[發明專利]一種用于淋巴瘤預后判斷的方法、試劑盒及應用有效
| 申請號： | 202010090278.8 | 申請日： | 2020-02-13 |
| 公開（公告）號： | CN111584001B | 公開（公告）日： | 2022-05-20 |
| 發明（設計）人： | 趙維蒞;許彭鵬;付迪;王黎;俞浩;劉以哲;熊慧 | 申請（專利權）人： | 上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院;上海源奇生物醫藥科技有限公司 |
| 主分類號： | G16B20/50 | 分類號： | G16B20/50;G16B20/30;G06Q10/06 |
| 代理公司： | 北京和信華成知識產權代理事務所(普通合伙) 11390 | 代理人： | 林靜濤 |
| 地址： | 200025 *** | 國省代碼： | 上海;31 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 一種 用于 淋巴瘤 預后 判斷 方法 試劑盒 應用 | ||
1.一種淋巴瘤預后評估方法，其特征在于，至少包括以下步驟：
獲得待測者的所述淋巴瘤預后相關基因的測序數據；
對所述測序數據進行數據分析，獲得所述淋巴瘤預后相關基因是否發生突變的數據分析結果；
對所述數據分析結果進行評分，進行預后判斷；所述預后判斷的方法包括：
如某一基因發生突變，則將該基因記為1；如某一基因未發生突變，則將該基因記為0，將所述淋巴瘤預后相關基因的數值代入以下公式，得到評分：
評分＝3.2593×CD79B基因+1.8022×CREBBP基因+2.3581×EP300基因-2.8398×KMT2C基因+0.9023×KMT2D基因-2.6909×MYD88基因+2.2589×SOCS1基因+1.4449×CD70基因-0.9538×GNA13基因+1.6873×NOTCH1基因+1.4748×TNFAIP3基因-1.6888×BTG1基因-0.9441×BTG2基因-1.1043×STAT3基因+0.5809×PIM1基因+0.4379×DTX1基因+1.0021×TP53基因+0.5812×IPI_3+3.5937×IPI_4+18.2859×IPI_5；
將獲得的評分按照以下標準進行評判：
若評分≤1.60，判斷為預后不易復發；
若評分＞1.60，判斷為預后易復發；
IPI_3代表所述待測者的IPI評分等于3，IPI_4代表所述待測者的IPI評分等于3，IPI_5代表所述待測者的IPI評分等于5；
當IPI評分為2時，IPI_3的值、IPI_4的值和IPI_5的值均為0，
當IPI評分為3時，IPI_3的值為1，IPI_4的值和IPI_5的值為0，
當IPI評分為4時，IPI_4的值為1，IPI_3的值和IPI_5的值為0，
當IPI評分為5時，IPI_5的值為1，IPI_4的值和IPI_5的值為0。
2.一種用于淋巴瘤預后判斷的試劑盒，其特征在于，所述試劑盒中包括以下組件：組件A、組件B、組件C、組件D；
所述組件A為對待測者的淋巴瘤預后相關基因進行文庫制備和雜交捕獲的試劑盒；所述淋巴瘤預后相關基因至少包括：CD79B基因、CREBBP基因、EP300基因、KMT2C基因、KMT2D基因、MYD88基因、SOCS1基因、CD70基因、GNA13基因、NOTCH1基因、TNFAIP3基因、BTG1基因、BTG2基因、STAT3基因、PIM1基因、DTX1基因和TP53基因；
所述組件B為用于測序的設備；
所述組件C為對所述組件B獲得的測序結果進行數據處理的數據分析系統；
所述組件D為記載有如下方法的載體：
獲得所述待測者的所述淋巴瘤預后相關基因的測序數據；
對所述測序數據進行數據分析，獲得所述淋巴瘤預后相關基因是否發生突變的數據分析結果；
對所述數據分析結果進行評分，進行預后判斷；所述預后判斷的方法包括：
如某一基因發生突變，則將該基因記為1；如某一基因未發生突變，則將該基因記為0，將所述淋巴瘤預后相關基因的數值代入以下公式，得到評分：
評分＝3.2593×CD79B基因+1.8022×CREBBP基因+2.3581×EP300基因-2.8398×KMT2C基因+0.9023×KMT2D基因-2.6909×MYD88基因+2.2589×SOCS1基因+1.4449×CD70基因-0.9538×GNA13基因+1.6873×NOTCH1基因+1.4748×TNFAIP3基因-1.6888×BTG1基因-0.9441×BTG2基因-1.1043×STAT3基因+0.5809×PIM1基因+0.4379×DTX1基因+1.0021×TP53基因+0.5812×IPI_3+3.5937×IPI_4+18.2859×IPI_5；
將獲得的評分按照以下標準進行評判：
若評分≤1.60，判斷為預后不易復發；
若評分＞1.60，判斷為預后易復發；
IPI_3代表所述待測者的IPI評分等于3，IPI_4代表所述待測者的IPI評分等于3，IPI_5代表所述待測者的IPI評分等于5；
當IPI評分為2時，IPI_3的值、IPI_4的值和IPI_5的值均為0，
當IPI評分為3時，IPI_3的值為1，IPI_4的值和IPI_5的值為0，
當IPI評分為4時，IPI_4的值為1，IPI_3的值和IPI_5的值為0，
當IPI評分為5時，IPI_5的值為1，IPI_4的值和IPI_5的值為0。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院;上海源奇生物醫藥科技有限公司，未經上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院;上海源奇生物醫藥科技有限公司許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010090278.8/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
