[發明專利]用于臨床癌癥評估的SRM和DIA測定法在審
| 申請號： | 202010024974.9 | 申請日： | 2020-01-10 |
| 公開（公告）號： | CN111435130A | 公開（公告）日： | 2020-07-21 |
| 發明（設計）人： | 托德·A·哈姆布拉夫;法比奧拉·切基;K·M·斯科特 | 申請（專利權）人： | 南坦生物組學有限責任公司 |
| 主分類號： | G01N30/06 | 分類號： | G01N30/06;G01N30/72;G01N30/88 |
| 代理公司： | 北京潤平知識產權代理有限公司 11283 | 代理人： | 喬雪微;劉依云 |
| 地址： | 美國加利*** | 國省代碼： | 暫無信息 |
| 權利要求書： | 查看更多 | 說明書： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索關鍵詞： | 用于 臨床 癌癥 評估 srm dia 測定法 | ||
1.一種用于測量福爾馬林固定組織的生物樣品中蛋白質的含量的方法，該方法包括：
使用質譜分析檢測和/或定量從所述生物樣品制備的蛋白質消化物中源自所述蛋白質的一種或多種片段肽的含量；和計算所述樣品中所述蛋白質的含量；
其中，所述蛋白質選自由CBL、FPGS、HSP90A、HSP90B、INSR、MCL1和TrkA組成的組。
2.根據權利要求1所述的方法，其中，該方法還包括在檢測和/或定量所述一種或多種片段肽之前對所述蛋白質消化物進行分級的步驟。
3.根據權利要求2所述的方法，其中，所述分級的步驟選自由凝膠電泳、液相色譜、毛細管電泳、納米反相液相色譜、高效液相色譜法和反相高效液相色譜法組成的組。
4.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，所述蛋白質消化物包含蛋白酶消化物，優選胰蛋白酶消化物。
5.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，所述質譜分析包括串聯質譜分析、離子阱質譜分析、三重四極桿質譜分析、離子阱/四極桿混合質譜分析、MALDI-TOF質譜分析、MALDI質譜分析和/或飛行時間質譜分析。
6.根據權利要求5所述的方法，其中，所使用的質譜分析模式是選擇反應監測(SRM)、多重反應監測(MRM)和/或多重選擇反應監測(mSRM)。
7.根據權利要求6所述的方法，其中，所使用的質譜的模式是數據無關采集(DIA)。
8.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，
所述蛋白質是CBL，所述片段肽是SEQ ID NO：1所示的肽；
所述蛋白質是FPGS，所述片段肽是SEQ ID NO：2所示的肽；
所述蛋白質是HSP90A，所述片段肽是SEQ ID NO：3所示的肽；
所述蛋白質是HSP90B，所述片段肽是SEQ ID NO：4所示的肽；
所述蛋白質是INSR，所述片段肽是SEQ ID NO：5所示的肽；
所述蛋白質是MCL1，所述片段肽是SEQ ID NO：6所示的肽；和/或
所述蛋白質是TrkA，所述片段肽是SEQ ID NO：7所示的肽。
9.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，所述組織是石蠟包埋的組織。
10.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，所述組織獲自腫瘤，例如為原發性腫瘤或繼發性腫瘤。
11.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，定量所述一種或多種片段肽包括將所述生物樣品中所述一種或多種片段肽的含量與不同且單獨的生物樣品中相同的一種或多種片段肽的含量進行比較。
12.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，定量所述一種或多種片段肽包括通過與添加的具有相同氨基酸序列的已知量的內標肽比較來確定生物樣品中所述一種或多種片段肽的含量。
13.根據權利要求12所述的方法，其中，所述內標肽為同位素標記的肽，所述同位素標記的肽選自18O、17O、34S、15N、13C和2H以及它們的組合標記的肽。
14.根據前述權利要求中任一項所述的方法，其中，檢測和/或定量所述蛋白質消化物中所述一種或多種片段肽的含量指示相應蛋白質的存在以及與受試者中癌癥的診斷階段/等級/狀況的關聯。
該專利技術資料僅供研究查看技術是否侵權等信息，商用須獲得專利權人授權。該專利全部權利屬于南坦生物組學有限責任公司，未經南坦生物組學有限責任公司許可，擅自商用是侵權行為。如果您想購買此專利、獲得商業授權和技術合作，請聯系【客服】
本文鏈接：http://www.szxzyx.cn/pat/books/202010024974.9/1.html，轉載請聲明來源鉆瓜專利網。
