 2020-02-14
• 公開（公告）號: CN112941197A
• 公開（公告）日: 2021-06-11
• 發明（設計）人: 唐中林;陳云;易國強;楊亞嵐
• 申請（專利權）人: 中國農業科學院深圳農業基因組研究所
• 主分類號: C12Q1/6888
• 分類號: C12Q1/6888;C12N15/11
• 代理公司: 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426
• 代理人: 劉冬梅;范國鋒

本發明公開了一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法，所述方法通過鑒定位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處SNP位點的基因型，來篩選21天斷奶仔豬個體重和窩重高的豬個體，其中，所述國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處的SNP位點的基因型為TT的豬，相較于基因型為TC和CC的豬有更高的21天斷奶仔豬個體重和窩重，采用本發明所述的方法，可以增加優良豬種的選育速度，加快豬分子育種的步伐，同時提高了豬群的經濟效益與社會價值。

技術領域

本發明屬于分子生物學技術領域，具體涉及與母豬泌乳力相關的分子標記及基于分子標記評估母豬泌乳力的方法，尤其涉及基于SNP標記評估斷奶仔豬個體重和窩重等泌乳力指標的方法。

背景技術

豬為六畜之首，生豬養殖業在世界尤其是我國國民經濟中占重要地位，豬繁殖性狀是生產中較為重要的經濟性狀類別之一。利用現代育種技術針對豬繁殖性狀進行有效選育，將對于提高養豬業的整體效益有著十分重要的作用。

豬的繁殖性狀包括窩產仔數、初生重、21日齡窩重、斷奶仔豬數和產仔間隔等。繁殖性狀遺傳力均較低，傳統選育效果不好，需要利用標記輔助選擇提高選種準確性，并加快遺傳進展。我國是一個養豬大國，且蘊藏各具特點的優良地方品種，因此，開展持續且高效的遺傳改良來保持豬種的優良品質并加以改良十分迫切。

單核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)主要是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性，是由單個SNP的置換、顛換、缺失或插入所引起的遺傳變異現象。SNP是第三代分子遺傳標記，據統計，人類基因組中每1,000個核苷酸就有一個SNP，人類30億堿基中共有300萬以上的SNPs。SNP在分子遺傳學、藥物遺傳學、人類疾病診斷和治療、法醫學和基因組學等理論研究方面也扮演著重要角色，具有很大的發展潛力。

現有技術中，科學家已經對豬繁殖性狀相關基因及SNP標記做了很多研究。例如，李鳳娥和陳克飛等研究了ESR基因中不同SNP位點和基因型對產仔數的影響；趙要風等對促卵泡素β亞基基因(FSHβ)的SNP與產仔數進行關聯分析，證明該基因座位在約克夏、長白和杜洛克等商品豬中與產仔數緊密連鎖。但是，目前對于與豬斷奶仔豬個體重和窩重相關的基因以及標志性SNP研究報道較少。因此，我們需要對相關性狀進行深入研究，在分子水平上探索影響斷奶仔豬體重和窩重的遺傳機制，這對于全面而深入揭示母豬繁殖性能具有重要的理論意義和實踐意義。

發明內容

為了克服上述問題，本發明人進行了銳意研究，提供了一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法，所述方法通過鑒定位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處SNP位點的基因型，來篩選21天斷奶仔豬個體重和窩重高的豬個體，以增加優良豬種的選育速度，加快豬分子育種的步伐，提高豬群的經濟效益和社會價值，從而完成了本發明。

具體來說，本發明的目的在于提供一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法，其中，所述方法包括以下步驟：

步驟1，獲得與母豬泌乳力相關的SNP標記及其基因型；

步驟2，提取待測母豬的基因組DNA；

步驟3，檢測待測母豬相關SNP標記的基因型；

步驟4，根據基因型評估待測母豬的泌乳力。

其中，與母豬泌乳力相關的指標為21天斷奶仔豬個體重和窩重。

其中，所述與母豬泌乳力相關的SNP標記位于ENSSSCG00000004081基因上。

其中，所述與母豬泌乳力相關的SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處，具有T/C多態性。