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[發(fā)明專利]檢測新城疫病毒的引物和探針組合以及試劑盒和檢測方法在審

專利信息
申請?zhí)枺?/td> 202010013561.0 申請日: 2020-01-07
公開(公告)號: CN111118212A 公開(公告)日: 2020-05-08
發(fā)明(設(shè)計)人: 王春光;王文靜;張鐵;翟向和;李希明;曹立輝;白云;徐瑞濤 申請(專利權(quán))人: 河北農(nóng)業(yè)大學
主分類號: C12Q1/70 分類號: C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11
代理公司: 石家莊國為知識產(chǎn)權(quán)事務(wù)所 13120 代理人: 陳曉彥
地址: 071000 河北省保定市樂凱*** 國省代碼: 河北;13
權(quán)利要求書: 查看更多 說明書: 查看更多
摘要:
搜索關(guān)鍵詞: 檢測 新城 疫病 引物 探針 組合 以及 試劑盒 方法
【說明書】:

發(fā)明涉及病毒檢測技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及檢測新城疫病毒的引物和探針組合以及試劑盒和檢測方法。含有新城疫病毒RNA片段的待測物通過利用該引物和探針可通過反轉(zhuǎn)錄重組酶介導等溫核酸擴增技術(shù)在等溫條件下進行大量擴增,操作簡單,所需時間短,特異性好、靈敏度高的優(yōu)點。

技術(shù)領(lǐng)域

本發(fā)明涉及病毒檢測技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及檢測新城疫病毒的引物和探針組合以及試劑盒和檢測方法。

背景技術(shù)

新城疫(Newcastle Disease,ND)又名偽雞瘟,是由新城疫病毒(NDV)感染引起的以消化道和呼吸道為主要傳播途徑的一種禽類急性、高度接觸性傳染病,傳播速度快,一年四季均可發(fā)病,對世界范圍內(nèi)的禽類養(yǎng)殖業(yè)危害極大。NDV主要感染禽類,一般雞最常見,雛雞最易感。患病雞臨床表現(xiàn)為體溫上升、呼吸急促、咳嗽、排黃綠色甚至灰白色水樣糞便,產(chǎn)蛋雞產(chǎn)蛋率下降,軟殼蛋比例增加,即使恢復后也會對雞的生長發(fā)育有影響,因此給養(yǎng)殖業(yè)帶來嚴重的經(jīng)濟損失。

ND的臨床癥狀與低致病性禽流感、傳染性喉氣管炎、傳染性支氣管炎等相似,都表現(xiàn)為呼吸困難,臨床診斷容易混淆。目前,國內(nèi)外已經(jīng)建立多種NDV檢測方法,血清學的方法包括血凝血抑試驗、瓊脂擴散試驗、中和試驗、免疫熒光試驗、免疫組化技術(shù)、酶聯(lián)免疫吸附試驗等,分子生物學診斷方法包括:常規(guī)PCR、實時熒光定量PCR(RFQ-PCR)、環(huán)介導等溫核酸擴增技術(shù)等。其中,以PCR和RFQ-PCR是最常規(guī)的臨床檢測方法,但二者均需要昂貴的PCR儀,且所需的檢測時間較長,對操作人員有較高的技術(shù)要求。

發(fā)明內(nèi)容

針對現(xiàn)有PCR和RFQ-PCR所需的檢測時間較長、對操作人員技術(shù)要求較高的問題,本發(fā)明提供了用于檢測新城疫病毒的引物和探針組合。

以及,本發(fā)明還提供了一種檢測新城疫病毒的試劑盒。

以及,本發(fā)明還提供了檢測新城疫病毒的方法。

為達到上述發(fā)明目的,本發(fā)明實施例采用了如下的技術(shù)方案:

用于檢測新城疫病毒的引物和探針組合,所述引物的序列(如SEQ ID NO.1~2所示)為:

上游引物:5′-ACGTCTTTATTACTCCTGAGCTTGTCATTGTGA-3′;

下游引物:5′-TGATTACCTAAGTCCTTTGCCAGAGCATCTACT-3′;

所述探針的序列(如SEQ ID NO.3所示)為:5′-AAGTTCACATGCCTCACCCAGGAACTTGTA-THF-TGATGTATGCGGATA-3′。

含有新城疫病毒RNA片段的待測物利用上述引物可通過反轉(zhuǎn)錄重組酶介導等溫核酸擴增技術(shù)(RT-RAA)在等溫條件下進行大量擴增,不需對NDV模板反轉(zhuǎn)錄,操作簡單,在23min內(nèi)即可完成目的基因片段的擴增。其最低檢測限可達到100拷貝/μL,是常規(guī)PCR法(103拷貝/μL)靈敏度的10倍。同時對其他類癥禽病病原體核酸無交叉反應(yīng),表現(xiàn)良好特異性。

其探針基于上述下游引物而設(shè)計,探針上距離5′端30bp位置有一個堿基缺口,并以四氫呋喃(THF)殘基修飾(SEQ ID NO.3中R即為THF),當探針為單鏈時核酸內(nèi)切酶不識別,只有當探針和上述引物擴增所得的擴增產(chǎn)物中的目的片段結(jié)合后核酸內(nèi)切酶才開始工作,從而可提高該檢測方法的特異性,使其他病毒對檢測結(jié)果無干擾。

以及,本發(fā)明實施例還提供了一種檢測新城疫病毒的試劑盒,包含上述引物和探針組合。使用該試劑盒進行新城疫病毒的檢測對檢測設(shè)備和操作人員要求低,操作簡便,檢測成本低,并具有特異性好、靈敏度高的優(yōu)點。

優(yōu)選地,所述探針5′端以熒光基團修飾,所述下游引物的5′端以生物素修飾,擴增完成后可通過側(cè)向流試紙條進行現(xiàn)場檢測,從而能夠簡便、快捷地診斷新城疫病毒。

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