[發明專利]創傷弧菌的核酸快速恒溫檢測方法及應用有效
| 申請號: | 202010042443.2 | 申請日: | 2016-08-30 |
| 公開(公告)號: | CN111057778B | 公開(公告)日: | 2022-07-26 |
| 發明(設計)人: | 曹永梅;李雪玲;李園園;韋朝春;劉偉;賈犇;陸長德;李亦學 | 申請(專利權)人: | 上海旺旺食品集團有限公司;上海產業技術研究院 |
| 主分類號: | C12Q1/689 | 分類號: | C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/63 |
| 代理公司: | 上海麥其知識產權代理事務所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董紅曼 |
| 地址: | 201103 上海市*** | 國省代碼: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索關鍵詞: | 創傷 弧菌 核酸 快速 恒溫 檢測 方法 應用 | ||
1.一種非診斷性目的的針對創傷弧菌的恒溫檢測方法,其特征在于,包括以下步驟:
(1)從待測樣品中提取基因組DNA;
(2)以所述基因組DNA為模板,以能擴增創傷弧菌基因組特異性堿基序列的引物組作為引物,在酶反應體系下進行恒溫擴增反應;
(3)通過判斷反應結果是否為陽性,確定待測樣品中是否存在創傷弧菌;
其中,所述創傷弧菌基因組特異性堿基序列為GI號為320154846的創傷弧菌基因組的112393~113296 bp位序列;
其中,所述能擴增創傷弧菌基因組特異性堿基序列的引物組選自引物組D;
引物組D:
上游外引物F3_D:5’-CAAGTGGAAGTGTATCACC-3’(SEQ ID NO:13);
下游外引物B3_D:5’-GGAATAATGTACGACTCCTG-3’(SEQ ID NO:14);
上游內引物FIP_D:5’-ATGCTTGTCGTCTTTCACCGCTCTAAAGATGAGATGATCGC-3’(SEQ IDNO:15);
下游內引物BIP_D:5’-GTTGCCTCGAAATGCATTAACTCTCTTGCGGATGAATGATT-3’(SEQ IDNO:16)。
2.如權利要求1所述的方法,其特征在于,步驟(2)中,所述酶反應體系包括:1× BstDNA聚合酶反應緩沖液,2-9mmol/L Mg2+,1.0-1.6mmol/L dNTP,0.8-2.0μmol/L的如權利要求1中所述的FIP_D和BIP_D引物,0.15-0.3μmol/L的如權利要求1中所述的F3_D和B3_D引物,0.16-0.64U/μL Bst DNA聚合酶,0-1.5mol/L的甜菜堿。
3.如權利要求1所述的方法,其特征在于,所述恒溫擴增反應的反應程序為:① 60~65℃孵育10~90min;② 80℃終止反應2~20min。
4.用于針對創傷弧菌的恒溫檢測的引物,其特征在于,所述引物包括能擴增創傷弧菌基因組特異性堿基序列的引物組,其序列為GI號為320154846的創傷弧菌基因組的112393~113296 bp位的核酸序列的一部分或其互補鏈的一部分;
其中,所述能擴增創傷弧菌基因組特異性堿基序列的引物組選自引物組D;
引物組D:
上游外引物F3_D:5’-CAAGTGGAAGTGTATCACC-3’(SEQ ID NO:13);
下游外引物B3_D:5’-GGAATAATGTACGACTCCTG-3’(SEQ ID NO:14);
上游內引物FIP_D:5’-ATGCTTGTCGTCTTTCACCGCTCTAAAGATGAGATGATCGC-3’(SEQ IDNO:15);
下游內引物BIP_D:5’-GTTGCCTCGAAATGCATTAACTCTCTTGCGGATGAATGATT-3’(SEQ IDNO:16)。
5.一種針對創傷弧菌的恒溫檢測試劑盒,其特征在于,所述試劑盒包括如權利要求4所述的引物。
6.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,其還包括Bst DNA聚合酶反應緩沖液、BstDNA聚合酶、dNTP 溶液、Mg2+、甜菜堿中的一種或多種。
7.如權利要求5所述的試劑盒,其特征在于,所述試劑盒的酶反應體系包括:1× BstDNA聚合酶反應緩沖液,2-9mmol/L Mg2+,1.0-1.6mmol/L dNTP,0.8-2.0μmol/L的FIP_D和BIP_D引物,0.15-0.3μmol/L的F3_D和B3_D引物,0.16-0.64U/μL Bst DNA聚合酶,和0-1.5mol/L的甜菜堿。
8.引物在非診斷目的的恒溫檢測創傷弧菌中的應用,其特征在于,所述引物為如權利要求 4所述的引物。
9.如權利要求5~7之任一項所述的試劑盒在非診斷目的的恒溫檢測創傷弧菌中的應用。
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