[發(fā)明專利]快速檢測(cè)浙貝母中兩種真菌的引物組、試劑盒及方法有效
| 申請(qǐng)?zhí)枺?/td> | 202010087044.8 | 申請(qǐng)日: | 2020-02-11 |
| 公開(公告)號(hào): | CN111206111B | 公開(公告)日: | 2023-04-14 |
| 發(fā)明(設(shè)計(jì))人: | 申屠旭萍;曹瑱艷;宋陽;俞曉平;許益鵬;劉光富;張蓬軍 | 申請(qǐng)(專利權(quán))人: | 中國計(jì)量大學(xué) |
| 主分類號(hào): | C12Q1/6895 | 分類號(hào): | C12Q1/6895;C12Q1/6848;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645;C12R1/77 |
| 代理公司: | 杭州求是專利事務(wù)所有限公司 33200 | 代理人: | 鄭海峰 |
| 地址: | 310018 浙江省*** | 國省代碼: | 浙江;33 |
| 權(quán)利要求書: | 查看更多 | 說明書: | 查看更多 |
| 摘要: | |||
| 搜索關(guān)鍵詞: | 快速 檢測(cè) 浙貝母 中兩種 真菌 引物 試劑盒 方法 | ||
1.一種快速檢測(cè)浙貝母中兩種真菌的方法,所述兩種真菌分別為細(xì)線炭疽菌Colletotorichum?lineola和尖孢鐮刀菌Fusarium?oxysporum;其特征在于包括如下步驟:
1)帶病植株DNA的提取:
取帶病植物組織,于液氮中冷凍后打碎成粉末,提取其DNA;
2)巢氏多重PCR的擴(kuò)增:
第一輪PCR使用真菌通用引物ITS1/ITS4擴(kuò)增帶病植株中病原真菌的ITS序列,其中ITS1序列如SEQ?ID?No.5所示,ITS4序列如SEQ?ID?No.6所示;第一輪PCR擴(kuò)增體系及條件具體為:PCR反應(yīng)為25μL體系,包括含Mg2+的10×buffer2μL,10mol/L?dNTP?0.5μL,10μM/L引物ITS1/ITS4?3μL,2U/μL?Taq?polymerase?0.4μL,DNA模板1μL,ddH2O?18.1μL;擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性2min,94℃變性45s,55-58℃退火30s,72℃延伸45s,共35個(gè)循環(huán);最終72℃延伸10min;
第二輪PCR使用第一輪PCR的產(chǎn)物作為模板,采用的引物組包括兩對(duì)特異性引物對(duì),每對(duì)特異性引物對(duì)的具體引物序列如下:
特異性引物對(duì)一:
正向引物BMTJ4-F:CTACACCCTTTGTGACATACC;
反向引物BMTJ4-R:CGAGACGTTAGTTACTACGC;
特異性引物對(duì)二:
正向引物FO1-F:AACCCCTGTGAACATACCACTTG;
反向引物FO1-R:GAGGAACGCGAATTAACGCGAC;
第二輪PCR擴(kuò)增體系及條件具體為:PCR反應(yīng)為25μL體系,包括含Mg2+的10×buffer?2μL,10mol/L?dNTP?0.5μL,10μM/L引物BMTJ4-F/BMTJ4-R?0.6μL、FO1-F/FO1-R?1μL、2U/μLTaq?polymerase?0.4μL,DNA模板1μL,ddH2O?19.5μL;擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)變性2min,94℃變性45s,55-58℃退火30s,72℃延伸45s,共20個(gè)循環(huán);最終72℃延伸8min;
3)擴(kuò)增結(jié)果的檢測(cè):
根據(jù)步驟2)擴(kuò)增出的條帶片段大小判斷其對(duì)應(yīng)的病原真菌;其中細(xì)線炭疽菌C.lineola目的片段大小為421bp;尖孢鐮刀菌F.oxysporum目的片段大小為341bp。
2.如權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于步驟1)中的DNA提取方法具體為:
a)在打成粉末的植物組織中加入500μL的CTAB溶液,于液氮內(nèi)冷凍2min,再放于75℃水浴鍋內(nèi)融化2min,重復(fù)1-3次,其中最后1次于75℃水浴鍋內(nèi)融化時(shí)間為30min;
b)接著加入500μL的DNA提取液混勻,12000r/min離心10min,取上清液400μL,所述DNA提取液由苯酚∶氯仿∶異戊醇按體積比25∶24∶1組成;
c)再重復(fù)步驟b)一次后加入800μL冰無水乙醇及5M的氯化鈉溶液200μL沉淀1h,12000r/min離心10min,棄上清液,沉淀用70%乙醇洗滌,自然風(fēng)干后用50μL?ddH2O溶解DNA,-20℃保存?zhèn)溆茫惶崛〉腄NA用分光光度計(jì)測(cè)量OD值,使OD260/280控制在1.8-2.0之間,用作后續(xù)PCR模板。
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