[發明專利]用于代謝異常行為干預效果評估的SNP成套引物及其應用

有效

• 申請號: 202010084721.0
• 申請日: 2020-02-10
• 公開（公告）號: CN111118147B
• 公開（公告）日: 2022-03-01
• 發明（設計）人: 曾強;孫義民;鄭巖松;楊莉;鄭麗媛;王國青
• 申請（專利權）人: 中國人民解放軍總醫院第二醫學中心;北京博奧晶典生物技術有限公司
• 主分類號: C12Q1/6883
• 分類號: C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京東方盛凡知識產權代理事務所(普通合伙) 11562
• 代理人: 許佳

1.一種用于檢測如下SNP位點：rs854560、rs9939609、rs2943641、rs1049353、rs662、rs3808607、rs1799983、rs12691、rs4994、rs182052、rs1805094、rs1800629、rs324420、rs5110、rs708272、rs675、rs16147、rs1800497、rs2241766、rs12785878、rs135569、rs693、rs1800849、rs6720173、rs6923761、rs429358、rs1132896、rs5219、rs1695、rs7566605、rs1042714、rs894160、rs7412、rs8050136、rs662799、rs3755724、rs328、rs1042713、rs283、rs1801282、rs1052700、rs7498665、rs228948和rs2304795的成套引物，由引物1)-引物44)組成；

所述引物1)包括用于檢測rs854560的擴增引物1)；

所述引物2)包括用于檢測rs9939609的擴增引物2)；

所述引物3)包括用于檢測rs2943641的擴增引物3)；

所述引物4)包括用于檢測rs1049353的擴增引物4)；

所述引物5)包括用于檢測rs662的擴增引物5)；

所述引物6)包括用于檢測rs3808607的擴增引物6)；

所述引物7)包括用于檢測rs1799983的擴增引物7)；

所述引物8)包括用于檢測rs12691的擴增引物8)；

所述引物9)包括用于檢測rs4994的擴增引物9)；

所述引物10)包括用于檢測rs182052的擴增引物10)；

所述引物11)包括用于檢測rs1805094的擴增引物11)；

所述引物12)包括用于檢測rs1800629的擴增引物12)；

所述引物13)包括用于檢測rs324420的擴增引物13)；

所述引物14)包括用于檢測rs5110的擴增引物14)；

所述引物15)包括用于檢測rs708272的擴增引物15)；

所述引物16)包括用于檢測rs675的擴增引物16)；

所述引物17)包括用于檢測rs16147的擴增引物17)；

所述引物18)包括用于檢測rs1800497的擴增引物18)；

所述引物19)包括用于檢測rs2241766的擴增引物19)；

所述引物20)包括用于檢測rs12785878的擴增引物20)；

所述引物21)包括用于檢測rs135569的擴增引物21)；

所述引物22)包括用于檢測rs693的擴增引物22)；

所述引物23)包括用于檢測rs1800849的擴增引物23)；

所述引物24)包括用于檢測rs6720173的擴增引物24)；

所述引物25)包括用于檢測rs6923761的擴增引物25)；

所述引物26)包括用于檢測rs429358的擴增引物26)；

所述引物27)包括用于檢測rs1132896的擴增引物27)；

所述引物28)包括用于檢測rs5219的擴增引物28)；

所述引物29)包括用于檢測rs1695的擴增引物29)；

所述引物30)包括用于檢測rs7566605的擴增引物30)；

所述引物31)包括用于檢測rs1042714的擴增引物31)；

所述引物32)包括用于檢測rs894160的擴增引物32)；

所述引物33)包括用于檢測rs7412的擴增引物33)；

所述引物34)包括用于檢測rs8050136的擴增引物34)；

所述引物35)包括用于檢測rs662799的擴增引物35)；

所述引物36)包括用于檢測rs3755724的擴增引物36)；

所述引物37)包括用于檢測rs328的擴增引物37)；

所述引物38)包括用于檢測rs1042713的擴增引物38)；

所述引物39)包括用于檢測rs283的擴增引物39)；

所述引物40)包括用于檢測rs1801282的擴增引物40)；

所述引物41)包括用于檢測rs1052700的擴增引物41)；

所述引物42)包括用于檢測rs7498665的擴增引物42)；

所述引物43)包括用于檢測rs2289487的擴增引物43)；

所述引物44)包括用于檢測rs2304795的擴增引物44)；

所述用于檢測rs854560的擴增引物1)由序列表中序列1所示的單鏈DNA分子和序列表中序列2所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs9939609的擴增引物2)由序列表中序列3所示的單鏈DNA分子和序列表中序列4所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs662的擴增引物3)由序列表中序列5所示的單鏈DNA分子和序列表中序列6所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1049353的擴增引物4)由序列表中序列7所示的單鏈DNA分子和序列表中序列8所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs7566605的擴增引物5)由序列表中序列9所示的單鏈DNA分子和序列表中序列10所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs3808607的擴增引物6)由序列表中序列11所示的單鏈DNA分子和序列表中序列12所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1799983的擴增引物7)由序列表中序列13所示的單鏈DNA分子和序列表中序列14所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs12691的擴增引物8)由序列表中序列15所示的單鏈DNA分子和序列表中序列16所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs4994的擴增引物9)由序列表中序列17所示的單鏈DNA分子和序列表中序列18所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs182052的擴增引物10)由序列表中序列19所示的單鏈DNA分子和序列表中序列20所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1805094的擴增引物11)由序列表中序列21所示的單鏈DNA分子和序列表中序列22所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1800629的擴增引物12)由序列表中序列23所示的單鏈DNA分子和序列表中序列24所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs324420的擴增引物13)由序列表中序列25所示的單鏈DNA分子和序列表中序列26所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs5110的擴增引物14)由序列表中序列27所示的單鏈DNA分子和序列表中序列28所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs708272的擴增引物15)由序列表中序列29所示的單鏈DNA分子和序列表中序列30所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs675的擴增引物16)由序列表中序列31所示的單鏈DNA分子和序列表中序列32所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs16147的擴增引物17)由序列表中序列33所示的單鏈DNA分子和序列表中序列34所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1800497的擴增引物18)由序列表中序列35所示的單鏈DNA分子和序列表中序列36所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs2241766的擴增引物19)由序列表中序列37所示的單鏈DNA分子和序列表中序列38所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs12785878的擴增引物20)由序列表中序列39所示的單鏈DNA分子和序列表中序列40所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs135569的擴增引物21)由序列表中序列41所示的單鏈DNA分子和序列表中序列42所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs693的擴增引物22)由序列表中序列43所示的單鏈DNA分子和序列表中序列44所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1800849的擴增引物23)由序列表中序列45所示的單鏈DNA分子和序列表中序列46所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs6720173的擴增引物24)由序列表中序列47所示的單鏈DNA分子和序列表中序列48所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs6923761的擴增引物25)由序列表中序列49所示的單鏈DNA分子和序列表中序列50所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs429358的擴增引物26)由序列表中序列51所示的單鏈DNA分子和序列表中序列52所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1132896的擴增引物27)由序列表中序列53所示的單鏈DNA分子和序列表中序列54所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs5219的擴增引物28)由序列表中序列55所示的單鏈DNA分子和序列表中序列56所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1695的擴增引物29)由序列表中序列57所示的單鏈DNA分子和序列表中序列58所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs7566605的擴增引物30)由序列表中序列59所示的單鏈DNA分子和序列表中序列60所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1042714的擴增引物31)由序列表中序列61所示的單鏈DNA分子和序列表中序列62所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs894160的擴增引物32)由序列表中序列63所示的單鏈DNA分子和序列表中序列64所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs7412的擴增引物33)由序列表中序列65所示的單鏈DNA分子和序列表中序列66所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs8050136的擴增引物34)由序列表中序列67所示的單鏈DNA分子和序列表中序列68所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs662799的擴增引物35)由序列表中序列69所示的單鏈DNA分子和序列表中序列70所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs3755724的擴增引物36)由序列表中序列71所示的單鏈DNA分子和序列表中序列72所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs328的擴增引物37)由序列表中序列73所示的單鏈DNA分子和序列表中序列74所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1042713的擴增引物38)由序列表中序列75所示的單鏈DNA分子和序列表中序列76所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs283的擴增引物39)由序列表中序列77所示的單鏈DNA分子和序列表中序列78所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1801282的擴增引物40)由序列表中序列79所示的單鏈DNA分子和序列表中序列80所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs1052700的擴增引物41)由序列表中序列81所示的單鏈DNA分子和序列表中序列82所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs7498665的擴增引物42)由序列表中序列83所示的單鏈DNA分子和序列表中序列84所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs2289487的擴增引物43)由序列表中序列85所示的單鏈DNA分子和序列表中序列86所示的單鏈DNA分子組成；

所述用于檢測rs2304795的擴增引物44)由序列表中序列87所示的單鏈DNA分子和序列表中序列88所示的單鏈DNA分子組成；

所述引物1)還包括用于檢測rs854560的單堿基延伸引物1)；

所述引物2)還包括用于檢測rs9939609的單堿基延伸引物2)；

所述引物3)還包括用于檢測rs2943641的單堿基延伸引物3)；

所述引物4)還包括用于檢測rs1049353的單堿基延伸引物4)；

所述引物5)還包括用于檢測rs662的單堿基延伸引物5)；

所述引物6)還包括用于檢測rs3808607的單堿基延伸引物6)；

所述引物7)還包括用于檢測rs1799983的單堿基延伸引物7)；

所述引物8)還包括用于檢測rs12691的單堿基延伸引物8)；

所述引物9)還包括用于檢測rs4994的單堿基延伸引物9)；

所述引物10)還包括用于檢測rs182052的單堿基延伸引物10)；

所述引物11)還包括用于檢測rs1805094的單堿基延伸引物11)；

所述引物12)還包括用于檢測rs1800629的單堿基延伸引物12)；

所述引物13)還包括用于檢測rs324420的單堿基延伸引物13)；

所述引物14)還包括用于檢測rs5110的單堿基延伸引物14)；

所述引物15)還包括用于檢測rs708272的單堿基延伸引物15)；

所述引物16)還包括用于檢測rs675的單堿基延伸引物16)；

所述引物17)還包括用于檢測rs16147的單堿基延伸引物17)；

所述引物18)還包括用于檢測rs1800497的單堿基延伸引物18)；

所述引物19)還包括用于檢測rs2241766的單堿基延伸引物19)；

所述引物20)還包括用于檢測rs12785878的單堿基延伸引物20)；

所述引物21)還包括用于檢測rs135569的單堿基延伸引物21)；

所述引物22)還包括用于檢測rs693的單堿基延伸引物22)；

所述引物23)還包括用于檢測rs1800849的單堿基延伸引物23)；

所述引物24)還包括用于檢測rs6720173的單堿基延伸引物24)；

所述引物25)還包括用于檢測rs6923761的單堿基延伸引物25)；

所述引物26)還包括用于檢測rs429358的單堿基延伸引物26)；

所述引物27)還包括用于檢測rs1132896的單堿基延伸引物27)；

所述引物28)還包括用于檢測rs5219的單堿基延伸引物28)；

所述引物29)還包括用于檢測rs1695的單堿基延伸引物29)；

所述引物30)還包括用于檢測rs7566605的單堿基延伸引物30)；

所述引物31)還包括用于檢測rs1042714的單堿基延伸引物31)；

所述引物32)還包括用于檢測rs894160的單堿基延伸引物32)；

所述引物33)還包括用于檢測rs7412的單堿基延伸引物33)；

所述引物34)還包括用于檢測rs8050136的單堿基延伸引物34)；

所述引物35)還包括用于檢測rs662799的單堿基延伸引物35)；

所述引物36)還包括用于檢測rs3755724的單堿基延伸引物36)；

所述引物37)還包括用于檢測rs328的單堿基延伸引物37)；

所述引物38)還包括用于檢測rs1042713的單堿基延伸引物38)；

所述引物39)還包括用于檢測rs283的單堿基延伸引物39)；

所述引物40)還包括用于檢測rs1801282的單堿基延伸引物40)；

所述引物41)還包括用于檢測rs1052700的單堿基延伸引物41)；

所述引物42)還包括用于檢測rs7498665的單堿基延伸引物42)；

所述引物43)還包括用于檢測rs2289487的單堿基延伸引物43)；

所述引物44)還包括用于檢測rs2304795的單堿基延伸引物44)；

所述用于檢測rs854560單堿基延伸引物1)為序列表中序列89所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs9939609單堿基延伸引物2)為序列表中序列90所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs2943641單堿基延伸引物3)為序列表中序列91所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1049353單堿基延伸引物4)為序列表中序列92所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs662單堿基延伸引物5)為序列表中序列93所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs3808607單堿基延伸引物6)為序列表中序列94所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1799983單堿基延伸引物7)為序列表中序列95所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs12691單堿基延伸引物8)為序列表中序列96所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs4994單堿基延伸引物9)為序列表中序列97所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs182052單堿基延伸引物10)為序列表中序列98所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1805094單堿基延伸引物11)為序列表中序列99所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1800629單堿基延伸引物12)為序列表中序列100所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs324420單堿基延伸引物13)為序列表中序列101所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs5110單堿基延伸引物14)為序列表中序列102所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs708272單堿基延伸引物15)為序列表中序列103所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs675單堿基延伸引物16)為序列表中序列104所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs16147單堿基延伸引物17)為序列表中序列105所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1800497單堿基延伸引物18)為序列表中序列106所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs2241766單堿基延伸引物19)為序列表中序列107所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs12785878單堿基延伸引物20)為序列表中序列108所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs135569單堿基延伸引物21)為序列表中序列109所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs693單堿基延伸引物22)為序列表中序列110所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1800849單堿基延伸引物23)為序列表中序列111所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs6720173單堿基延伸引物24)為序列表中序列112所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs6923761單堿基延伸引物25)為序列表中序列113所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs429358單堿基延伸引物26)為序列表中序列114所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1132896單堿基延伸引物27)為序列表中序列115所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs5219單堿基延伸引物28)為序列表中序列116所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1695單堿基延伸引物29)為序列表中序列117所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs7566605單堿基延伸引物30)為序列表中序列118所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1042714單堿基延伸引物31)為序列表中序列119所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs894160單堿基延伸引物32)為序列表中序列120所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs7412單堿基延伸引物33)為序列表中序列121所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs8050136單堿基延伸引物34)為序列表中序列122所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs662799單堿基延伸引物35)為序列表中序列123所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs3755724單堿基延伸引物36)為序列表中序列124所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs328單堿基延伸引物37)為序列表中序列125所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1042713單堿基延伸引物38)為序列表中序列126所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs283單堿基延伸引物39)為序列表中序列127所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1801282單堿基延伸引物40)為序列表中序列128所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs1052700單堿基延伸引物41)為序列表中序列129所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs7498665單堿基延伸引物42)為序列表中序列130所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs2289487單堿基延伸引物43)為序列表中序列131所示的單鏈DNA分子；

所述用于檢測rs2304795單堿基延伸引物44)為序列表中序列132所示的單鏈DNA分子。