[發明專利]一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法在審
| 申請號： | 202010093285.3 | 申請日： | 2020-02-14 |
| 公開（公告）號： | CN112941197A | 公開（公告）日： | 2021-06-11 |
| 發明（設計）人： | 唐中林;陳云;易國強;楊亞嵐 | 申請（專利權）人： | 中國農業科學院深圳農業基因組研究所 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京康思博達知識產權代理事務所(普通合伙) 11426 | 代理人： | 劉冬梅;范國鋒 |
| 地址： | 518000 廣*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 基于 snp 標記 評估 母豬 泌乳力 方法 | ||
1.一種基于SNP標記評估母豬泌乳力的方法，其特征在于，所述方法包括以下步驟：
步驟1，獲得與母豬泌乳力相關的SNP標記及其基因型；
步驟2，提取待測母豬的基因組DNA；
步驟3，檢測待測母豬相關SNP標記的基因型；
步驟4，根據基因型評估待測母豬的泌乳力。
2.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，與母豬泌乳力相關的指標為21天斷奶仔豬個體重和窩重。
3.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述與母豬泌乳力相關的SNP標記位于ENSSSCG00000004081基因上。
4.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述與母豬泌乳力相關的SNP標記位于國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處，具有T/C多態性。
5.根據權利要求4所述的方法，其特征在于，所述國際豬基因組10.2版本參考序列Chromosome1:16,077,935處的SNP位點的基因型為TT的豬，相較于基因型為TC和CC的豬有更高的21天斷奶仔豬個體重和窩重。
6.根據權利要求1所述的方法，其特征在于，所述與母豬泌乳力相關的SNP標記及其基因型按照包括以下步驟的方法篩選得到：
步驟i，提取豬群體的基因組DNA；
步驟ii，進行基因分型；
步驟iii，進行基因型數據和表型數據的關聯分析。
7.根據權利要求6所述的方法，其特征在于，步驟ii包括以下子步驟：
步驟ii-1，對基因組DNA進行PCR擴增；
步驟ii-2，對擴增產物進行SAP消化處理；
步驟ii-3，對消化處理后的產物進行單堿基延伸反應；
步驟ii-4，將延伸產物進行質譜檢測。
8.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟ii-1中，采用擴增引物對基因組DNA進行擴增，所述引物P1和P2的核苷酸序列分別如SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示。
9.根據權利要求7所述的方法，其特征在于，步驟ii-3中，采用單堿基延伸引物P3、P4和P5對消化處理后的產物進行單堿基延伸，所述P3、P4和P5的核苷酸序列分別如SEQ IDNO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于中國農業科學院深圳農業基因組研究所，未經中國農業科學院深圳農業基因組研究所許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010093285.3/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
