[發(fā)明專利]非診斷治療目的的多個腫瘤相關(guān)基因的檢測方法有效
| 申請?zhí)枺?/td> | 202010031664.X | 申請日： | 2018-12-24 |
| 公開（公告）號： | CN111187810B | 公開（公告）日： | 2020-09-29 |
| 發(fā)明（設計）人： | 許明炎;陳實富;張曉妮;屈宏越 | 申請（專利權(quán)）人： | 深圳市海普洛斯生物科技有限公司 |
| 主分類號： | C12Q1/6869 | 分類號： | C12Q1/6869;C12Q1/6886;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 深圳舍穆專利代理事務所(特殊普通合伙) 44398 | 代理人： | 黃賢炬 |
| 地址： | 518000 廣東省深圳市南山區(qū)高*** | 國省代碼： | 廣東;44 |
| 權(quán)利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關(guān)鍵詞： | 診斷 治療 目的 腫瘤 相關(guān) 基因 檢測 方法 | ||
1.一種非診斷治療目的的多個腫瘤相關(guān)基因的檢測方法，其特征在于，
包括：
(a)從樣本中提取DNA；
(b)基于步驟(a)的DNA構(gòu)建DNA文庫；
(c)將所述DNA文庫與特制的探針庫進行雜交，并對雜交后的文庫進行純化，
其中，所述特制的探針庫包括針對與多種腫瘤治療相關(guān)的多個基因而設計的多條捕獲探針，所述多條捕獲探針的3’端具有生物素的標記，所述生物素的標記配置在3’端末端倒數(shù)的第1位至第5位的任意一個位置，
所述多條捕獲探針為序列SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:19；并且
(d)將步驟(c)所獲得的DNA結(jié)果進行測序，檢測基因變異。
2.如權(quán)利要求1所述的檢測方法，其特征在于，
在步驟(b)中，對從步驟(a)所提取的DNA進行片段化，并且將片段化后的DNA片段進行末端修復和加A尾，連接測序接頭并進行純化，從而進行PCR擴增以獲得所述DNA文庫。
3.如權(quán)利要求1所述的檢測方法，其特征在于，
所述樣本為人源樣本。
4.如權(quán)利要求1所述的檢測方法，其特征在于，
在步驟(c)中，利用親和素處理的磁珠對雜交后的文庫進行純化。
5.如權(quán)利要求1所述的檢測方法，其特征在于，
在步驟(d)中，對所述測序的結(jié)果進行數(shù)據(jù)分析，以檢測基因變異，所述數(shù)據(jù)分析包括對所述測序的結(jié)果去除不合格數(shù)據(jù)、并且對去除后的數(shù)據(jù)結(jié)果進行剪裁，所述不合格數(shù)據(jù)包括映射質(zhì)量(mapping quality)小于或等于Q10的數(shù)據(jù)和連續(xù)20個以上相同堿基的polyN數(shù)據(jù)。
6.如權(quán)利要求2所述的檢測方法，其特征在于，
在步驟(b)中，采用片段化酶或超聲波破碎儀對從步驟(a)所提取的DNA進行片段化。
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