[發明專利]一種標記黃瓜果形基因的引物、基因序列、黃瓜果形的檢測方法及應用

在審

• 申請號: 202010026358.7
• 申請日: 2020-01-10
• 公開（公告）號: CN111440791A
• 公開（公告）日: 2020-07-24
• 發明（設計）人: 潘玉朋;孟煥文;程智慧
• 申請（專利權）人: 西北農林科技大學
• 主分類號: C12N15/11
• 分類號: C12N15/11;C12Q1/6895
• 代理公司: 西安恒泰知識產權代理事務所 61216
• 代理人: 孫雅靜

本發明公開了一種標記黃瓜果形基因的引物、基因序列、黃瓜果形的檢測方法及應用，引物具體為：CsSun?Indel_F:5’?GAAATCCTTCTACTCCGAAACAGA?3’；CsSun?Indel_R:5’?TTCCTCGCCTAATTTCACCAA?3’。分子標記CsSun?Indel與黃瓜果形調控基因CsSUN共分離，利用該分子標記來檢測判斷黃瓜長果形和短果形性狀。該標記可直接用于黃瓜果形遺傳改良的分子標記輔助選擇，鑒于分子標記在輔助育種體系中具有簡便、快捷和高通量的優勢，因此本申請所提供的分子標記在黃瓜果形遺傳改良中具有較好的應用價值。

技術領域

本發明屬于黃瓜遺傳育種技術領域，具體涉及一種標記黃瓜果形基因的引物、基因 序列、黃瓜果形的檢測方法及應用。

背景技術

黃瓜是我國主要蔬菜作物之一，具有極高的社會價值和經濟效益。果實形態是黃瓜 重要的商品性狀，由果實縱徑和橫徑決定，是衡量其外觀品質的重要指標，鑒于用途和食用習慣的不同，人們對黃瓜果形的要求差異極大。不同消費市場對黃瓜果形的要求各 異(Weng et al.2015)。因此進行黃瓜果實形態的遺傳改良，針對不同消費市場需求，選 育果形多樣化的優良品種具有重要意義(Meng et al.2012；潘玉朋2013)。

果實形狀是黃瓜品種遺傳改良的重要品質和產量性狀。野生黃瓜C.sativus var.hardwickii的果實通常為圓形或球形且很小(其果長和橫徑僅為3-5cm)，而栽培黃瓜通 常大很多，且其果實大小、重量和形狀具有豐富的多樣性。由于不同區域的消費習慣和 加工需求，不同果形的黃瓜被不同的消費市場所青睞。譬如，華北鮮食類型其最佳果形 要求長度達25到30cm，寬度在2.5至3.0cm左右(Zhou et al.2005)；對于美國腌漬加 工型其理想果實的果形指數為2.8-3.0(Kennard and Havey 1995)；小型水果黃瓜，果實 橫徑2.0-2.5cm，長度13-15cm的為最佳(Weng et al.2015)。

黃瓜果形，常以果形指數(長寬比)來進行衡量，由果實縱徑和橫徑決定，具有數量遺傳的特性。鑒于果形對于黃瓜的重要性，為揭示其內在的遺傳調控機制，已有相關 QTL定位的若干報道(王敏等2014；Miao et al.2011；Bo et al.2015；Weng et al.2015； Zhuet al.2016；Pan et al.2017；Che and Zhang 2019)。目前，已知與黃瓜果實形態相關 的QTL位點多達19個(Pan et al.2019)，但尚無相關QTL位點克隆到候選基因的報道。 圖位克隆相關QTL位點，獲得調控黃瓜果形的目標基因，并基于目標基因開發緊密連 鎖的分子標記，對分子標記輔助選擇的黃瓜果實形態的遺傳改良具有重要實踐意義。

基于該目的，本發明通過構建近等基因系和基于近等基因系的F_2:3分離群體，圖位克隆獲得黃瓜果形調控QTL位點CsFS1.2的內在調控基因CsSUN。測序結果表明， CsSUN基因在短果形黃瓜親本中具有161bp的大片段缺失，利用該差異片段，本發明開 發了與黃瓜果形調控基因CsSUN共分離的分子標記CsSun-Indel，用于黃瓜果實形態遺 傳改良的分子標記輔助選擇。

發明內容

本發明的目的是提供一種標記黃瓜果形基因的引物、基因序列、黃瓜果形的檢測方 法及應用。為利用分子標記輔助選擇，進行黃瓜果形的遺傳改良奠定基礎。

本申請所采取的技術方案詳述如下。

一種標記黃瓜果形基因的引物，引物具體為：

CsSun-Indel_F:5’-GAAATCCTTCTACTCCGAAACAGA-3’；

CsSun-Indel_R:5’-TTCCTCGCCTAATTTCACCAA-3’。

一種黃瓜果形的檢測方法，其特征在于，利用上述標記黃瓜果形基因的引物。