[發明專利]與大口黑鱸北方亞種和佛羅里達亞種鑒定相關的SNP標記及其應用有效
| 申請號： | 202010065650.X | 申請日： | 2020-01-20 |
| 公開（公告）號： | CN111073983B | 公開（公告）日： | 2020-11-24 |
| 發明（設計）人： | 李勝杰;杜金星;姜鵬;白俊杰;韓林強;梁健輝 | 申請（專利權）人： | 中國水產科學研究院珠江水產研究所;廣東梁氏水產種業有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6888 | 分類號： | C12Q1/6888;C12N15/12 |
| 代理公司： | 廣州嘉權專利商標事務所有限公司 44205 | 代理人： | 許飛 |
| 地址： | 510380 廣*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 大口 北方 佛羅里達 鑒定 相關 snp 標記 及其 應用 | ||
1.SNP位點或插入缺失突變位點在鑒定大口黑鱸亞種中的應用，其特征在于，所述SNP位點位于NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1所示的第202位，第202位K為堿基G或T；所述插入缺失突變位點位于NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1所示的第76位和第132-133位；
所述大口黑鱸亞種為大口黑鱸北方亞種和佛羅里達亞種；
當大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第76位堿基處的SNP位點為AA或-- 基因型，其中“-”表示堿基缺失，若是“--”，則為佛羅里達亞種，若是AA，則為北方亞種；
或/和，當大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第132-133位堿基處的SNP位點為AAAA或---- 基因型，其中“----”表示堿基缺失，若是AAAA，則為佛羅里達亞種；若是“----”，則為北方亞種；
或/和，當大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第202位堿基處的SNP位點為GG或TT基因型，若是GG，則為佛羅里達亞種，若是TT，則為北方亞種。
2.一種鑒定大口黑鱸北方亞種和佛羅里達亞種的方法，其特征在于，包括以下步驟：
檢測大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第76位堿基處的SNP位點為AA或--基因型，其中“-”表示堿基缺失，若是“--”，則為佛羅里達亞種，若是AA，則為北方亞種；
或/和，檢測大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第132-133位堿基處的SNP位點為AAAA或---- 基因型，其中“----”表示堿基缺失，若是AAAA，則為佛羅里達亞種；若是“----”，則為北方亞種；
或/和，檢測大口黑鱸NCCRP-1基因組序列SEQ ID NO:1的第202位堿基處的SNP位點為GG或TT基因型，若是GG，則為佛羅里達亞種，若是TT，則為北方亞種，第202位K為堿基G或T。
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