[發(fā)明專利]一種引物探針組合物及檢測(cè)方法和用途

在審

• 申請(qǐng)?zhí)枺?/td>: 202010031581.0
• 申請(qǐng)日: 2020-01-13
• 公開(kāi)（公告）號(hào): CN111118140A
• 公開(kāi)（公告）日: 2020-05-08
• 發(fā)明（設(shè)計(jì)）人: 蔡燕寧;張陸明
• 申請(qǐng)（專利權(quán)）人: 首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院
• 主分類號(hào): C12Q1/6883
• 分類號(hào): C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11
• 代理公司: 北京精金石知識(shí)產(chǎn)權(quán)代理有限公司 11470
• 代理人: 宋秀蘭

1.一種引物探針組合物，其特征在于，所述引物的核苷酸序列包括：SEQ ID NO.1-2和SEQ ID NO.7-8中的至少兩種，所述探針的核苷酸序列包括：SEQ ID NO.3-6和SEQ IDNO.9-12中的至少兩種。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的引物探針組合物，其特征在于，所述引物探針組合物包括：SEQID NO.1-4組合，SEQ ID NO.1-2和SEQ ID NO.5-6組合，SEQ ID NO.7-10組合，SEQ IDNO.7-8和SEQ ID NO.11-12組合中的至少一個(gè)組合。

3.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的引物探針組合物，其特征在于，所述探針的5’端標(biāo)記有熒光報(bào)告基團(tuán)，所述探針的3’端標(biāo)記有淬滅基團(tuán)；優(yōu)選地，所述熒光報(bào)告基團(tuán)為FAM、HEX、VIC、JOE和ROX中的至少一種，所述淬滅基團(tuán)為NFQ-MGB基團(tuán)。

4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的引物探針組合物，其特征在于，所述引物探針組合物包括：

1)用于CpG島位置1甲基化水平檢測(cè)的引物探針組合：

SEQ ID NO.1：5’-ATGAAATGGAAGTGTAAGGAGG-3’，

SEQ ID NO.2：5’-ACCCTCAACTATCTACCCTAAAC-3’，

SEQ ID NO.3：5’-CTTATTAACCCGTTACC-3’，

SEQ ID NO.4：5’-TATTAACCCATTACCAC-3’；

2)用于CpG島位置2甲基化水平檢測(cè)的引物探針組合：

引物：SEQ ID NO.1：5’-ATGAAATGGAAGTGTAAGGAGG-3’，

SEQ ID NO.2：5’-ACCCTCAACTATCTACCCTAAAC-3’，

SEQ ID NO.5：5’-TCACACTCGCGAAC-3’，

SEQ ID NO.6：5’-CTCACACTCACAAACC-3’；

3)用于CpG島位置3甲基化水平檢測(cè)的引物探針組合：

SEQ ID NO.7：5’-GTGTAAGGAGGTTAAGTTAATAGGT-3’，

SEQ ID NO.8：5’-CCCACCCTCAACTATCTACC-3’，

SEQ ID NO.9：5’-CCCGCGCCAACAC-3’，

SEQ ID NO.10：5’-CCCACACCAACACT-3’；

4)用于CpG島位置4甲基化水平檢測(cè)的引物探針組合：

SEQ ID NO.7：5’-GTGTAAGGAGGTTAAGTTAATAGGT-3’，

SEQ ID NO.8：5’-CCCACCCTCAACTATCTACC-3’，

SEQ ID NO.11：5’-AACGCCGCTCACA-3’，

SEQ ID NO.12：5’-AACACCACTCACACTC-3’；

所述位置1-4在4號(hào)染色體SNCA基因啟動(dòng)子或第一外顯子區(qū)域。

5.權(quán)利要求1-4任意一項(xiàng)所述的引物探針組合物在制備用于檢測(cè)SNCA基因DNA甲基化水平的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

6.權(quán)利要求1-4任意一項(xiàng)所述的引物探針組合物在制備用于診斷或監(jiān)測(cè)帕金森病及其相關(guān)疾病的產(chǎn)品中的應(yīng)用。

7.一種檢測(cè)SNCA基因DNA甲基化水平的試劑盒，其特征在于，包括權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述的引物探針組合物。

8.一種檢測(cè)帕金森病及其相關(guān)疾病的試劑盒，其特征在于，包括權(quán)利要求1-4任一項(xiàng)所述的引物探針組合物。